Report for Sequence Feature Glyma.09g002600
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm09
Start: 217752
stop: 224886
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.09g002600
Expression Patterns of Glyma.09g002600
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
Gene information in GlycineMine developed by LIS .
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Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.09g002600
Paralog Evidence Comments
Glyma.12g241700 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.09g002600 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma09g00490 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.09g002600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.09g002600.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TTGATGTTTACAACAACATTAATGTAAAATTGAATTAGAAAAAGGAAAGATATGAGTAAGAGGCGAGAGAGGCTTGACTGTTTGAGACTTGCAGAGATCTGTCTCCATCATATTTTCAACTTGTTCTGCTGCTATTCATTTCTTTTCTCTTGTCTTGCTTTTCCATCCATatgtttcactgtccatggggggcatgggcaccttcgtaaccaaagaaggacaccttcacaggagtaagTTATGTGAAAAAGGAAAAATCGCCTGAGGTGGTTCAAACACTATGGAATCCTGCAATTGTATTGACCCACAAGTGCCAGCTGATGACTTATTGATGAAATACCAATATATCTCTGATTTCTTCATTGCCCTTGCTTATTTCTCAATCCCTTTGGAGCTTATCTACTTTGTTAAGAAATCAGCAGTATTTCCATATAGATGGGTCCTTGTTCAGTTTGGTGCTTTCATTGTTTTATGTGGAGCAACACATCTAATTAATTTATGGACATTTAGAATTCATTCAAGAACTGTGGCTGTTGTAATGACCACTGCTAAGGTTTTAACTGCTGTGGTATCGTGTGCAACTGCCCTCATGCTGGTACATATTATTCCTGATTTATTAAGTGTTAAAACTAGGGAATTATTTTTGAAGAACAAGGCTGCAGAGCTTGATAGAGAAATGGGCCTGATTCGCACACAAGAAGAAACTGGTCGACATGTTAGGATGTTGACTCATGAGATTAGAAGCACTCTTGATAGACACACAATATTGAAAACGACTCTTGTTGAACTGGGTAGAACTTTGGCACTAGAGGAATGTGCGTTATGGATGCCAACACGAACTGGTTTGGAGCTTCAACTCTCTTACACATTGCGACAGCAGAACCCAGTTGGATACACAGTACCCATTCATCTTCCTGTTATCAATCAAGTATTTAGTAGCAACAGGGCAGTAAAAATTTCACCTAATTGTCCAGTTGCTAGATTACGACCTTATGCTGGAAAATACATGCCTGGGGCAGTAGTAGCTGTTCGAGTTCCTCTCCTACATCTTTCTAATTTCCAAATATATGATTGGCCTGAGGTTTCGACAAGAAGTTATGCTTTGATGGTTTTGATGCTTCCATCAGATAGTGCTAGGCAATGGCATGTGCATGAGTTAGAACTGGTTGAGGTAGTCGCTGACCAGGTAGCTGTTGCTCTTTCACATGCTGCAATCTTAGAAGAGTCAATGAGGGCAAGGGATCAGCTCATGGAGCAGAATGTTGCATTGGATCTAGCAAGAAGAGAAGCAGAAACTGCAATTCGTGCTCGTAATGACTTTTTGGCTGTTATGAACCACGAGATGAGAACTCCCATGCATGCAGTTATTGCACTCTCTTCATTACTACAGGAAACAGATTTGACGGCTGAGCAACGTCTGATGGTGGAGACAATATTGAAAAGCAGCAATTTGTTGGCTACCCTCATCAATGACGTTTTGGATCTTTCACGGCTTGAAGATGGCAGTCTTCAACTTGAAGCAACAACATTTAACCTCCATTCTTTGTTCAGAGAGGTCCTTAACTTGATTAAGCCTGTTGCATCTGTTAAAAAGTTATCACTCACTTCACATATAGCCTCAGATTTGCCAATGTATGCCATTGGTGATGAAAAACGTCTCATGCAAACTATTCTGAATGTTGTTGGTAATGCTGTGAAGTTCTCAAAAGAGGGCTGCATTTCCATCTCTGCTTTCGTTGCAAAGCCTGAATCCTTTAGAGATGCTAGAATTCCTGACTTTCTTCCAGTGCTAAGTGATAACCACTTTTATTTGCGAGTACAGGTAAAAGATTCAGGATCAGGAATTAATCCACAAGATATCCCAAAGATATTCACTAAGTTTGCACAAAACCAATCGTTAACAACAAGAAATCCTGCTGGAAGTGGACTTGGCCTGGCAATTTGTAGGAGGTTTGTAAATCTTATGGAAGGACATATTTGGGTTGAAAGCGAAGGTATTGGTAAAGGATGTACAGTCACTTTTATTGTAAAACTTGGAATCCCAGACCGATCAAATGAATTTAAGCTACCTTTTGTACCTAAAGTACCGGGAAATCATGGATCTACAAACTTTGCTGGGCTCAAAGTTCTTGTCACGGATGACAATGGGGTTAGCAGGACAGTAACAAAGGGACTTCTTATGCATTTAGGATGTGATGTAACCACAGCAAGCTCAAGTGAAGAATGTCTGCGTGTTGTTTCTCTGGAACATGAAGTGGTCTTCATGGATGTTTGTGCAGGGTTAGATGGTTATGAACTTGCAATCCGCATACATGAAAAGTTTACTAAACATCAAGATAGACCACTAATAGTTGCTCTTACTGGAAACACCAAAAAGGTAACAAAAGAAAACTGTATGAGGGTTGGTATGGATGGCCTTATATTGAAACCTGTTTCTGTTGACAAAATGAGGGGTGTTTTATCAGAACTATTGGAGCGCCGAGTTCTGTTCGAAACTGTTTAACCTGTTAGATTGTTGTATATAGCTACATCAAATTTGGAGAAACACAAACTTATGAAAACATGAGGCAATTGACATTAATTTTCATCCTTTTTGCTTTTATGAGATCCCGGCGAAAGGAACAACGATTGAGTCTACGTTGTTAAATCATTTTTTATGAACAGAAGTTCGTATATGTTGTATATTCTGCATTTTTATAGCAGTCTTTCAATGTTTTTCAATGGCGGT
>Glyma.09g002600.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.15 sequence-type=transcript locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.09g002600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
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Predicted protein sequences of Glyma.09g002600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
>Glyma.09g002600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.1 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.12 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.13 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.14.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.14 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.15.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.15 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.17.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.17 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.17.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.09g002600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.09g002600.2 locus=Glyma.09g002600 ID=Glyma.09g002600.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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