Report for Sequence Feature Glyma.09g197400
| Feature Type: | gene_model |
| Chromosome: | Gm09 |
| Start: | 43100406 |
| stop: | 43105685 |
| Source: | JGI |
| Version: | Wm82.a4.v1 |
| High confidence: | yes |
| 
|
Annotations for Glyma.09g197400
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|
| AT1G42540.1 | AT |
ATGLR3.3,GLR3.3 |
JGI | N/A | IEA |
| GO:0016020 | GO-cc |
membrane |
JGI | N/A | IEA |
| GO:0004970 | GO-mf |
ionotropic glutamate receptor activity |
JGI | N/A | IEA |
| K05387 | KEGG |
Ion channels |
JGI | N/A | IEA |
| KOG1052 |
KOG |
Glutamate-gated kainate-type ion channel receptor subunit GluR5 and related subunits |
JGI | N/A | IEA |
| PTHR18966 | PantherFam |
IONOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR |
JGI | N/A | IEA |
| PF00060 | Pfam |
Ligand-gated ion channel |
JGI | N/A | IEA |
| PF00497 | Pfam |
Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 |
JGI | N/A | IEA |
| PF13458 | Pfam |
Periplasmic binding protein |
JGI | N/A | IEA |
Gene model name correspondences to Glyma.09g197400 Gene Call Version Wm82.a4.v1
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|
| Glyma09g33010 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
Coding sequences of Glyma.09g197400
>Glyma.09g197400.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g197400.2.p locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g197400.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g197400.3.p locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g197400.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g197400.4.p locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g197400.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g197400.5.p locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.09g197400
>Glyma.09g197400.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g197400.2 locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g197400.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g197400.3 locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g197400.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g197400.4 locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g197400.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g197400.5 locus=Glyma.09g197400 id=Glyma.09g197400.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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SoyBase
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