SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.08g097600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
Start:7463843
stop:7468538
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g097600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G42170.1AT JGI N/AIEA
GO:0003677GO-mf DNA binding JGI N/AIEA
GO:0046983GO-mf protein dimerization activity JGI N/AIEA
KOG1121 KOG Tam3-transposase (Ac family) JGI N/AIEA
PTHR23272PantherFam BED FINGER-RELATED JGI N/AIEA
PF05699Pfam hAT family C-terminal dimerisation region JGI N/AIEA
PF14372Pfam Domain of unknown function (DUF4413) JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.08g097600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g10320 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g097600
>Glyma.08g097600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g097600.1.p locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g097600.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g097600.2.p locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTGATAGTAGTGGGTCTATGGGGGCAAGTTGTCCCACTGCACCAATAAGGGGACAACGAACTCCACCGGAATCTGAATCACCTGCTGACTCCAACACTCAATCTTCATCCGAAGGTTCGCAGGAGGTGCGTAGCAAAATTAAACGTAGTCATGAGCTTGTGGATCAATTCAACCAAGAAAAATTTAATTCTGCGATTACAAGGATGATTATCGTTGATATGCTTCCATTTGAATTTGTTGAAAATCCCGGATTTAGAGAATTTAGTGCTCTGCTAGCAGCTCCAGTGGAATCATTTGGAGAATTTTTTAGCGCTCTTCTGACAATTCCAACGGAATCACCTGTTGTGGCATCTTTGCAAGAGTTAGGTAACAATTTGACTTATGATGAGCTTGTGGAATTCCACCAAGAGTTTTGTACACAAGCGCTTGCGAAGATGATTATCATTGATGAACTTCCTTTTAAATTTGTTGAAAATAAAGGATTTGGAGAATTTGTTACTGCTTTTCAACCTCAATTTAAAATTCCCAGTCAGATAACCATTGTTGAAGATTGCATGAATTTGCACAGGGTGGCAAAAGCGAAATTGAAATTCAATTTGTCTCAAAACAAACAAATGATGTCATTGACTACTGATACTTGGACTTCAATCCATAATAAGAATTATCTGTGTGTGACTGCCCACTGTATTGATGAACGGTGGGAATTAATCAAGATGATTTTGAGTTTTGTATTGATTCCTGACCATAAGGGAGACACCATAGGTAAAGCTTTAGAGAAATGCTTGAAAGAGTGGGAAATTACCAAAATTTGTACTATTACAGTACATAATGCTGATACTGAGAATTTGGCTTCATCGTATTTAATTCAAAATATGTGTGGTTGGAATGGCACTACCTTACTGAATGGGGAGCATGTGCACTTGAGGTGTTGTACCCATATATTGAACTCAATTGTGTCTGATGGATTACAAGAAATGGATTGTTGCATTGCAAGAATAAGGGCTGCATGTAAGTATGTTAGGTCATTTTCATCTAGATATGCGTGTTTTAAGAGGTGTGCCAATTTGGCAAATATAAACTGTGATCAAATGATTGTGCTTGATGAGCCAACAAAGTGGAATTCCACCTATTTAATGTTGGTGGTTGCTGAAAAGTTTGAAAAGGCCTTTAACCTCCTTGAATTTGAGGATGATTCTTATGTGAAATCTCTTGATAATGAAGGGGGACCTCCAAGTGCTGATGATTGGAATCGTGCACGTGTATTTATTAAGGTTTTAAAGGTTTTTTATGAGGCTACACTTTCTTTCTCTGGTTATTTGAATGTAAGTTCTAACTCTTTCTTGCGGATGTGGGTCAAGATTCAAAATGCGTTGAGATCATGGATGGAGAATGATGATTTTGGGCTGCAACAGATGGCAACTACTATGAAATTGAAATTTGACAAGTATTGGGATATTGATGGGAATATTAATAATCTGTTGTTTGTGGCTATTTTTCTTGATCCACGATTCAAGTTTAAATATCTTGAATTCTGTTTTGGGAGAATGTATGGTCCTGAAAAATGCAAGGACATGCTTAAAAAGTTGGAAGATTTCATAAAAGAATTGTTCACACAGTATAGTTCATCGCATCCTATTATTCCTGATATTTGTGAGTCTAGTGGCCTATCCTTTGATGTTACCTCCCAAACAATTGTGAGTAATGATGATGGTGGTAATATGGATATGGATGAGGAGTATGGAATAACAGTGAAGAAAATGCTAGATGAACTTGAGAAAAATGAGCTAGAGAGATACATGAAGGATCATGTAGAGGTTAATTATGATGGATTTGACATTTTGAGATGGTGGAAAGGCAAGTCCACTAAGTATTATGTTCTTGCACACATGGCTAGGGATATATTAGCCATTCCAGTGTCTAGCGTGTCTTTTGAGGATGCATTTAGCACAGGGGATCATGTCCTTGATCGATACCATAGTTGTTTGGATCCTACCACAGTCGAGGCTTTGATCTGTTCAAAAAGCTGGTTGAGCCACAACTTAAGAAAGAACTGGGATTCACATCAAACATTTGATGTGGTGCAAGCTGAAAGAGATATGTTAGAAGATTCAGACCTTGAGGAGTATGATGCTACCACACTTGAGGCTTTGGTCTGTTTAAATAGCTGGTTGAGTGACGACATAGGAAAGAATGGGGATTCACATTAA

