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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT2G12400.1 | AT | JGI | N/A | IEA | |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
Glyma.09g093400 not represented in the dataset |
Glyma.09g093400 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma09g12320 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.09g093400.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.09g093400.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.09g093400.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.09g093400.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g093400.1.p locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.09g093400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.1 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPCFTPHPSLLFLLLTLLSISFFSPSTAARTSSFHSLRISDGVEDGGEGEYYHEVLPWKTRRSMAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEVWKNYICEVSSSDICKTPGRMTPTVYGQMEAAVNVSYGLYHYGPFLVGLQDCTFVRKIFTDISNNHCPGLQRNSQLIYIGLVLVSAAVMLSLIFWVIYARERRHRVYTKQFIEG* >Glyma.09g093400.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.2 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEVWKNYICEVSSSDICKTPGRMTPTVYGQMEAAVNVSYGLYHYGPFLVGLQDCTFVRKIFTDISNNHCPGLQRNSQLIYIGLVLVSAAVMLSLIFWVIYARERRHRVYTKQFIEG* >Glyma.09g093400.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.3 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPCFTPHPSLLFLLLTLLSISFFSPSTAARTSSFHSLRISDGVEDGGEGEYYHEVLPWKTRRSMAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEEKRKRKNGAAVENHFR* >Glyma.09g093400.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.4 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEDSQASVKMIFHVSIFDCDAGIVAVGEGEKKEKKWCRC* >Glyma.09g093400.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.5 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPCFTPHPSLLFLLLTLLSISFFSPSTAARTSSFHSLRISDGVEDGGEGEYYHEVLPWKTRRSMAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEDSQASVKMIFHVSIFDCDAGIVAVGEGEKKEKKWCRC* >Glyma.09g093400.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.6 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEDLGGEF* >Glyma.09g093400.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.7 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPCFTPHPSLLFLLLTLLSISFFSPSTAARTSSFHSLRISDGVEDGGEGEYYHEVLPWKTRRSMAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEDLGGEF* >Glyma.09g093400.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g093400.8 locus=Glyma.09g093400 ID=Glyma.09g093400.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPCFTPHPSLLFLLLTLLSISFFSPSTAARTSSFHSLRISDGVEDGGEGEYYHEVLPWKTRRSMAEEEATSNTSLILAQRRTTRKDPLDNYNHYTGGWNISNRHYIASVVFTAVPFFVVAAVWFVIFGLSLSFICLCYCCCPREPYGYSRLAYALSLIFLVLFTLAAIVGCVLLYTAQGKFHGSTTNTLKSLVSQADFTAENLRNVSDYLDAAQKIGVEAVFLPADVQKNIDEVQMKINSSAADLSSKTKKNSETIKDVIDAMRRDLVILAAVMLFLAFLGFLFSIFGLQGLVYFLVIVGWILVAGTFILCGVFLFLHNVVADTCVAMDEWVQNPTAHTALDEILPCVDNATAQETLFRTRDVTHQLANLLGNIVSNVTNRNLPPAAGPLYYNQSGPLMPPLCNPFNNDLTNRSCADGEVSLDKAAEDLGGEF*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||