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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.09g225500

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm09
Start:45420949
stop:45429228
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.09g225500
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G57330.1AT ACA11 JGI N/AIEA
3.6.3.8EC JGI N/AIEA
GO:0000166GO-mf nucleotide binding JGI N/AIEA
GO:0005516GO-mf calmodulin binding JGI N/AIEA
GO:0046872GO-mf metal ion binding JGI N/AIEA
K01537KEGG Enzymes with EC numbers JGI N/AIEA
PTHR24093PantherFam CATION TRANSPORTING ATPASE JGI N/AIEA
PF00122Pfam E1-E2 ATPase JGI N/AIEA
PF00689Pfam Cation transporting ATPase, C-terminus JGI N/AIEA
PF00690Pfam Cation transporter/ATPase, N-terminus JGI N/AIEA
PF12515Pfam Ca2+-ATPase N terminal autoinhibitory domain JGI N/AIEA
PF12710Pfam haloacid dehalogenase-like hydrolase JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.09g225500 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma09g35970 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.09g225500
>Glyma.09g225500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g225500.1.p locus=Glyma.09g225500 id=Glyma.09g225500.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g225500.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g225500.2.p locus=Glyma.09g225500 id=Glyma.09g225500.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g225500.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g225500.3.p locus=Glyma.09g225500 id=Glyma.09g225500.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.09g225500
>Glyma.09g225500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g225500.1 locus=Glyma.09g225500 id=Glyma.09g225500.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g225500.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g225500.2 locus=Glyma.09g225500 id=Glyma.09g225500.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g225500.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g225500.3 locus=Glyma.09g225500 id=Glyma.09g225500.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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