SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.09g245000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm09
Start:47109312
stop:47116095
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.09g245000
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G44710.1AT JGI N/AIEA
GO:0003676GO-mf nucleic acid binding JGI N/AIEA
KOG0117 KOG Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R (RRM superfamily) JGI N/AIEA
PTHR24012PantherFam RNA BINDING PROTEIN JGI N/AIEA
PF00076Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.09g245000 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma09g38020 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.09g245000
>Glyma.09g245000.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g245000.1.p locus=Glyma.09g245000 id=Glyma.09g245000.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCCTCCGAGAATAGTGAAGAGAGGTGCTGCGGCGAAGAGGGCATCGAGGGGATCCTCAAAGGCTGCTCCTGAGAATCAACCTGAGCCTGAAACTGCGGAAGTGGTCGTGAAAAATAATGAAGAAAATCCTGTTGTTGATGCTGTGGTGGAAGAAAAGCCCGTTGATGTGGAGCAAGAACATGAGGAAGTGCCAAATGGGTCGGCTAAGGTGGAAAACAATGAAGAGGAGATTAAGGAGTCTATAGATGAATATGAAAAAGATGAACACTTAGATTTTGAGGATAATTATCCTGAGTATGAAGCAGAGGAATATGGTGGTGTTGACTATGATGAGAAGGAAATTGAACAAGATGAAGGTCAGGAGGAGGGAGATGAAGTCGAGGAAGATCCCGAAGAGATTGTAGGTGAAGAAGAGGGTGATACAGGTGATGAAGAAGTTGAATATGTTTATGAAGAAGTTGAGGATGATGATGATGAGCATGCTGGTGAGGAGCATGAGCATGCACAGATGCCTGATGTGGAGCAAGAGGAACACCGTGAAGTGGTAAAGGAGAGGCGAAAGCGGAAGGAATTTGAAGTATTTGTTGGTGGCCTAGATAAGGATGCTACTGAGCATGATCTGAAAAAGGTTTTCGGTAAAGTTGGGGTAGTTACTGAAGTCCGGCTGATGATAAATCCCCAGACAAAAAGGAACAAGGGATTTGCATTCTTGCGTTTTGAAACGGTTGAGCAAGCGAGAAGAGCTGTGGTGGAGCTAAAAAATCCTGTGATTAATGGCAAACGATGTGGTGTTACTCCAAGTCAGGACAGTGATACTCTCTACTTAGGTAACATATGCAAGACATGGAAAAAGGAAGCTTTAAAGGAGAAACTTAAACATTATGGAGTAGAAGATGTGGAGGATTTGACTTTAATAGAAGATGATACCAATGAGGGGATGAACCGAGGATTTGCATTTTTGGAGTTTTCTTCTCGTTCAGATGCTAAGGAAGCCTATAAGCGACTGCAGAAGAGAGATGTTGCATTTGGAGTTGATAAGCCTGCAAAGGTTTCCTTTGCCGACTCTTTTATTGATCTGGGTGATGAAATTATGGCACAGGTTAAAACTGTATTTATTGATTCGCTGCCTCCTTCATGGAATGAAGATTATGTCCGAGATCTTCTTAAGAAATATGGAGAGATTGAAAAAGTTGAGCTTGCTAAGGACATGCCAGCTGCTCGGAGGAAGAATTATGGATTTGTTACATTTAGTACACATGTTGCTGCTGTGGAATGTGCTGATAGCATTACTAGTGCAGGGTTAGGTGAAGGTGACAAAAAGGCAAAAGTTAGGGCTAGATTGTCACGGCCTCTTTCAAAACCTCTTCAGAGAGGCCGTGGAAAATATGTTAATCATGGGGACTTCCGCTCTGGCCGCAATTCTGGAAGATTGGTAAGGTCTTCACGGAGTCAACCTGCACCACGTAGTCTTCCTGCCCATGTGGTGAGAGGAGTTGGAAGTCGTGTTCCGCCAGTTAGACCTATTAGTGTGAGAAATAGACGTCCTGTCACACCCATGCTAGTAAGAGCCAGGCCAGTGGCTCCTCCAGCTAGAAGCTATGACAGGAGATTGGCTGCTCCTGCTTATCCCAAAAGTGGCATGAAAAGAGATTATAGTCGACGTGTGGATCTACCACCTCCAAGAAGTAGAGTTGCTACAGATTATGGCTCTAGAGTAGCCTCTCAGAGGCATTCATCTTACAGGGATTATCCTGCCCGTGGTTCTGACTACCCTGAGCTGCATAGAAGAAGTACATCTCGTGGTGCACCAAAGAGAGGTTATGTTGATGATGGCTATGGCCAAAGATTTGAGAGGGCTCCTCCTTCTCCTCCTCCCCCCCATCTAAGTTACCATGAAGGACGGCCACGTGATTATGATTCTCTATCTGGCTCAAAACGTCCTTATACTGCTATAGATGATGTTCCTCCTCGGTATGATACTGGTGCTCGCCAGTCAAGGTCTCGTTTAGATTATGACTATGGAGGTAGTGCTTCACAGTATGGAGATGCTTATGGTGACAGACTTGGAAGATCTAGTCTTGGATACAGTGGCAGCAGAAATTCTATTTCTAATCAAGATTTACATGGGACTTATGGCAGTCGACAAGGCATGAGTTATGGCGGAGGTTCTTTTGGTGGTAGTGATGGTGGTATGTACTCATCAAGTTATGGTGGTGATTATGCATCCCGTGGAAGTGATGTTGGTGGCCGTTCATATTCATCTATGTATTCTGGTAGAGGTGTGGGTGGTAGCAGCAATTATATGGGTAGTGGTGGATCTGGGTCTTATTATTGA

>Glyma.09g245000.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g245000.2.p locus=Glyma.09g245000 id=Glyma.09g245000.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCCTCCGAGAATAGTGAAGAGAGGTGCTGCGGCGAAGAGGGCATCGAGGGGATCCTCAAAGGCTGCTCCTGAGAATCAACCTGAGCCTGAAACTGCGGAAGTGGTCGTGAAAAATAATGAAGAAAATCCTGTTGTTGATGCTGTGGTGGAAGAAAAGCCCGTTGATGTGGAGCAAGAACATGAGGAAGTGCCAAATGGGTCGGCTAAGGTGGAAAACAATGAAGAGGAGATTAAGGAGTCTATAGATGAATATGAAAAAGATGAACACTTAGATTTTGAGGATAATTATCCTGAGTATGAAGCAGAGGAATATGGTGGTGTTGACTATGATGAGAAGGAAATTGAACAAGATGAAGGTCAGGAGGAGGGAGATGAAGTCGAGGAAGATCCCGAAGAGATTGTAGGTGAAGAAGAGGGTGATACAGGTGATGAAGAAGTTGAATATGTTTATGAAGAAGTTGAGGATGATGATGATGAGCATGCTGGTGAGGAGCATGAGCATGCACAGATGCCTGATGTGGAGCAAGAGGAACACCGTGAAGTGGTAAAGGAGAGGCGAAAGCGGAAGGAATTTGAAGTATTTGTTGGTGGCCTAGATAAGGATGCTACTGAGCATGATCTGAAAAAGGTTTTCGGTAAAGTTGGGGTAGTTACTGAAGTCCGGCTGATGATAAATCCCCAGACAAAAAGGAACAAGGGATTTGCATTCTTGCGTTTTGAAACGGTTGAGCAAGCGAGAAGAGCTGTGGTGGAGCTAAAAAATCCTGTGATTAATGGCAAACGATGTGGTGTTACTCCAAGTCAGGACAGTGATACTCTCTACTTAGGTAACATATGCAAGACATGGAAAAAGGAAGCTTTAAAGGAGAAACTTAAACATTATGGAGTAGAAGATGTGGAGGATTTGACTTTAATAGAAGATGATACCAATGAGGGGATGAACCGAGGATTTGCATTTTTGGAGTTTTCTTCTCGTTCAGATGCTAAGGAAGCCTATAAGCGACTGCAGAAGAGAGATGTTGCATTTGGAGTTGATAAGCCTGCAAAGGTTTCCTTTGCCGACTCTTTTATTGATCTGGGTGATGAAATTATGGCACAGGTTAAAACTGTATTTATTGATTCGCTGCCTCCTTCATGGAATGAAGATTATGTCCGAGATCTTCTTAAGAAATATGGAGAGATTGAAAAAGTTGAGCTTGCTAAGGACATGCCAGCTGCTCGGAGGAAGAATTATGGATTTGTTACATTTAGTACACATGTTGCTGCTGTGGAATGTGCTGATAGCATTACTAGTGCAGGGTTAGGTGAAGGTGACAAAAAGGCAAAAGTTAGGGCTAGATTGTCACGGCCTCTTTCAAAACCTCTTCAGAGAGGCCGTGGAAAATATGTTAATCATGGGGACTTCCGCTCTGGCCGCAATTCTGGAAGATTGGTAAGGTCTTCACGGAGTCAACCTGCACCACGTAGTCTTCCTGCCCATGTGGTGAGAGGAGTTGGAAGTCGTGTTCCGCCAGTTAGACCTATTAGTGTGAGAAATAGACGTCCTGTCACACCCATGCTAGTAAGAGCCAGGCCAGTGGCTCCTCCAGCTAGAAGCTATGACAGGAGATTGGCTGCTCCTGCTTATCCCAAAAGTGGCATGAAAAGAGATTATAGTCGACGTGTGGATCTACCACCTCCAAGAAGTAGAGTTGCTACAGATTATGGCTCTAGAGTAGCCTCTCAGAGGCATTCATCTTACAGGGATTATCCTGCCCGTGGTTCTGACTACCCTGAGCTGCATAGAAGAAGTACATCTCGTGGTGCACCAAAGAGAGGTTATGTTGATGATGGCTATGGCCAAAGATTTGAGAGGGCTCCTCCTTCTCCTCCTCCCCCCCATCTAAGTTACCATGAAGGACGGCCACGTGATTATGATTCTCTATCTGGCTCAAAACGTCCTTATACTGCTATAGATGATGTTCCTCCTCGGTATGATACTGGTGCTCGCCAGTCAAGGTCTCGTTTAGATTATGACTATGGAGGTAGTGCTTCACAGTATGGAGATGCTTATGGTGACAGACTTGGAAGATCTAGTCTTGGATACAGTGGCAGCAGAAATTCTATTTCTAATCAAGATTTACATGGGACTTATGGCAGTCGACAAGGCATGAGTTATGGCGGAGGTTCTTTTGGTGGTAGTGATGGTGGTATGTACTCATCAAGTTATGGTGGTGATTATGCATCCCGTGGAAGTGATGTTGGTGGCCGTTCATATTCATCTATGTATTCTGGTAGAGGTGTGGGTGGTAGCAGCAATTATATGGGTAGTGGTGGATCTGGGTCTTATTATTGA

>Glyma.09g245000.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g245000.3.p locus=Glyma.09g245000 id=Glyma.09g245000.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCCTCCGAGAATAGTGAAGAGAGGTGCTGCGGCGAAGAGGGCATCGAGGGGATCCTCAAAGGCTGCTCCTGAGAATCAACCTGAGCCTGAAACTGCGGAAGTGGTCGTGAAAAATAATGAAGAAAATCCTGTTGTTGATGCTGTGGTGGAAGAAAAGCCCGTTGATGTGGAGCAAGAACATGAGGAAGTGCCAAATGGGTCGGCTAAGGTGGAAAACAATGAAGAGGAGATTAAGGAGTCTATAGATGAATATGAAAAAGATGAACACTTAGATTTTGAGGATAATTATCCTGAGTATGAAGCAGAGGAATATGGTGGTGTTGACTATGATGAGAAGGAAATTGAACAAGATGAAGGTCAGGAGGAGGGAGATGAAGTCGAGGAAGATCCCGAAGAGATTGTAGGTGAAGAAGAGGGTGATACAGGTGATGAAGAAGTTGAATATGTTTATGAAGAAGTTGAGGATGATGATGATGAGCATGCTGGTGAGGAGCATGAGCATGCACAGATGCCTGATGTGGAGCAAGAGGAACACCGTGAAGTGGTAAAGGAGAGGCGAAAGCGGAAGGAATTTGAAGTATTTGTTGGTGGCCTAGATAAGGATGCTACTGAGCATGATCTGAAAAAGGTTTTCGGTAAAGTTGGGGTAGTTACTGAAGTCCGGCTGATGATAAATCCCCAGACAAAAAGGAACAAGGGATTTGCATTCTTGCGTTTTGAAACGGTTGAGCAAGCGAGAAGAGCTGTGGTGGAGCTAAAAAATCCTGTGATTAATGGCAAACGATGTGGTGTTACTCCAAGTCAGGACAGTGATACTCTCTACTTAGGTAACATATGCAAGACATGGAAAAAGGAAGCTTTAAAGGAGAAACTTAAACATTATGGAGTAGAAGATGTGGAGGATTTGACTTTAATAGAAGATGATACCAATGAGGGGATGAACCGAGGATTTGCATTTTTGGAGTTTTCTTCTCGTTCAGATGCTAAGGAAGCCTATAAGCGACTGCAGAAGAGAGATGTTGCATTTGGAGTTGATAAGCCTGCAAAGGTTTCCTTTGCCGACTCTTTTATTGATCTGGGTGATGAAATTATGGCACAGGTTAAAACTGTATTTATTGATTCGCTGCCTCCTTCATGGAATGAAGATTATGTCCGAGATCTTCTTAAGAAATATGGAGAGATTGAAAAAGTTGAGCTTGCTAAGGACATGCCAGCTGCTCGGAGGAAGAATTATGGATTTGTTACATTTAGTACACATGTTGCTGCTGTGGAATGTGCTGATAGCATTACTAGTGCAGGGTTAGGTGAAGGTGACAAAAAGGCAAAAGTTAGGGCTAGATTGTCACGGCCTCTTTCAAAACCTCTTCAGAGAGGCCGTGGAAAATATGTTAATCATGGGGACTTCCGCTCTGGCCGCAATTCTGGAAGATTGGTAAGGTCTTCACGGAGTCAACCTGCACCACGTAGTCTTCCTGCCCATGTGGTGAGAGGAGTTGGAAGTCGTGTTCCGCCAGTTAGACCTATTAGTGTGAGAAATAGACGTCCTGTCACACCCATGCTAGTAAGAGCCAGGCCAGTGGCTCCTCCAGCTAGAAGCTATGACAGGAGATTGGCTGCTCCTGCTTATCCCAAAAGTGGCATGAAAAGAGATTATAGTCGACGTGTGGATCTACCACCTCCAAGAAGTAGAGTTGCTACAGATTATGGCTCTAGAGTAGCCTCTCAGAGGCATTCATCTTACAGGGATTATCCTGCCCGTGGTTCTGACTACCCTGAGCTGCATAGAAGAAGTACATCTCGTGGTGCACCAAAGAGAGGTTATGTTGATGATGGCTATGGCCAAAGATTTGAGAGGGCTCCTCCTTCTCCTCCTCCCCCCCATCTAAGTTACCATGAAGGACGGCCACGTGATTATGATTCTCTATCTGGCTCAAAACGTCCTTATACTGCTATAGATGATGTTCCTCCTCGGTATGATACTGGTGCTCGCCAGTCAAGGTCTCGTTTAGATTATGACTATGGAGGTAGTGCTTCACAGTATGGAGATGCTTATGGTGACAGACTTGGAAGATCTAGTCTTGGATACAGTGGCAGCAGAAATTCTATTTCTAATCAAGATTTACATGGGACTTATGGCAGTCGACAAGGCATGAGTTATGGCGGAGGTTCTTTTGGTGGTAGTGATGGTGGTATGTACTCATCAAGTTATGGTGGTGATTATGCATCCCGTGGAAGTGATGTTGGTGGCCGTTCATATTCATCTATGTATTCTGGTAGAGGTGTGGGTGGTAGCAGCAATTATATGGGTAGTGGTGGATCTGGGTCTTATTATTGA
Predicted protein sequences of Glyma.09g245000
>Glyma.09g245000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g245000.1 locus=Glyma.09g245000 id=Glyma.09g245000.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MPPRIVKRGAAAKRASRGSSKAAPENQPEPETAEVVVKNNEENPVVDAVVEEKPVDVEQEHEEVPNGSAKVENNEEEIKESIDEYEKDEHLDFEDNYPEYEAEEYGGVDYDEKEIEQDEGQEEGDEVEEDPEEIVGEEEGDTGDEEVEYVYEEVEDDDDEHAGEEHEHAQMPDVEQEEHREVVKERRKRKEFEVFVGGLDKDATEHDLKKVFGKVGVVTEVRLMINPQTKRNKGFAFLRFETVEQARRAVVELKNPVINGKRCGVTPSQDSDTLYLGNICKTWKKEALKEKLKHYGVEDVEDLTLIEDDTNEGMNRGFAFLEFSSRSDAKEAYKRLQKRDVAFGVDKPAKVSFADSFIDLGDEIMAQVKTVFIDSLPPSWNEDYVRDLLKKYGEIEKVELAKDMPAARRKNYGFVTFSTHVAAVECADSITSAGLGEGDKKAKVRARLSRPLSKPLQRGRGKYVNHGDFRSGRNSGRLVRSSRSQPAPRSLPAHVVRGVGSRVPPVRPISVRNRRPVTPMLVRARPVAPPARSYDRRLAAPAYPKSGMKRDYSRRVDLPPPRSRVATDYGSRVASQRHSSYRDYPARGSDYPELHRRSTSRGAPKRGYVDDGYGQRFERAPPSPPPPHLSYHEGRPRDYDSLSGSKRPYTAIDDVPPRYDTGARQSRSRLDYDYGGSASQYGDAYGDRLGRSSLGYSGSRNSISNQDLHGTYGSRQGMSYGGGSFGGSDGGMYSSSYGGDYASRGSDVGGRSYSSMYSGRGVGGSSNYMGSGGSGSYY*

