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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.09g016600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm09
Start:1283601
stop:1290212
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.09g016600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G57520.1AT AtSIP2,SIP2 JGI N/AIEA
2.4.1.82EC galactinol-sucrose galactosyltransferase JGI N/AIEA
PTHR31268PantherFam FAMILY NOT NAMED JGI N/AIEA
PF05691Pfam Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.09g016600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma09g01940 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.09g016600
>Glyma.09g016600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g016600.1.p locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g016600.3.p locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g016600.4.p locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g016600.5.p locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g016600.6.p locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.09g016600.7.p locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.09g016600
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>Glyma.09g016600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g016600.3 locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g016600.4 locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g016600.5 locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g016600.6 locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.09g016600.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g016600.7 locus=Glyma.09g016600 id=Glyma.09g016600.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MAATSTTHLFQTRMFFPPTTIAPLTSPFSTFLGPHQRLLSKGCRRIGQRRRCRHSMFVNAKLLLKDGTLSVNGKDALKGVPENVVVTPFTGSSAFIGATCADASSRLVFKLGVIQDVRLLCLYRFKIWWMIPRVGNSGRDIPIETQMLLMEAREGNSQSSKEHNSYFIFLPVLDGEFRSSLQGNSSNELELCVESGDPEVVTSQFLNAVFMNYGGHPFDLVKESMKVLSEHTGTFSLRETKQMPGMLDCFGWCTWDAFYHSVNPQGIKDGLGSLSEGGTPAKFLIIDDGWQDTVNEFQKDGEPFIEGSQFGGRLISIKENSKFRAVGDVTESGAPVSLKDFVSEIKSSFGLKYVYVWHALLGYWGGLDPNASGTKKYDPKLRYPVQSPGNLANTRDLSIDAMEKYGIGVMDPAKISEFYDDLHSYLVSQNIDGVKVDVQNILETISSGLGGRVLLTRRFQQELEKSISTNFQDNSIICCMAHNTDSTYQYIP*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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