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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.09g169600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm09
Start:40334614
stop:40344490
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.09g169600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G17740.1AT JGI N/AIEA
PTHR13471PantherFam TETRATRICOPEPTIDE-LIKE HELICAL JGI N/AIEA
PTHR13471:SF0PantherFam NUCLEAR EXOSOME REGULATOR NRDE2 JGI N/AIEA
PF08424Pfam NRDE-2, necessary for RNA interference JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.09g169600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma09g29980 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.09g169600
>Glyma.09g169600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g169600.1.p locus=Glyma.09g169600 id=Glyma.09g169600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g169600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g169600.3.p locus=Glyma.09g169600 id=Glyma.09g169600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g169600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g169600.4.p locus=Glyma.09g169600 id=Glyma.09g169600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.09g169600
>Glyma.09g169600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g169600.1 locus=Glyma.09g169600 id=Glyma.09g169600.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g169600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g169600.3 locus=Glyma.09g169600 id=Glyma.09g169600.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g169600.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g169600.4 locus=Glyma.09g169600 id=Glyma.09g169600.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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