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Report for Sequence Feature Glyma.08g174100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
Start:13981058
stop:13988374
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g174100
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G17210.1AT ATILP1,ILP1 JGI N/AIEA
GO:0005634GO-cc nucleus JGI N/AIEA
GO:0008270GO-mf zinc ion binding JGI N/AIEA
KOG4765 KOG Uncharacterized conserved protein JGI N/AIEA
PTHR15835PantherFam NUCLEAR-INTERACTING PARTNER OF ALK JGI N/AIEA
PTHR15835:SF6PantherFam NUCLEAR-INTERACTING PARTNER OF ALK JGI N/AIEA
PF07967Pfam C3HC zinc finger-like JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.08g174100 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g18570 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g174100
>Glyma.08g174100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g174100.1.p locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g174100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g174100.2.p locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g174100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g174100.3.p locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g174100.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g174100.6.p locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.08g174100
>Glyma.08g174100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g174100.1 locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g174100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g174100.3 locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g174100.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g174100.5 locus=Glyma.08g174100 id=Glyma.08g174100.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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