SoyBase
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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research
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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT1G23230.2 | AT | JGI | N/A | IEA | |
| KOG1883 | KOG | Cofactor required for Sp1 transcriptional activation, subunit 3 | JGI | N/A | IEA |
| PTHR12691 | Panther | FAMILY NOT NAMED | JGI | N/A | IEA |
| PTHR12691:SF1 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF11573 | PFAM | Mediator complex subunit 23 | JGI | N/A | IEA |
| Locus | Gene Symbol | Protein Name |
|---|---|---|
| MED23-1 | Mediator Complex 23 gene 1 |
|
Glyma.09g123500 not represented in the dataset |
Glyma.09g123500 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma09g22260 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.09g123500.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g123500 ID=Glyma.09g123500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GTTTTTTTCGATACTGCAATGAACAAGACGCAGAAACGCGTACACGCCCTGAATCGGGAGCTTCCTCCACCAAATGAGCAGTTCATTCTGGATTTTGAGCAACTCCAGAGCCAGTGTGCTGACCAGGATCAATTACGTTCTGTTACAGAAGCGATTCTTATATCGCTAGTAGTGCAGTGTAGTGGCCATGGACCAAGGGCAGACTTTCTTCTTTTTGTTTTACGGAGCTTATGTGGTATTGGATGCATTAACTGGGACTCCCTTCTGCCGTCCCTTCTTTCATCAGTTTCTTCTGCAGAATTGCCTGTTGGTCAACTAAGTCAAGCAGTGCCAACTGTTTCCTCATCGAGCTTATCACAGACAGGAATGCTGCCACCACCAAGCACGATTGCTAATTCTTCAAATTTTCAGTCTTCAAATCCTGCGTCTCCTTTGACCTCTGTTCATACTATTGGCTCGCCTGCGCAGTCAACGATGGAACCATTATCTTGTGCAGCTATGTCTCCTGTCAAATCATCTGATATTTCCTCTGCTGGACAACAATCTAAACTTAGAGGCAGTCCATCTGTTAGAACTAATGATATCAGTAATAGTAGCCTTCGTCAGCTATGTTGCAAGATTATTTTAACTGGTCTTGAGTTCAGTTTAAAACCAGTTACTTATGCTGAAATCTTCAACTATATGCTGAATTGGCTGGTGAATTGGGACCAGAGGCAACAGGGAATTGATGAATCAGATGTAATAAAATCATGGAGGCCTGACAAGGCTGTAATTGCATGGCTACACAGTTGTTTGGATGTGATTTGGCTTTTAGTTGATGAGGGAAAATGTCGGGTGCCCTTTTATGAATTATTACGTAGTGATTTGCAATTCATAGAGAATATTCCTGATGATGAAGCATTGTTCACACTTATCTTGGAGATCCATAGGAGACGAGATATGATGGCTATGCACATGCAAATGTTAGACCAGCATCTTCATTGCCCTACATTTGGGACTCATCGGATCCTGAATCAGACTATACCTAATGTTTCAGGTGAAGCAGTAGCACACCTGCGACTATCACCAATTACATATTTAAGTGTACTTGGAGAACCATTGCATGGAGAGGATATTGCATCCTCTATTCAGAAGGGAAGTTTGGACTGGGAGAGAGCTGTACGTTGCATAAGGCATGCTCTCCGTACTACACCATCACCTGATTGGTGGAGACGTGTGCTGGTACTGGCTCCTTGCTATAGGAATTCATCTCAAGGGCCTACTGCTGGTGCTGTTTTTTCTTCAGAGATGATTTGTGAGGCAACTATTGATAGAATTGTTGAACTATTGAAAATGACAAATTCAGAGATAAATTGCTGGCAGGATTGGTTGGTCTTCTCTGATATTTTCTATTTTCTTATTAAAAGTGGGTGCATTGATTTTGTTGATTTTGTGGACAAGCTGGTTTCACGTCTTACCGAGGGTGATCATCATATACTCAAAACAAATCATGTGACTTGGTTGCTTGCACAGATAATTCGAATTGAGTTGGTCATGAATGCTTTGAATTCTGATCCTAGAAAGGTGGAGACAACCAGAAAGATTTTATCATTCCATAGAGAAGACAGAAGTTCGGATCCTAATAATCCTCAAAGTATCTTGCTTGATTTTGTAAGCAGTTGTCAAAATTTACGTATTTGGTCACTGAACTCATCAACCAGAGAATATCTGAACAATGAACAGCTTCAGAAAGGAAAACAAATAGATGAATGGTGGAGACAAGCGAGCAAAGGGGAAAGAATGATGGATTATATGAATATGGATGAACGCTCAATAGGGATGTTTTGGGTTGTGACCTACACAATGGCACAACCTGCTTGTGAAACAGTAATGAATTGGTTAAATTCTGCTGGAGTTGCTGACTTACTACCAGGAGCAAATTTACAACAAGCTGAGAGATTAATGGCTACACGAGAAGTCAGCCCACTGCCCATGTCATTGTTATCTGGATTTTCAATAAACTTATGTGTGAAGCTGTCTTATCAAATGGAAGATTCTCTATTTTCTGGGCAGGTTATACCCAGCATTGCAATGGTTGAAACTTATACTAGATTGTTGCTCTTAGCACCTCATTCACTCTTTCGTTCGCATTTCAATCATTTGGTGCAAAGAAATCCTTCTTTGTTGAGCAAACCTGGGGTAACACTTTTAGTGCTTGAGATATTGAACTACCGACTACTTCCACTTTACAGGTACCAGGGAAAAAGCAAAGCCCTGATGTATGATGTGACAAAGATTATTTCGGCTATAAAAGGAAAACGAGGAGATCATCGAGTATTCAGATTAGCTGAAAATCTGTGCCTGAATCTTATTTTCTCGTTGAGAGATTTCTTTTTGGTTAAAAGGGAAGGGAAGGGCCCAACAGAATTTACTGAAACTCTGAATCGAGTGACTGTTATAACACTTGCAATCCTTATTAAAACTCGTGGGATTGCTGATGCTGAACACCTGCTTTATCTCCAAAATATGTTGGAACAAATAATGGCTACTAGCCATCATACATGGTCAGAAAAAACACTACATCACTTCCCTTCTGTTCTGCGTGAAGCATTGAGTGGTCAAACTGATAAAAGGAGCCTTGCAATACAAACGTGGCAGCAGGCAGAAACCACTGTAATACACCAGTGCACCCAGCTTCTTTCACCATCAGCTGATCCTAGTTATGTTATGACCTATATCAGTCATAGTTTCCCTCAGCATCGACAATATCTATGTGCTGGTGCATTGATATTAATGCATGGCCATGCAGAAAACATTAACAGTGGAAACCTGGGACGTGTCCTGCGGGAATTCTCTCCTGAAGAGGTGACGTCTAACATTTACACAATGGTGGATGTTCTGCTTCATCATATGCAGATAGAGCTTCAACAAGGACACTCTTCACAGGACCTTATGTTAAAAGCTTGTGCAAGCATTGCCTTTTTTGTTTGGACAAATGAGTTACTTCCTTTGGATATCTTGCTCTTGGCCCTTATTGACCGCGATGATGATCCACATGCTTTGCGTATGGTGATTAGTCTACTTGATAGGCCAGAGCTTCAGCAAAGAGTAAAACACTTTTGTATGACTCGTGGGCACCCTGAACATTGGCTTTACTCAGGAATATTCAAGCGGGTTGAGCTACAAAAGGCTCTTGGAAATCACCTTGCATGGAAAGATAGGTATCCCGTGTTCTTTGACGATATAGCGGCACGATTACTTCCAGTCATCCCCTTGATTATTTATAGACTTATTGAAAATGATGCAATGGATACAGCAGAAAGACTGTTGGCCATGTATTCTCCATTGCTTGCTTATTACCCTCTAAGATTTACATTTGTTCGTGATATACTTGCATATTTCTATGGTCATCTTCCTGGAAAGCTCATTGTTCGAATCCTCAATGTACTTGACATCAGTAAGATTCCCTTTTCAGAGTCATTCCCGCAACAAATAAGTTTGACGAATCCTGTCATGTGTCCTCCTCTGGATTATTTTACGACTCTGTTACTGGGAATAGTAAACAATGTTATTCCTCCATTACATAACAATTCAAAATCTGGATCTATGGGAGATGCGTCAAGCAATACACTTCGAACTGCACAAAGCAAGCCTCCAGCAGTATCTCAGTCTGGGTCAGCAAATGCTTCAGAGGGCCAAAAGGCATTTTACCAAATTCAGGATCCTGGCACATACACTCAGTTGGTTCTCGAGACTGCAGTTATCGAAATACTTTCCCTTCCCATATCTGCCTCTCAGATAGTACAATCACTTGTTCAAATTGTTGTTAATATACAACCAACCTTGATCCAGTCCAGCAATGCTCTTCATGGTGGTTCAAACAGTGTAGGGCAAGGTTCAGTGTTGCCAACATCACCTTCAGGGGGAAGCACAGATTCCTTAGGTGCAAGCAGATCAACTCCTTCAGTTTCTGGAATAAATACCTCTAATTTTGCTTCTCGAAGTGGCTATACATGCCAACAGCTGTCTTGCTTGTTAATTCAAGCTTGTGGCCTCCTACTGGCTCAGCTTCCTTCTGATTTTCACTCACAACTGTACTTGGAGACAACACGTATTATAAAAGAGAACTGGTGGCTTAAGGATGGGACAAGGTCACTTGGGGAAATAGACTCTGCTGTTGGCTATGCTTTATTGGATCCAACATGGGCTGCACAGGACAATACCTCCACAGCCATTGGGAATGTGGTGGCCTTGCTTCATTCCTTCTTCAGTAACCTTCCACAAGAATGGCTTGAAGGGACCAATGTTATTATCAAGCAACTTCGGCCAGTAACATCAGTCGCAATGTTGAGGATAGCATTCCGTGTAATGGGACCACTCCTTCCAAAACTTGCCAATGCTCATGCACTTTTCAACAAGACCCTCTCATCACTACTAACTATATTAGTGGATGTATTTGGGAAAAACTCCCAGACATCAATTGCCGTTGATGCATCAGACATAGCAGATATCATTGACTTCCTCCATCATGTTGTCCATTACGAGGGACAGGGAGGGCCTGTGCAGGCTAGCAGCAAACCACGACCGGAGGTTTTGGCTCTCATTGGAAGGGCATCAGAGAGTTTACGTCCAGACATTCAGCATTTGCTTTCACACCTAAATCCTGATGTCAATTCCTCTGTGTATGCAGCATTTCATCCCAAGTTAGCTCAGAATCCAACTTAGGTGCAGGAGTATAATATACTACGAAGAAACCTGCACATAGCTCTATTTGTAGTTCAAAAATGGTACAGAGCAACATTTCTTATTGTGGATTCTTCAGGTTATATTTCCTGTATAATCACTTGGTTGGAGACCTGTAGCGGATGACAATTACACAACGCAATTTAGAAATTGTAAGAGTCAAGAGTTGTATATAAATTAATGTATATGCTATTCATTTTTGCCAAATTAGCATCAGAAAAGCTTATAAATGTATTGCATATCAATTGAGCCTGTGTTACAACT >Glyma.09g123500.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g123500 ID=Glyma.09g123500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 AATAAACCCAAGTAGTTCTAAGCATAACTTGTTCAACTTAGTAGAACAGAGTAGTAGTAGTTGTTGCATTAAACCAGAGAAATCTATGAAGAATCCTGTGAAATTGAAATTGAATGAAAGCTAAATCAAAAAATGGATCAATCACAGAATCAGAGACCAGCGACATCAACAACCACACCCTCGCGCTCTTTCCAGTTCCACCCCCTTCGTGTCCCCATTTTCGATCTCTTCAACCTCTACTTAGGACTCGGCCGAAACAGTCGCCAGAAACCCGATGACTCACTTCGCGACCCACCGAACAAGACGCAGAAACGCGTACACGCCCTGAATCGGGAGCTTCCTCCACCAAATGAGCAGTTCATTCTGGATTTTGAGCAACTCCAGAGCCAGTGTGCTGACCAGGATCAATTACGTTCTGTTACAGAAGCGATTCTTATATCGCTAGTAGTGCAGTGTAGTGGCCATGGACCAAGGGCAGACTTTCTTCTTTTTGTTTTACGGAGCTTATGTGGTATTGGATGCATTAACTGGGACTCCCTTCTGCCGTCCCTTCTTTCATCAGTTTCTTCTGCAGAATTGCCTGTTGGTCAACTAAGTCAAGCAGTGCCAACTGTTTCCTCATCGAGCTTATCACAGACAGGAATGCTGCCACCACCAAGCACGATTGCTAATTCTTCAAATTTTCAGTCTTCAAATCCTGCGTCTCCTTTGACCTCTGTTCATACTATTGGCTCGCCTGCGCAGTCAACGATGGAACCATTATCTTGTGCAGCTATGTCTCCTGTCAAATCATCTGATATTTCCTCTGCTGGACAACAATCTAAACTTAGAGGCAGTCCATCTGTTAGAACTAATGATATCAGTAATAGTAGCCTTCGTCAGCTATGTTGCAAGATTATTTTAACTGGTCTTGAGTTCAGTTTAAAACCAGTTACTTATGCTGAAATCTTCAACTATATGCTGAATTGGCTGGTGAATTGGGACCAGAGGCAACAGGGAATTGATGAATCAGATGTAATAAAATCATGGAGGCCTGACAAGGCTGTAATTGCATGGCTACACAGTTGTTTGGATGTGATTTGGCTTTTAGTTGATGAGGGAAAATGTCGGGTGCCCTTTTATGAATTATTACGTAGTGATTTGCAATTCATAGAGAATATTCCTGATGATGAAGCATTGTTCACACTTATCTTGGAGATCCATAGGAGACGAGATATGATGGCTATGCACATGCAAATGTTAGACCAGCATCTTCATTGCCCTACATTTGGGACTCATCGGATCCTGAATCAGACTATACCTAATGTTTCAGGTGAAGCAGTAGCACACCTGCGACTATCACCAATTACATATTTAAGTGTACTTGGAGAACCATTGCATGGAGAGGATATTGCATCCTCTATTCAGAAGGGAAGTTTGGACTGGGAGAGAGCTGTACGTTGCATAAGGCATGCTCTCCGTACTACACCATCACCTGATTGGTGGAGACGTGTGCTGGTACTGGCTCCTTGCTATAGGAATTCATCTCAAGGGCCTACTGCTGGTGCTGTTTTTTCTTCAGAGATGATTTGTGAGGCAACTATTGATAGAATTGTTGAACTATTGAAAATGACAAATTCAGAGATAAATTGCTGGCAGGATTGGTTGGTCTTCTCTGATATTTTCTATTTTCTTATTAAAAGTGGGTGCATTGATTTTGTTGATTTTGTGGACAAGCTGGTTTCACGTCTTACCGAGGGTGATCATCATATACTCAAAACAAATCATGTGACTTGGTTGCTTGCACAGATAATTCGAATTGAGTTGGTCATGAATGCTTTGAATTCTGATCCTAGAAAGGTGGAGACAACCAGAAAGATTTTATCATTCCATAGAGAAGACAGAAGTTCGGATCCTAATAATCCTCAAAGTATCTTGCTTGATTTTGTAAGCAGTTGTCAAAATTTACGTATTTGGTCACTGAACTCATCAACCAGAGAATATCTGAACAATGAACAGCTTCAGAAAGGAAAACAAATAGATGAATGGTGGAGACAAGCGAGCAAAGGGGAAAGAATGATGGATTATATGAATATGGATGAACGCTCAATAGGGATGTTTTGGGTTGTGACCTACACAATGGCACAACCTGCTTGTGAAACAGTAATGAATTGGTTAAATTCTGCTGGAGTTGCTGACTTACTACCAGGAGCAAATTTACAACAAGCTGAGAGATTAATGGCTACACGAGAAGTCAGCCCACTGCCCATGTCATTGTTATCTGGATTTTCAATAAACTTATGTGTGAAGCTGTCTTATCAAATGGAAGATTCTCTATTTTCTGGGCAGGTTATACCCAGCATTGCAATGGTTGAAACTTATACTAGATTGTTGCTCTTAGCACCTCATTCACTCTTTCGTTCGCATTTCAATCATTTGGTGCAAAGAAATCCTTCTTTGTTGAGCAAACCTGGGGTAACACTTTTAGTGCTTGAGATATTGAACTACCGACTACTTCCACTTTACAGGTACCAGGGAAAAAGCAAAGCCCTGATGTATGATGTGACAAAGATTATTTCGGCTATAAAAGGAAAACGAGGAGATCATCGAGTATTCAGATTAGCTGAAAATCTGTGCCTGAATCTTATTTTCTCGTTGAGAGATTTCTTTTTGGTTAAAAGGGAAGGGAAGGGCCCAACAGAATTTACTGAAACTCTGAATCGAGTGACTGTTATAACACTTGCAATCCTTATTAAAACTCGTGGGATTGCTGATGCTGAACACCTGCTTTATCTCCAAAATATGTTGGAACAAATAATGGCTACTAGCCATCATACATGGTCAGAAAAAACACTACATCACTTCCCTTCTGTTCTGCGTGAAGCATTGAGTGGTCAAACTGATAAAAGGAGCCTTGCAATACAAACGTGGCAGCAGGCAGAAACCACTGTAATACACCAGTGCACCCAGCTTCTTTCACCATCAGCTGATCCTAGTTATGTTATGACCTATATCAGTCATAGTTTCCCTCAGCATCGACAATATCTATGTGCTGGTGCATTGATATTAATGCATGGCCATGCAGAAAACATTAACAGTGGAAACCTGGGACGTGTCCTGCGGGAATTCTCTCCTGAAGAGGTGACGTCTAACATTTACACAATGGTGGATGTTCTGCTTCATCATATGCAGATAGAGCTTCAACAAGGACACTCTTCACAGGACCTTATGTTAAAAGCTTGTGCAAGCATTGCCTTTTTTGTTTGGACAAATGAGTTACTTCCTTTGGATATCTTGCTCTTGGCCCTTATTGACCGCGATGATGATCCACATGCTTTGCGTATGGTGATTAGTCTACTTGATAGGCCAGAGCTTCAGCAAAGAGTAAAACACTTTTGTATGACTCGTGGGCACCCTGAACATTGGCTTTACTCAGGAATATTCAAGCGGGTTGAGCTACAAAAGGCTCTTGGAAATCACCTTGCATGGAAAGATAGGTATCCCGTGTTCTTTGACGATATAGCGGCACGATTACTTCCAGTCATCCCCTTGATTATTTATAGACTTATTGAAAATGATGCAATGGATACAGCAGAAAGACTGTTGGCCATGTATTCTCCATTGCTTGCTTATTACCCTCTAAGATTTACATTTGTTCGTGATATACTTGCATATTTCTATGGTCATCTTCCTGGAAAGCTCATTGTTCGAATCCTCAATGTACTTGACATCAGTAAGATTCCCTTTTCAGAGTCATTCCCGCAACAAATAAGTTTGACGAATCCTGTCATGTGTCCTCCTCTGGATTATTTTACGACTCTGTTACTGGGAATAGTAAACAATGTTATTCCTCCATTACATAACAATTCAAAATCTGGATCTATGGGAGATGCGTCAAGCAATACACTTCGAACTGCACAAAGCAAGCCTCCAGCAGTATCTCAGTCTGGGTCAGCAAATGCTTCAGAGGGCCAAAAGGCATTTTACCAAATTCAGGATCCTGGCACATACACTCAGTTGGTTCTCGAGACTGCAGTTATCGAAATACTTTCCCTTCCCATATCTGCCTCTCAGATAGTACAATCACTTGTTCAAATTGTTGTTAATATACAACCAACCTTGATCCAGTCCAGCAATGCTCTTCATGGTGGTTCAAACAGTGTAGGGCAAGGTTCAGTGTTGCCAACATCACCTTCAGGGGGAAGCACAGATTCCTTAGGTGCAAGCAGATCAACTCCTTCAGTTTCTGGAATAAATACCTCTAATTTTGCTTCTCGAAGTGGCTATACATGCCAACAGCTGTCTTGCTTGTTAATTCAAGCTTGTGGCCTCCTACTGGCTCAGCTTCCTTCTGATTTTCACTCACAACTGTACTTGGAGACAACACGTATTATAAAAGAGAACTGGTGGCTTAAGGATGGGACAAGGTCACTTGGGGAAATAGACTCTGCTGTTGGCTATGCTTTATTGGATCCAACATGGGCTGCACAGGACAATACCTCCACAGCCATTGGGAATGTGGTGGCCTTGCTTCATTCCTTCTTCAGTAACCTTCCACAAGAATGGCTTGAAGGGACCAATGTTATTATCAAGCAACTTCGGCCAGTAACATCAGTCGCAATGTTGAGGATAGCATTCCGTGTAATGGGACCACTCCTTCCAAAACTTGCCAATGCTCATGCACTTTTCAACAAGGTACAGAGAATCACCAATTCCCAATCTTAAGGAAGCATTCTGTTGGAACTGGATCATAACTTATGAAGA
>Glyma.09g123500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g123500.1.p locus=Glyma.09g123500 ID=Glyma.09g123500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.09g123500.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g123500.2.p locus=Glyma.09g123500 ID=Glyma.09g123500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||
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