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Report for Sequence Feature Glyma.08g316100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
Start:42992084
stop:43005799
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g316100
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G27010.1AT JGI N/AIEA
K14861KEGG Ribosome biogenesis JGI N/AIEA
KOG1791 KOG Uncharacterized conserved protein JGI N/AIEA
PTHR13500PantherFam NUCLEOLAR PRERIBOSOMAL-ASSOCIATED PROTEIN 1 JGI N/AIEA
PF11707Pfam Ribosome 60S biogenesis N-terminal JGI N/AIEA
PF16201Pfam Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.08g316100 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g42810 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g316100
>Glyma.08g316100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g316100.1.p locus=Glyma.08g316100 id=Glyma.08g316100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCGGAACCCGCCGCAGTTCCAAACTTGCAACCTAAAGTCAGCCACGAAGCGAAACTGAAAGAACTGCTCCACAGAATCACCTCGCTCGAGATAAAGCTATGCTCCGATGGCGCCAAAGAGTTCGCGAAGCTCCTCAGGTCCGAGACCGGCGCCGACCTCCTCCGAGAGTACGTGCGCGGCTCCCCGAAGTGCTCGGAGCTTCTCGAAGCGTGGAAGCTTCGCGAAGGCAAACAGGGCATGCACTACGTCTTCGACCTAATCTCCGCCATTCTCAGCCACAGAGAAGGTAAGCACAACCCTAGCGACATCGAAAGCGTGAATATCACTAATGATTTGGATAAATTCGCGCGGTTACTTATTTCCGAACGGTTGAGTGATATCCACAAGGAGGTGAACAGCAAAGAGTGGCGGAGACAGAAGGCGGCGTTGTTACTCATGGCTTCGATTGCGCGGCGTGGCGCGAGCTTGGCGTCGGAGGTGGCGAAGAGCTTCGATTTCAAGCTCGCCGAGTTCGGGAGGATTGCGTCGGCGAACCGGAGAAGGAAGCCGGAGGCGAGGGTTGGGTTGTTGAGGAAGCCGTTTGTCGGATTTGCGATGTCGTTTTTGGAGGTCGGGAAGCCGTGGCTGTTGCGGTGGGTTTTGCAGCAGAGAGAGATGTATTCCGGCGTTCTGAGAGGGTTAGGGAGCGATGATGATGAAACTGTGGTGTTTGTGTTAACGGTGTTGAGAGATAGGGTTCTTGTTGAAGAGTCTCTGGTGCAGCCGTGGCTTCGGAGTGTTTTGTTTGGGAGTGCCACATTGGAGCAGTTGGTTGAGGTTTGTGCAAGGGAAGGTGGTGGTGATGCCGCTGAGGTGGCGTTTGGGGTGCTTTTTAGGGTTTGTACTGATCCTAGTAATGGTTTGATGCCGGACTCAAAAATGCGGTTGAAGGGTAATACGAAGAGAATCTTGGATCTCATGAAGAAGCTGCGGGTTACGGAGGTTCAGTATCATAAGGATTTGCTTTTGGCTATTGTTGAGGCCAAGGCTTCTTTTGGGTTGTCGTATTTGAAGGAGTTTCCTTACAACATTGATAATTTCAAGTCTTCTTCATGGATTTCTGCAATATCTGTGGCAGCTCAGTTGGTTTCATTGGTGGGTAATGGCATTTCCAAAGAATCTGTCAATTTTCGATCAAATGGTCCGCACCTGTTTGACAATATGGATTTGCACAGTATTGTGAAGTGCTTGTTTCCTCGTCCATTCAGCAGATCATTGTTTAATAAGGGAATGCCTCACATTGAACCTTATGTGAAACATGGTACTCTAAGGCTTCTTCTGGAGTTACTGAAATTGCTGGACTCTATTTTTGGTGGTTTGAATCGTAATTCTAATACCAACAATCCATTCATGCAACATATGATGTCTATCAAGGACGAAATCCAGAATTATGTTCAAGCTTTTATTCCCGATCTGCAGGTTTTATTAAATCTACTTTCCTCTTTAGATGTCAATTCTGAAGCCTGTAACTCAAGTTTAAAGAGAAATGCATGCCATCATGAACATAATAGCAGCAGTAGGAAGAAGTTAAAACTTGACATTTCGGAGAGTGGTGATATAGATATAGTTGTTGCTGGGATAAGTTCTACTCCAGATATTGATTTAACTGGCAACAGTGGAACAGTTGATGGTGGACCAAGAGCAGATGCTTTGGATGATGAGGAGGATCTCATGAATAGCATAGGGGAAATTTGGGGCGTGGACCTTCGTTCAATGGAAATTAACACATTTGAAGATGTGGAATCATACTTGCTGTCTAAACTGCTTGATGCTCTCAGATATTACCGCCGGGCTCTGCCTTTTTCTTTGGATAATTCTTTTGAAACATTCAAGGGTCTTCTCAAAAGCCCATTGGAATTAACAAGTCATCTGCAGGTCTCAGTGTTGTCCTTGCTTGTGGAATACATTGAATGGTGTCCTGATGATGAAATTCCTATCAGAACTCCACCCATGTTGTACAAATACTTACAACCATTCATTAAATTGTTAATGTTTTCTCCATACAATGAAACAAGGGAACTGGCTTACAAGCTGGCCTTGGCAGCTATGTTCAGTACTGGTGCTTTTGATGGGAATCTTCACGAGATAGAAGCATGGTTTTTATTTTTACCAGGTTATCATGGAAAGAAACCCCCTGTCAAAATCTCGGAGGTTGATGTATTACAGAGTTTGACTCTATTTGTCATATCATTCTTTTGCGATGCTGTTTCTACACTTGGAAATAATTTGATTAAATATTGGGATATTCTTAAGAGTCATGCCCATTGTTTGGAAGGTGGTGAAGATTTATCACCTCAATTTAGCCCTTTTATCATATGTGTGCTAGAGAAGTGTCTAAAGGTGATCCGACCTAAAACAGGATCCTGCTCGTTGCCTAAAAAATCAATGGTATTATTATACACTTGCAATACAGTCAAGTATCTCTTGCAAACACAGGTCAACGCAGGATTGTTATCTGCTTTAGTTCATGCAGACTTGACAGAGAGACTTGGTGGAAGTTATGAATGTGATGAAGTCTTTCCTGAGTGGAAGCCACTGAAGGATTTATTGGACTTTGTGGAGAGCATATTACACCAAAGGAATTATTGCATTTTCTCTAAAAATGAAGAATCTGTCCTTCCTGATAGTTCTTTGGGAAGTGCGCTTGGTAGTGTAAATAGATTGTTGAATTGTGGGTCTGGTCATGGTATTGCTGAAACAACCATAGCTTTCATATCCTCCATTATATTGGAAGGCACCAATAAAATATTGACAAATCTGCCATCACATGTGGTCATACCACGTGACTTAGTTGGAGTTCCTTTCTCACTCTTATTATCAGTACTTTTTCTTGATTATAGTGTTCTTCACCATGCTTCTAAGTTGTGGCCTGTAATGTTTTATGCTGCCTTGGATATGGCCATGTCAGATCTTGGTATTGATGGTCAAAATGCAGCTCCTGTTGAGACTTCTGATCTTACATTGCATCCAGATTCTCTAACTTGTAGCCAACTTTTAGATGCTTCTGAAGTTGATGCTGTTACATTTAGTATCTTTCTAAAACAGGCGCCTTTCCATGTGATATTTCCTGCGATGATGTGTATGAATGGTCCTTACATATCAAAGCTATCTAAAATACAAGAGTTTTTACTGCATAAATTATCTGAGTCAAATGATAGCTTGCTCCTTACCAATCTGCAACTCATTCTGTTCTGGACTCATCGGATTCAGTTATGTTATGAAGTTAACCCAATAGCTGAAGTTGAACAACTTTTGAATCTGTGTGTTATACTTGTAGGGAGCTTGTTAGCTCAATTATTGGTTCCAGAAAGTGGTTCTGACTGGTCTATAAACTCTGCCTTTTATTCATTAAGACATAACATTCAAGAAGTGATTAAAACCATTTTTTGTCATCCTTGTGTTTTGATCTCATTATCCTTTTCTTTGGGAAGTTGTCAGAATCTTTCAAATGGAAATGTAGAGAATGATATCAATATGCTAAATGTAGTATCCAATGAGGGGTTTCACAACTTTGGTAATCCAGTTTTAAAGATATTAACAATGACTCTAGAGTCCATGTGGTCTTTATCTGGTGCCCACCTTTGTGTGTCAACAGCTGAAGATGTTGCTAATAATATTGTGAAGGCATTTAAACGCCTTCAACAAAAACTATTTCTGGATGTCAGAAACAGATTTGAGCTGTACATTCGTACTGAAGATGTGATGCCTCTTCTTCCAACATTGTATGCTTTACATTCTTTGCATCGATTTTTATCCCCTTTTCAGCTCCTTGAATTAGTGAATTGGATGTTCAGTAGAGATGAGTTTGATGATTTGCCAATTAAGAAATCCTCAATATTTGTTGGATGTTCCTTAGCTGCTGATGCTTTCAGTGCTTTATCCATTTATTTTCAGCAGTCAACTGAAAACAGGGCACCGTATGATTTGTTTTGGGAGATGGGTGAAAAGAATATGAAAGCTGATATTTTTGAGCAGATTTACCTCAAGGTAGTTGACTTTTCTGTATGTTATGAAATAGATAGTGCAGATAGATGCTTGCTTGAAGCTGTCAATCTCTTGTATAAGCAGAAACATTTGCAACAAGAAACGTTTCATCCTTTGCTGTTGGTCATGTGGAAAATTATAATGGTTACTCCATTGAAAGTGCTTTCCCATTGCATTTACAAGACTAATGCTAAGAAAGCTACGTTTTTACATATTCTTTCTGAATTGAGTTCCCTCCATTCGTTGATCTTTGGGCATTTATTTTTGGGTACAGTGAATAGAAGTTTACATCATGGTATTGGTGTGATGGAACATACCTTTGATCCTACTCTCTCAGAAGATCAGTTTTTGCTGCTTCTGCCGGCCTCTTTGTCATACTTCAGCTTAATTTCTAAGAGACTTAGAGAGCAGAGTCACAGAGATTTTGAACATTTACCTTACTTTTATTCAAAAATTCTCTTAAAAGGTTTCAGTCAGTGGAAGAGGTTTTCCTCAAAAGATATATTTCAGGAACAATATGGGGAATTCTTTCCATCATCTGCTCAAGAACTTCTGTGTCTTACTGATCTTAGTCTTCTTGGGAAATCAATTCATATGTTAAAGTATCACTTTGCTCATAATGGGGATATGATGAAACTGAAAAAGCGATTAAATCTATTCAAATCCATTTTCCCAAAATTTGATTCACATGATGATCTGATGAACTGTGATTGTCAAGTTATTGATAGTTATTCCCTGCGTCAGTCTTTGAACATCATCAATTGTGTTGTTGCAAAGATATCACTTTGTAAAATATTATTGTTTCATGAAGCAGGTGGGGATTTCAAAGATGTTGCTGTGAAAATGCAAAGCAAATTAGGTAGATGCAGGATACATTTCATAAATATTTTGGTGGATATTTGGCAGTTTATTGTTAAGAAATTTTCGTTAGCTTCTTATCAATGTAGAACTGCAAAAGGCACTAACATTTCATT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>Glyma.08g316100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g316100.2.p locus=Glyma.08g316100 id=Glyma.08g316100.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCGGAACCCGCCGCAGTTCCAAACTTGCAACCTAAAGTCAGCCACGAAGCGAAACTGAAAGAACTGCTCCACAGAATCACCTCGCTCGAGATAAAGCTATGCTCCGATGGCGCCAAAGAGTTCGCGAAGCTCCTCAGGTCCGAGACCGGCGCCGACCTCCTCCGAGAGTACGTGCGCGGCTCCCCGAAGTGCTCGGAGCTTCTCGAAGCGTGGAAGCTTCGCGAAGGCAAACAGGGCATGCACTACGTCTTCGACCTAATCTCCGCCATTCTCAGCCACAGAGAAGGTAAGCACAACCCTAGCGACATCGAAAGCGTGAATATCACTAATGATTTGGATAAATTCGCGCGGTTACTTATTTCCGAACGGTTGAGTGATATCCACAAGGAGGTGAACAGCAAAGAGTGGCGGAGACAGAAGGCGGCGTTGTTACTCATGGCTTCGATTGCGCGGCGTGGCGCGAGCTTGGCGTCGGAGGTGGCGAAGAGCTTCGATTTCAAGCTCGCCGAGTTCGGGAGGATTGCGTCGGCGAACCGGAGAAGGAAGCCGGAGGCGAGGGTTGGGTTGTTGAGGAAGCCGTTTGTCGGATTTGCGATGTCGTTTTTGGAGGTCGGGAAGCCGTGGCTGTTGCGGTGGGTTTTGCAGCAGAGAGAGATGTATTCCGGCGTTCTGAGAGGGTTAGGGAGCGATGATGATGAAACTGTGGTGTTTGTGTTAACGGTGTTGAGAGATAGGGTTCTTGTTGAAGAGTCTCTGGTGCAGCCGTGGCTTCGGAGTGTTTTGTTTGGGAGTGCCACATTGGAGCAGTTGGTTGAGGTTTGTGCAAGGGAAGGTGGTGGTGATGCCGCTGAGGTGGCGTTTGGGGTGCTTTTTAGGGTTTGTACTGATCCTAGTAATGGTTTGATGCCGGACTCAAAAATGCGGTTGAAGGGTAATACGAAGAGAATCTTGGATCTCATGAAGAAGCTGCGGGTTACGGAGGTTCAGTATCATAAGGATTTGCTTTTGGCTATTGTTGAGGCCAAGGCTTCTTTTGGGTTGTCGTATTTGAAGGAGTTTCCTTACAACATTGATAATTTCAAGTCTTCTTCATGGATTTCTGCAATATCTGTGGCAGCTCAGTTGGTTTCATTGGTGGGTAATGGCATTTCCAAAGAATCTGTCAATTTTCGATCAAATGGTCCGCACCTGTTTGACAATATGGATTTGCACAGTATTGTGAAGTGCTTGTTTCCTCGTCCATTCAGCAGATCATTGTTTAATAAGGGAATGCCTCACATTGAACCTTATGTGAAACATGGTACTCTAAGGCTTCTTCTGGAGTTACTGAAATTGCTGGACTCTATTTTTGGTGGTTTGAATCGTAATTCTAATACCAACAATCCATTCATGCAACATATGATGTCTATCAAGGACGAAATCCAGAATTATGTTCAAGCTTTTATTCCCGATCTGCAGGTTTTATTAAATCTACTTTCCTCTTTAGATGTCAATTCTGAAGCCTGTAACTCAAGTTTAAAGAGAAATGCATGCCATCATGAACATAATAGCAGCAGTAGGAAGAAGTTAAAACTTGACATTTCGGAGAGTGGTGATATAGATATAGTTGTTGCTGGGATAAGTTCTACTCCAGATATTGATTTAACTGGCAACAGTGGAACAGTTGATGGTGGACCAAGAGCAGATGCTTTGGATGATGAGGAGGATCTCATGAATAGCATAGGGGAAATTTGGGGCGTGGACCTTCGTTCAATGGAAATTAACACATTTGAAGATGTGGAATCATACTTGCTGTCTAAACTGCTTGATGCTCTCAGATATTACCGCCGGGCTCTGCCTTTTTCTTTGGATAATTCTTTTGAAACATTCAAGGGTCTTCTCAAAAGCCCATTGGAATTAACAAGTCATCTGCAGGTCTCAGTGTTGTCCTTGCTTGTGGAATACATTGAATGGTGTCCTGATGATGAAATTCCTATCAGAACTCCACCCATGTTGTACAAATACTTACAACCATTCATTAAATTGTTAATGTTTTCTCCATACAATGAAACAAGGGAACTGGCTTACAAGCTGGCCTTGGCAGCTATGTTCAGTACTGGTGCTTTTGATGGGAATCTTCACGAGATAGAAGCATGGTTTTTATTTTTACCAGGTTATCATGGAAAGAAACCCCCTGTCAAAATCTCGGAGGTTGATGTATTACAGAGTTTGACTCTATTTGTCATATCATTCTTTTGCGATGCTGTTTCTACACTTGGAAATAATTTGATTAAATATTGGGATATTCTTAAGAGTCATGCCCATTGTTTGGAAGGTGGTGAAGATTTATCACCTCAATTTAGCCCTTTTATCATATGTGTGCTAGAGAAGTGTCTAAAGGTGATCCGACCTAAAACAGGATCCTGCTCGTTGCCTAAAAAATCAATGGTATTATTATACACTTGCAATACAGTCAAGTATCTCTTGCAAACACAGGTCAACGCAGGATTGTTATCTGCTTTAGTTCATGCAGACTTGACAGAGAGACTTGGTGGAAGTTATGAATGTGATGAAGTCTTTCCTGAGTGGAAGCCACTGAAGGATTTATTGGACTTTGTGGAGAGCATATTACACCAAAGGAATTATTGCATTTTCTCTAAAAATGAAGAATCTGTCCTTCCTGATAGTTCTTTGGGAAGTGCGCTTGGTAGTGTAAATAGATTGTTGAATTGTGGGTCTGGTCATGGTATTGCTGAAACAACCATAGCTTTCATATCCTCCATTATATTGGAAGGCACCAATAAAATATTGACAAATCTGCCATCACATGTGGTCATACCACGTGACTTAGTTGGAGTTCCTTTCTCACTCTTATTATCAGTACTTTTTCTTGATTATAGTGTTCTTCACCATGCTTCTAAGTTGTGGCCTGTAATGTTTTATGCTGCCTTGGATATGGCCATGTCAGATCTTGGTATTGATGGTCAAAATGCAGCTCCTGTTGAGACTTCTGATCTTACATTGCATCCAGATTCTCTAACTTGTAGCCAACTTTTAGATGCTTCTGAAGTTGATGCTGTTACATTTAGTATCTTTCTAAAACAGGCGCCTTTCCATGTGATATTTCCTGCGATGATGTGTATGAATGGTCCTTACATATCAAAGCTATCTAAAATACAAGAGTTTTTACTGCATAAATTATCTGAGTCAAATGATAGCTTGCTCCTTACCAATCTGCAACTCATTCTGTTCTGGACTCATCGGATTCAGTTATGTTATGAAGTTAACCCAATAGCTGAAGTTGAACAACTTTTGAATCTGTGTGTTATACTTGTAGGGAGCTTGTTAGCTCAATTATTGGTTCCAGAAAGTGGTTCTGACTGGTCTATAAACTCTGCCTTTTATTCATTAAGACATAACATTCAAGAAGTGATTAAAACCATTTTTTGTCATCCTTGTGTTTTGATCTCATTATCCTTTTCTTTGGGAAGTTGTCAGAATCTTTCAAATGGAAATGTAGAGAATGATATCAATATGCTAAATGTAGTATCCAATGAGGGGTTTCACAACTTTGGTAATCCAGTTTTAAAGATATTAACAATGACTCTAGAGTCCATGTGGTCTTTATCTGGTGCCCACCTTTGTGTGTCAACAGCTGAAGATGTTGCTAATAATATTGTGAAGGCATTTAAACGCCTTCAACAAAAACTATTTCTGGATGTCAGAAACAGATTTGAGCTGTACATTCGTACTGAAGATGTGATGCCTCTTCTTCCAACATTGTATGCTTTACATTCTTTGCATCGATTTTTATCCCCTTTTCAGCTCCTTGAATTAGTGAATTGGATGTTCAGTAGAGATGAGTTTGATGATTTGCCAATTAAGAAATCCTCAATATTTGTTGGATGTTCCTTAGCTGCTGATGCTTTCAGTGCTTTATCCATTTATTTTCAGCAGTCAACTGAAAACAGGGCACCGTATGATTTGTTTTGGGAGATGGGTGAAAAGAATATGAAAGCTGATATTTTTGAGCAGATTTACCTCAAGGTAGTTGACTTTTCTGTATGTTATGAAATAGATAGTGCAGATAGATGCTTGCTTGAAGCTGTCAATCTCTTGTATAAGCAGAAACATTTGCAACAAGAAACGTTTCATCCTTTGCTGTTGGTCATGTGGAAAATTATAATGGTTACTCCATTGAAAGTGCTTTCCCATTGCATTTACAAGACTAATGCTAAGAAAGCTACGTTTTTACATATTCTTTCTGAATTGAGTTCCCTCCATTCGTTGATCTTTGGGCATTTATTTTTGGGTACAGTGAATAGAAGTTTACATCATGGTATTGGTGTGATGGAACATACCTTTGATCCTACTCTCTCAGAAGATCAGTTTTTGCTGCTTCTGCCGGCCTCTTTGTCATACTTCAGCTTAATTTCTAAGAGACTTAGAGAGCAGAGTCACAGAGATTTTGAACATTTACCTTACTTTTATTCAAAAATTCTCTTAAAAGGTTTCAGTCAGTGGAAGAGGTTTTCCTCAAAAGATATATTTCAGGAACAATATGGGGAATTCTTTCCATCATCTGCTCAAGAACTTCTGTGTCTTACTGATCTTAGTCTTCTTGGGAAATCAATTCATATGTTAAAGTATCACTTTGCTCATAATGGGGATATGATGAAACTGAAAAAGCGATTAAATCTATTCAAATCCATTTTCCCAAAATTTGATTCACATGATGATCTGATGAACTGTGATTGTCAAGTTATTGATAGTTATTCCCTGCGTCAGTCTTTGAACATCATCAATTGTGTTGTTGCAAAGATATCACTTTGTAAAATATTATTGTTTCATGAAGCAGGTGGGGATTTCAAAGATGTTGCTGTGAAAATGCAAAGCAAATTAGGTAGATGCAGGATACATTTCATAAATATTTTGGTGGATATTTGGCAGTTTATTGTTAAGAAATTTTCGTTAGCTTCTTATCAATGTAGAACTGCAAAAGGCACTAACATTTCATT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Predicted protein sequences of Glyma.08g316100
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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