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Report for Sequence Feature Glyma.09g077900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm09
Start:8650928
stop:8658660
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.09g077900
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G63010.1AT Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
KOG0280 KOG Uncharacterized conserved protein JGI N/AIEA
PTHR22850Panther WD40 REPEAT FAMILY JGI N/AIEA
PTHR22850:SF17Panther WD REPEAT-CONTAINING PROTEIN 85 JGI N/AIEA
PF00400PFAM WD domain, G-beta repeat JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.09g077900
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.09g077900 not represented in the dataset
Glyma.09g077900 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.09g077900 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma09g09140 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.09g077900
>Glyma.09g077900.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
AGAACACACATAGTTGCCTCGCACTATTAAAGGTCTAAGCCTTAATGGTTTGTAGAATCTGTTCTGGAGATACGAGTAAGCCCACAGATTTTTTTTTTGTTTTTCCTGTGGGTGTGCATGGTTTACATGTGATGCAAGGTTTCTGTTAAGCTAGCTTGGCAATCATTTGGCTGGCATGGACATAGCACATTGCTATTTAAAGGGTAATGCTGATGCTGTGGAGTTTTGTCCACATGATCCCTACCATAATGTTTTAGCAGTATCCACTTACACATTACAAGAAGGTTCTCAGCCCTGTCGACATGGAAGCATTTCACTCTTCAATGTTGATGTGGAACCAGGTCACCTTGACATGGTTTTTAGTGAGGAAACTGCTGGGATTTTTGACATAAAGTGGAATCCACCTGGCGGGCATGCAAGTCCTTTTCTAGCTCAAGCAGATGCTGATGGATACTTGAGAATTAAAATGCTGGAGGGTTGCTGTAATGGAGTGGAAGGGGTTAATCTAAAGGAGATCACAAATGAAAAAATCAGTAACTCTATGTGCTTGTACCTGGATTGGAACCCTTCAGCCACATCCATCACAGTGGGGCTTTCTGACGGCTCTGTGTCTATTGTTTCTTTTCTTGAATCCAAGCTGGAAATTCAAGAAGAGTGGAAAGCTCATGATTATGAACTTTGGACAACCTCCTTTGATATCCACCAACCAAATTTGGTATACACTGGCTCTGATGATTGTAAATTCAGTTGTTGGGATTTGCGAGATAAACCTCCCAATGTGGTATTTCAGAGCTCTAAAGTCCACAAAATGGGTGTTTGTTGCATTGAGAAGAGTCCACATGACCCAAATACCTTGTTAACTGGCAGTTATGATGAATTCCTAAGGGTATGGGATTTAAGATCAATCTCAAAACCCCTTAATTCAATTAACTTGGGGGGAGGAGTTTGGAGGGTTAAGCACCACCCCTTCATTCCAGGCTTGGTTTTGGCTGCTTGTATGCACAATGGTTTTGCTATTGTCGCCATTAAAGGCAACAATGCCGAAGTGTCGGAAACTTACAAGAAGCATGATTCTCTTGCCTATGGAGCAGATTGGCAGAAAGGAGAAGCAAATCACATAGGTGGGAATACCAAACCACTGGTGGCTACTTGCTCATTCTACGACAAACTTGTTCGGGTGTGGAGGCCAGGAAATGATCTTATCTTGTAGAATGTAGATTGATGCTTAACGTTAAGTCATGAACCCACTTGAAAATGTGATACGTAGTTTATTTATTGAATTATGGTTGAATTACATGACACTTTCATTTACAGTTAATCATTTTTACTCACTCATTCACGGCTTGAAGGATGAGCTAACGTGTCACTCTTTGATTGTAGTTGATTGATCATGGTTTAACGGTTAGAAAA
Coding sequences of Glyma.09g077900
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>Glyma.09g077900.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g077900.2.p locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g077900.3.p locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g077900.6.p locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g077900.7.p locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.09g077900
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>Glyma.09g077900.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g077900.2 locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g077900.3 locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g077900.4 locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g077900.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g077900.7 locus=Glyma.09g077900 ID=Glyma.09g077900.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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