SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.08g228800

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
Start:18757784
stop:18764361
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g228800
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G04930.1AT ALA1 JGI N/AIEA
3.6.3.1EC JGI N/AIEA
GO:0015914GO-bp phospholipid transport JGI N/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane JGI N/AIEA
GO:0000166GO-mf nucleotide binding JGI N/AIEA
GO:0000287GO-mf magnesium ion binding JGI N/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
GO:0046872GO-mf metal ion binding JGI N/AIEA
K14802KEGG Ribosome biogenesis JGI N/AIEA
PTHR24092PantherFam PROBABLE PHOSPHOLIPID-TRANSPORTING ATPASE JGI N/AIEA
PF00122Pfam E1-E2 ATPase JGI N/AIEA
PF12710Pfam haloacid dehalogenase-like hydrolase JGI N/AIEA
PF16209Pfam Phospholipid-translocating ATPase N-terminal JGI N/AIEA
PF16212Pfam Phospholipid-translocating P-type ATPase C-terminal JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.08g228800 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g24580 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g228800
>Glyma.08g228800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g228800.1.p locus=Glyma.08g228800 id=Glyma.08g228800.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g228800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g228800.2.p locus=Glyma.08g228800 id=Glyma.08g228800.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g228800.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g228800.4.p locus=Glyma.08g228800 id=Glyma.08g228800.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGACCCGAAAACCCCATATGAGAATTCTTCCAATTTTGATTCTTTCATGTTCAACTCGTCATCACCTAGAAGTGACATGTCCATTCAGTCTAGGAGTTCTGGCAGGGACAACTCCACCCGTGAAGTGAGTTTCGGCCACACAGGATCCAAGCCTGTGAGGCATGGGTCAAATTCTGAAGGTCTAAGCATGTCTCAGAAGGAAATCAGTGATGAGGATGCAAGGTTGGTTTATGTTGATGATCCTGAGAAGACAAATGAAAGGCTCAAATTCGCGGGGAATTCGATTCGAACCGGGAAGTACTCCATCTTCACCTTTCTTCCAAGGAATTTGTTTGAACAGTTTCGTAGAGTTGCTTATATTTACTTCCTTGTAATTGCCATTCTCAATCAGCTCCCTCAGTTGGCTGTCTTTGGGAGGGGTGTTTCCATTATGCCATTGACCTTTGTCCTTGTTGTTACTGCTGTGAAGGATGCATTTGAGGACTGGAGGAAGCACAGGTCAGACAAAATTGAGAACAACAGGTTAGCATTGGTTTTGGTTAATGGTCAGTTTCAAGAGAAGAAGTGGAAGGATGTCAGGGTTGGGGAGGTCATTAAAATAAGTGCAAATGAAACAATTCCTTGTGATATTGTGTTGCTATCAACTAGTGACCCTACTGGGGTTGCTTATGTGCAGACTATTAATCTGGATGGAGAGTCTAATTTGAAGACTAGGTACACGAAACAAGAGACTCAATCTATGTTTCCTGAAAAGGAGAGGTTGAATGGATTGATTGTGTGTGAGAAACCCAATAGGAATATATATGGGTTTCAGGGTTATATGGAAATTGATGGAAAGAGATTGTCTCTTGGATCCTCCAACATTGTCATTAGAGGCTGCCAGCTCAAGAATACTAATTGGGCACTTGGCGTTGCCGTGTATTGTGGCAGAGAGACCAAAGCTATGCTCAACAGCTCTGGAGCTCCATCGAAAAGGAGCCTTCTCGAGACTCGCATGAACTCTGAGATCATTATGCTTTCTTTCTTTCTTATAGCTTTGTGCACAGTCACCTCAGTTTGTGTTGCTGTTTGGTTAAAGCGCCACAAGGATGAGTTGAATCTCTCCCCGTATTATAGGAAAATGGATGTTTCAGAGGGGGAAGAGGATAGCTATAAATATTATGGATGGGTACTGGAAATTGTTTTCACTTTCCTCATGTCAATTATAGTGTTTCAGATTATGATCCCCATATCCTTGTACATTTCCATGGAGCTTGTCCGTGTTGGTCAGGCATACTTCATGATCCGAGACTCGAGAATGTATGATAAGGCGACAGATTCAGGATTTCAGTGCAGGGCTTTGAATATTAATGAAGATTTGGGCCAAATTAAATATGTCTTTTCTGACAAAACTGGTACACTGACTGAGAACAAGATGGAGTTTCAATGCGCGAGCATCTTGGGGTTTGATTACAGTTCTGCAAAAATGGGTCCTGAGAATGAGCAAGTTGAATACTCTGTTCAAGAGGATGGGAAGGTCTTTAAGCCAAAGATGAGGGTGAAAGTTAACCAAGAGCTTTTGCAATTATCAAAAAGTGGATTTGCAAATAGAGAGGGGAAACAGATTTATGATTTCTTTCTAGCATTGGCAGCCTGCAATACCATTGTGCCTCTTGTTGTTGACACATCCGATCCTATGGTCAAGCTAATAGATTACCAAGGGGAATCACCAGATGAACAAGCGTTGGCTTATGCTGCCGCTGCCTATGGTTTTATGCTTATTGAACGAACCTCAGGTCACATAGTCGTTAATATTCATGGAGAAAAACAAAGGTTCAATGTCTTAGGTTTGCATGAATTTGATAGTGATCGAAAAAGGATGACAGTTATATTAGGGTACAGTAACAATTCTGTGAAACTTTTTGTTAAAGGGGCAGATACATCCATGTTTAGTGTGATAGACAAATCATTGAACTCAGATATACTACAAGCAACTGAAACCCATCTTCACTCTTATTCCTCTGTGGGTTTGAGGACACTTGTTATTGGCATGCGTGACTTGAATGCTTCAGAATTTGAGCAATGGCACTCTGCCTTTGAGGCAGCAAGTACTGCTTTGATTGGTAGGGCCTCTATGCTTCGCAAGGTTGCTATCAATGTAGAGAACAATCTCTGCATATTGGGTGCAACTGCTATTGAAGATAAACTGCAGCAAGGCGTACCAGAATCCATTGAGTCTCTAAGGACTGCAGGTATTAAAGTATGGGTCTTGACTGGGGACAAACAGCAAACTGCCATATCAATTGGATGCTCCTCGAAGCTCCTAACGAGCAACATGACTCAAATTATAATTAATACCAACAATAGAGAGTCATGTAGAAGATGTTTGCAAGACGCCCTTGTCATGTCTAGAAAACACATGACTGTGCCTGGGGTTACTCACAATTCTGAAGGAAGATCAGATGCTGTTTCAACTCCATTAGCCTTGATTATTGATGGTACCAGCCTTGTTTATATTCTTGACAGCGAGCTTGAAGAAGAGCTCTTTCAACTAGCAAATAGATGTTCTGTTGTTCTCTGTTGTCGAGTGGCTCCGCTGCAGAAGGCTGGGATTGTAGCCCTTGTGAAGAATAGGACCGATGACATGACACTAGCCATTGGAGATGGTGCTAATGACGTATCAATGATCCAAATGGCTCATGTTGGAGTTGGAATCAGTGGACAGGAGGGTCGGCAAGCTGTAATGGCTTCAGATTTTGCAATTGGGCAGTTTAGGCTTTTAGTTCCTCTCTTATTAATACATGGGCATTGGAATTACCAACGACTGGGTTACATGATAATATACAACTTCTACAGAAATGCTATCTTTGTTCTTGTCCTATTTTGGTATGTGCTCTTTACTGCTTTCTCTTTGACAACTGCTATAAATGAATGGAGCAGCGTGTTATATTCAATAATTTACTCTGCAGTTCCAACTATTGTTGTTGGTGTTCTTGACAAGGATCTTAGTAAAAGGACTCTCCTAAAGCATCCTCAGCTTTATGGGGCTGGGCTGAGACAGGAGGCCTACAACAAAAAGTTGTTTTGGTTGTCAATGGCCGATACTTTGTGGCAAAGCATTGCTGTTTTCTTTACTCCCCTAATCGCATATTGGGGAACCACTGAAGATGTAGCAAGCATAGGAGATCTTTGGACTCTTTCAGTGGTTATTTTGGTTAATTTGCACTTGGCCATGGATGTCATCAGGTGGAATTGGATTACGCATGCAGCAATTTGGGGCTCTATAGTTGCAACTTTCATTTGTATCATTATTATTGATGCTATACCAGCCTTTCCTGGTTTCTGGTATGTGCTATCTTTTCCTGTTCTCTCCCTTTGA
Predicted protein sequences of Glyma.08g228800
>Glyma.08g228800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g228800.1 locus=Glyma.08g228800 id=Glyma.08g228800.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g228800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g228800.2 locus=Glyma.08g228800 id=Glyma.08g228800.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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