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Report for Sequence Feature Glyma.08g087600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
Start:6635477
stop:6651826
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g087600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G55860.2AT UPL1 JGI N/AIEA
6.3.2.19EC JGI N/AIEA
GO:0004842GO-mf ubiquitin-protein transferase activity JGI N/AIEA
K10592KEGG Ubiquitin system JGI N/AIEA
PTHR11254PantherFam HECT DOMAIN UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE JGI N/AIEA
PF00627Pfam UBA/TS-N domain JGI N/AIEA
PF00632Pfam HECT-domain (ubiquitin-transferase) JGI N/AIEA
PF06012Pfam Domain of Unknown Function (DUF908) JGI N/AIEA
PF06025Pfam Domain of Unknown Function (DUF913) JGI N/AIEA
PF14377Pfam Ubiquitin binding region JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.08g087600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g09270 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g087600
>Glyma.08g087600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g087600.3.p locus=Glyma.08g087600 id=Glyma.08g087600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.08g087600
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>Glyma.08g087600.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g087600.5 locus=Glyma.08g087600 id=Glyma.08g087600.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g087600.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g087600.6 locus=Glyma.08g087600 id=Glyma.08g087600.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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