Report for Sequence Feature Glyma.08g140100
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm08
Start: 10718408
stop: 10726408
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.08g140100
Proteins Associated with Glyma.08g140100
Locus Gene Symbol Protein Name
BZIP24 bZIP transcription factor
bZIP64 Basic leucine zipper transcription factor-like protein gene 64
Expression Patterns of Glyma.08g140100
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.08g140100
Paralog Evidence Comments
Glyma.05g182500 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.08g140100 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma08g14840 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.08g140100
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
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>Glyma.08g140100.18 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g140100 ID=Glyma.08g140100.18.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.08g140100
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
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Predicted protein sequences of Glyma.08g140100
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
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>Glyma.08g140100.14.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g140100.14 locus=Glyma.08g140100 ID=Glyma.08g140100.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.08g140100.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g140100.9 locus=Glyma.08g140100 ID=Glyma.08g140100.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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