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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G78130.1 | AT | Major facilitator superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
AT5G10190.1 | AT | Major facilitator superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0055085 | GO-bp | transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0055085 | GO-bp | transmembrane transport | JGI | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | JGI | N/A | IEA |
GO:0022857 | GO-mf | transmembrane transporter activity | JGI | N/A | IEA |
KOG1330 | KOG | Sugar transporter/spinster transmembrane protein | JGI | N/A | IEA |
PTHR24003 | Panther | MAJOR FACILITATOR SUPERFAMILY DOMAIN-CONTAINING PROTEIN-RELATED | JGI | N/A | IEA |
PTHR24003:SF22 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF07690 | PFAM | Major Facilitator Superfamily | JGI | N/A | IEA |
Glyma.08g136800 not represented in the dataset |
Glyma.08g136800 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma08g14530 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.08g136800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g136800.1.p locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g136800.2.p locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g136800.4.p locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g136800.5.p locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g136800.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g136800.6.p locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGAGAGAGCAGACGAGTCTCTGCTTCCAGGAGTGTACAAAGAGATTGGTGCTGCTCTGAACGCAGATCCCACTGCGCTAGGTTCACTCACTTTCTTCAGATCAATTGTTCAATCTTTATGTTACCCACTCGCTGCATACCTCGCCACTCGTCACAATCGTGCGCATGTCATAGCTCTCGGTGCTTTTCTTTGGGCCGCTGCCACATTCTTTGTTGCCATCTCCTCCACCTTCTTACAGGTAGCAATTTCGAGAGGTTTAAATGGGATTGGACTAGCCCTTGTTACTCCAGCAATTCAGTCCCTTGTTGCAGATTCCACAGTTGATAGCAATCGTGGTATGGCTTTTGGGTGGCTGCAACTAACAGGAAATTTTGGAAGCATCATTGGTGGGCTCTTTGCCGTGCTTATTGCCCCAACCTCATTTAAGGGTATACCTGGGTGGAGAATAGCTTTTCATCTGGTTGCATTGATTAGTGTTATAGTGGGTATATTGGTTTGCCTCTTCGCTAATGATCCACGCTTTTCAAAGGCCAGAGAGAGAGCAACAACATATGAAGCTCCAAACAAGTCCTTTTGTTCTGATATGAAAGACCTAATGAAAGAAGCGAAGTCAGTAATTGGAAATCCATCATTTCAGATAATTGTGGCTCAGGGAGTGTTTGGAACATTTCCAGGGTCAAGCTTGTCATTTGCCACTCTTTGGTTAGAACTAATAGGCTTCCCCCGCGTGACAACTGCATTCCTTTGGACACTATACGTGGTTGCTACTTCATTTGGGGGTCTATTTGGAGGAAGGATGGGGGATATTTTATCCCAACGGTTTCCAAACTCTGGGAGAATATTGTTGTCACAAATAAGCTCCAGTTCAGCAATTCCTCTTGCTGCAATTTTGTTGTTGGGATTGCCTTATGATCCATCCACGGCCTTCAAGCACGGTCTGCTTTTATTTATCATGGGGTTAATAAGATCCTGGAATGCTCCAGCCACTAACAAAAATAGTCCCTGA
>Glyma.08g136800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g136800.1 locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MKMKAETLTLVLVNLAGIMERADESLLPGVYKEIGAALNADPTALGSLTFFRSIVQSLCYPLAAYLATRHNRAHVIALGAFLWAAATFFVAISSTFLQVAISRGLNGIGLALVTPAIQSLVADSTVDSNRGMAFGWLQLTGNFGSIIGGLFAVLIAPTSFKGIPGWRIAFHLVALISVIVGILVCLFANDPRFSKARERATTYEAPNKSFCSDMKDLMKEAKSVIGNPSFQIIVAQGVFGTFPGSSLSFATLWLELIGFPRVTTAFLWTLYVVATSFGGLFGGRMGDILSQRFPNSGRILLSQISSSSAIPLAAILLLGLPYDPSTAFKHGLLLFIMGLIRSWNAPATNNPIFAEIVPEKSRTTIYALDRSFETILSSFAPPIVGALAQHVYGYKPITKGSSDEIEKDRENAASLAKALYTAISIPSVLCVSIYSFLYCTYPRDRERARMEALVESEMQQLQVEDYNDVDYPREEDDNDEKVLLSR* >Glyma.08g136800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g136800.2 locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MERADESLLPGVYKEIGAALNADPTALGSLTFFRSIVQSLCYPLAAYLATRHNRAHVIALGAFLWAAATFFVAISSTFLQVAISRGLNGIGLALVTPAIQSLVADSTVDSNRGMAFGWLQLTGNFGSIIGGLFAVLIAPTSFKGIPGWRIAFHLVALISVIVGILVCLFANDPRFSKARERATTYEAPNKSFCSDMKDLMKEAKSVIGNPSFQIIVAQGVFGTFPGSSLSFATLWLELIGFPRVTTAFLWTLYVVATSFGGLFGGRMGDILSQRFPNSGRILLSQISSSSAIPLAAILLLGLPYDPSTAFKHGLLLFIMGLIRSWNAPATNNPIFAEIVPEKSRTTIYALDRSFETILSSFAPPIVGALAQHVYGYKPITKGSSDEIEKDRENAASLAKALYTAISIPSVLCVSIYSFLYCTYPRDRERARMEALVESEMQQLQVEDYNDVDYPREEDDNDEKVLLSR* >Glyma.08g136800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g136800.3 locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MYYGESRRVSASRSVQRDWCCSERRSHCARFTHFLQINCSIFMLPTRCIPRHSSQSCACHSSRCFSLGRCHILCCHLLHLLTDSTVDSNRGMAFGWLQLTGNFGSIIGGLFAVLIAPTSFKGIPGWRIAFHLVALISVIVGILVCLFANDPRFSKARERATTYEAPNKSFCSDMKDLMKEAKSVIGNPSFQIIVAQGVFGTFPGSSLSFATLWLELIGFPRVTTAFLWTLYVVATSFGGLFGGRMGDILSQRFPNSGRILLSQISSSSAIPLAAILLLGLPYDPSTAFKHGLLLFIMGLIRSWNAPATNNPIFAEIVPEKSRTTIYALDRSFETILSSFAPPIVGALAQHVYGYKPITKGSSDEIEKDRENAASLAKALYTAISIPSVLCVSIYSFLYCTYPRDRERARMEALVESEMQQLQVEDYNDVDYPREEDDNDEKVLLSR* >Glyma.08g136800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g136800.4 locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MERADESLLPGVYKEIGAALNADPTALGSLTFFRSIVQSLCYPLAAYLATRHNRAHVIALGAFLWAAATFFVAISSTFLQVAISRGLNGIGLALVTPAIQSLVADSTVDSNRGMAFGWLQLTGNFGSIIGGLFAVLIAPTSFKGIPGWRIAFHLVALISVIVGILVCLFANDPRFSKARERATTYEAPNKSFCSDMKDLMKEAKSVIGNPSFQIIVAQGVFGTFPGSSLSFATLWLELIGFPRVTTAFLWTLYVVATSFGGLFGGRMGDILSQRFPNSGRILLSQISSSSAIPLAAILLLGLPYDPSTAFKHGLLLFIMGLIRSWNAPATNNPIFAEIVPEKSRTTIYALDRSFETILSSFAPPIVGALAQHVYGYKPITKGSSDEIEKDRENAASLAKALYTAISIPSVLCVSIYSFLYCTYPRDRERARMEALVESEMQQLQVEDYNDVDYPREEDDNDEKVLLSR* >Glyma.08g136800.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g136800.5 locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MERADESLLPGVYKEIGAALNADPTALGSLTFFRSIVQSLCYPLAAYLATRHNRAHVIALGAFLWAAATFFVAISSTFLQVAISRGLNGIGLALVTPAIQSLVADSTVDSNRGMAFGWLQLTGNFGSIIGGLFAVLIAPTSFKGIPGWRIAFHLVALISVIVGILVCLFANDPRFSKARERATTYEAPNKSFCSDMKDLMKEAKSVIGNPSFQIIVAQGVFGTFPGSSLSFATLWLELIGFPRVTTAFLWTLYVVATSFGGLFGGRMGDILSQRFPNSGRILLSQISSSSAIPLAAILLLGLPYDPSTAFKHGLLLFIMGLIRSWNAPATNKNSP* >Glyma.08g136800.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g136800.6 locus=Glyma.08g136800 ID=Glyma.08g136800.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MERADESLLPGVYKEIGAALNADPTALGSLTFFRSIVQSLCYPLAAYLATRHNRAHVIALGAFLWAAATFFVAISSTFLQVAISRGLNGIGLALVTPAIQSLVADSTVDSNRGMAFGWLQLTGNFGSIIGGLFAVLIAPTSFKGIPGWRIAFHLVALISVIVGILVCLFANDPRFSKARERATTYEAPNKSFCSDMKDLMKEAKSVIGNPSFQIIVAQGVFGTFPGSSLSFATLWLELIGFPRVTTAFLWTLYVVATSFGGLFGGRMGDILSQRFPNSGRILLSQISSSSAIPLAAILLLGLPYDPSTAFKHGLLLFIMGLIRSWNAPATNKNSP*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||