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Warning: get_headers(https://bar.utoronto.ca/api/efp_image/efp_soybean/soybean_severin/Absolute/Glyma.09g151400): Failed to open stream: php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

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Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1031

Report for Sequence Feature Glyma.09g151400

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm09
Start:37293462
stop:37298324
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.09g151400
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G05200.1AT cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 25 JGI N/AIEA
AT4G23180.1AT cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 10 JGI N/AIEA
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GO:0006468GO-bp protein phosphorylation JGI N/AIEA
GO:0016310GO-bp phosphorylation EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0018108GO-bp peptidyl-tyrosine phosphorylation EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005886GO-cc plasma membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0016020GO-cc membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0000166GO-mf nucleotide binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity JGI N/AIEA
GO:0004674GO-mf protein serine/threonine kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004713GO-mf protein tyrosine kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
GO:0016301GO-mf kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0016740GO-mf transferase activity EnsemblGenomesN/AIEA
KOG1187 KOG Serine/threonine protein kinase JGI N/AIEA
PTHR24420Panther LEUCINE-RICH REPEAT RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE JGI N/AIEA
PTHR24420:SF430Panther PROLINE-RICH RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE PERK12-RELATED JGI N/AIEA
PF00069PFAM Protein kinase domain JGI N/AIEA
PF01657PFAM Salt stress response/antifungal JGI N/AIEA

Proteins Associated with Glyma.09g151400
LocusGene SymbolProtein Name
CRK13 cysteine-rich receptor-like protein kinase

Expression Patterns of Glyma.09g151400
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.09g151400 not represented in the dataset
Glyma.09g151400 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.09g151400 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma09g27782 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.09g151400
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>Glyma.09g151400.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g151400 ID=Glyma.09g151400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g151400.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g151400 ID=Glyma.09g151400.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g151400.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g151400 ID=Glyma.09g151400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.09g151400
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Predicted protein sequences of Glyma.09g151400
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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