>Glyma.08g097600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g097600.3.p locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCCCTACCTTACTGCACTGCCTCTGCCTCTGCCGCGTTCCTTCTCCTTACTTCCAGGCGTTGCGCTCACTAGCTTCATGTTCAGCTTCGACACTCCAACTCTTACCATGACTTCTTTTCAGAAGAGTGCAAACATGGCTGATAGTAGTGGGTCTATGGGGGCAAGTTGTCCCACTGCACCAATAAGGGGACAACGAACTCCACCGGAATCTGAATCACCTGCTGACTCCAACACTCAATCTTCATCCGAAGGTTCGCAGGAGGTGCGTAGCAAAATTAAACGTAGTCATGAGCTTGTGGATCAATTCAACCAAGAAAAATTTAATTCTGCGATTACAAGGATGATTATCGTTGATATGCTTCCATTTGAATTTGTTGAAAATCCCGGATTTAGAGAATTTAGTGCTCTGCTAGCAGCTCCAGTGGAATCATTTGGAGAATTTTTTAGCGCTCTTCTGACAATTCCAACGGAATCACCTGTTGTGGCATCTTTGCAAGAGTTAGGTAACAATTTGACTTATGATGAGCTTGTGGAATTCCACCAAGAGTTTTGTACACAAGCGCTTGCGAAGATGATTATCATTGATGAACTTCCTTTTAAATTTGTTGAAAATAAAGGATTTGGAGAATTTGTTACTGCTTTTCAACCTCAATTTAAAATTCCCAGTCAGATAACCATTGTTGAAGATTGCATGAATTTGCACAGGGTGGCAAAAGCGAAATTGAAATTCAATTTGTCTCAAAACAAACAAATGATGTCATTGACTACTGATACTTGGACTTCAATCCATAATAAGAATTATCTGTGTGTGACTGCCCACTGTATTGATGAACGGTGGGAATTAATCAAGATGATTTTGAGTTTTGTATTGATTCCTGACCATAAGGGAGACACCATAGGTAAAGCTTTAGAGAAATGCTTGAAAGAGTGGGAAATTACCAAAATTTGTACTATTACAGTACATAATGCTGATACTGAGAATTTGGCTTCATCGTATTTAATTCAAAATATGTGTGGTTGGAATGGCACTACCTTACTGAATGGGGAGCATGTGCACTTGAGGTGTTGTACCCATATATTGAACTCAATTGTGTCTGATGGATTACAAGAAATGGATTGTTGCATTGCAAGAATAAGGGCTGCATGTAAGTATGTTAGGTCATTTTCATCTAGATATGCGTGTTTTAAGAGGTGTGCCAATTTGGCAAATATAAACTGTGATCAAATGATTGTGCTTGATGAGCCAACAAAGTGGAATTCCACCTATTTAATGTTGGTGGTTGCTGAAAAGTTTGAAAAGGCCTTTAACCTCCTTGAATTTGAGGATGATTCTTATGTGAAATCTCTTGATAATGAAGGGGGACCTCCAAGTGCTGATGATTGGAATCGTGCACGTGTATTTATTAAGGTTTTAAAGGTTTTTTATGAGGCTACACTTTCTTTCTCTGGTTATTTGAATGTAAGTTCTAACTCTTTCTTGCGGATGTGGGTCAAGATTCAAAATGCGTTGAGATCATGGATGGAGAATGATGATTTTGGGCTGCAACAGATGGCAACTACTATGAAATTGAAATTTGACAAGTATTGGGATATTGATGGGAATATTAATAATCTGTTGTTTGTGGCTATTTTTCTTGATCCACGATTCAAGTTTAAATATCTTGAATTCTGTTTTGGGAGAATGTATGGTCCTGAAAAATGCAAGGACATGCTTAAAAAGTTGGAAGATTTCATAAAAGAATTGTTCACACAGTATAGTTCATCGCATCCTATTATTCCTGATATTTGTGAGTCTAGTGGCCTATCCTTTGATGTTACCTCCCAAACAATTGTGAGTAATGATGATGGTGGTAATATGGATATGGATGAGGAGTATGGAATAACAGTGAAGAAAATGCTAGATGAACTTGAGAAAAATGAGCTAGAGAGATACATGAAGGATCATGTAGAGGTTAATTATGATGGATTTGACATTTTGAGATGGTGGAAAGGCAAGTCCACTAAGTATTATGTTCTTGCACACATGGCTAGGGATATATTAGCCATTCCAGTGTCTAGCGTGTCTTTTGAGGATGCATTTAGCACAGGGGATCATGTCCTTGATCGATACCATAGTTGTTTGGATCCTACCACAGTCGAGGCTTTGATCTGTTCAAAAAGCTGGTTGAGCCACAACTTAAGAAAGAACTGGGATTCACATCAAACATTTGATGTGGTGCAAGCTGAAAGAGATATGTTAGAAGATTCAGACCTTGAGGAGTATGATGCTACCACACTTGAGGCTTTGGTCTGTTTAAATAGCTGGTTGAGTGACGACATAGGAAAGAATGGGGATTCACATTAA

>Glyma.08g097600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g097600.4.p locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.08g097600
>Glyma.08g097600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g097600.1 locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g097600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g097600.2 locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g097600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g097600.3 locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g097600.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g097600.4 locus=Glyma.08g097600 id=Glyma.08g097600.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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