Report for Sequence Feature Glyma.09g060600
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm09
Start: 5661672
stop: 5675338
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.09g060600
Database ID Annotation Type Annotation Description Annotation Source Match Score Evidence Code
AT3G28430.1 AT
JGI N/A IEA
KOG2219
KOG
Uncharacterized conserved protein
JGI N/A IEA
PTHR21481 Panther
UNCHARACTERIZED
JGI N/A IEA
PF09758 PFAM
Uncharacterised conserved protein
JGI N/A IEA
Expression Patterns of Glyma.09g060600
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Related Legume Genes
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
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Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.09g060600
Paralog Evidence Comments
Glyma.15g167100 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.09g060600 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma09g06820 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.09g060600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.09g060600.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g060600.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g060600.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g060600.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.09g060600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.09g060600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g060600.1.p locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g060600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g060600.4.p locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.09g060600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
>Glyma.09g060600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g060600.1 locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g060600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g060600.2 locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g060600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g060600.3 locus=Glyma.09g060600 ID=Glyma.09g060600.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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