>Glyma.09g245000.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g245000.2 locus=Glyma.09g245000 id=Glyma.09g245000.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MPPRIVKRGAAAKRASRGSSKAAPENQPEPETAEVVVKNNEENPVVDAVVEEKPVDVEQEHEEVPNGSAKVENNEEEIKESIDEYEKDEHLDFEDNYPEYEAEEYGGVDYDEKEIEQDEGQEEGDEVEEDPEEIVGEEEGDTGDEEVEYVYEEVEDDDDEHAGEEHEHAQMPDVEQEEHREVVKERRKRKEFEVFVGGLDKDATEHDLKKVFGKVGVVTEVRLMINPQTKRNKGFAFLRFETVEQARRAVVELKNPVINGKRCGVTPSQDSDTLYLGNICKTWKKEALKEKLKHYGVEDVEDLTLIEDDTNEGMNRGFAFLEFSSRSDAKEAYKRLQKRDVAFGVDKPAKVSFADSFIDLGDEIMAQVKTVFIDSLPPSWNEDYVRDLLKKYGEIEKVELAKDMPAARRKNYGFVTFSTHVAAVECADSITSAGLGEGDKKAKVRARLSRPLSKPLQRGRGKYVNHGDFRSGRNSGRLVRSSRSQPAPRSLPAHVVRGVGSRVPPVRPISVRNRRPVTPMLVRARPVAPPARSYDRRLAAPAYPKSGMKRDYSRRVDLPPPRSRVATDYGSRVASQRHSSYRDYPARGSDYPELHRRSTSRGAPKRGYVDDGYGQRFERAPPSPPPPHLSYHEGRPRDYDSLSGSKRPYTAIDDVPPRYDTGARQSRSRLDYDYGGSASQYGDAYGDRLGRSSLGYSGSRNSISNQDLHGTYGSRQGMSYGGGSFGGSDGGMYSSSYGGDYASRGSDVGGRSYSSMYSGRGVGGSSNYMGSGGSGSYY*

>Glyma.09g245000.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g245000.3 locus=Glyma.09g245000 id=Glyma.09g245000.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MPPRIVKRGAAAKRASRGSSKAAPENQPEPETAEVVVKNNEENPVVDAVVEEKPVDVEQEHEEVPNGSAKVENNEEEIKESIDEYEKDEHLDFEDNYPEYEAEEYGGVDYDEKEIEQDEGQEEGDEVEEDPEEIVGEEEGDTGDEEVEYVYEEVEDDDDEHAGEEHEHAQMPDVEQEEHREVVKERRKRKEFEVFVGGLDKDATEHDLKKVFGKVGVVTEVRLMINPQTKRNKGFAFLRFETVEQARRAVVELKNPVINGKRCGVTPSQDSDTLYLGNICKTWKKEALKEKLKHYGVEDVEDLTLIEDDTNEGMNRGFAFLEFSSRSDAKEAYKRLQKRDVAFGVDKPAKVSFADSFIDLGDEIMAQVKTVFIDSLPPSWNEDYVRDLLKKYGEIEKVELAKDMPAARRKNYGFVTFSTHVAAVECADSITSAGLGEGDKKAKVRARLSRPLSKPLQRGRGKYVNHGDFRSGRNSGRLVRSSRSQPAPRSLPAHVVRGVGSRVPPVRPISVRNRRPVTPMLVRARPVAPPARSYDRRLAAPAYPKSGMKRDYSRRVDLPPPRSRVATDYGSRVASQRHSSYRDYPARGSDYPELHRRSTSRGAPKRGYVDDGYGQRFERAPPSPPPPHLSYHEGRPRDYDSLSGSKRPYTAIDDVPPRYDTGARQSRSRLDYDYGGSASQYGDAYGDRLGRSSLGYSGSRNSISNQDLHGTYGSRQGMSYGGGSFGGSDGGMYSSSYGGDYASRGSDVGGRSYSSMYSGRGVGGSSNYMGSGGSGSYY*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
USDA Logo
Iowa State University Logo