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Report for Sequence Feature Glyma.08g072100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
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Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g072100
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G64220.2AT JGI N/AIEA
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GO:0003677GO-mf DNA binding JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
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PF00612Pfam IQ calmodulin-binding motif JGI N/AIEA
PF01833Pfam IPT/TIG domain JGI N/AIEA
PF03859Pfam CG-1 domain JGI N/AIEA

Proteins Associated with Glyma.08g072100
LocusGene SymbolProtein Name
CAMTA4 Calmodulin binding transcription activator 4

Gene model name correspondences to Glyma.08g072100 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g07680 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g072100
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>Glyma.08g072100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g072100.2.p locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g072100.3.p locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g072100.4.p locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g072100.5.p locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g072100.6.p locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g072100.7.p locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.08g072100
>Glyma.08g072100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g072100.1 locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g072100.2 locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g072100.4 locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g072100.5 locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g072100.6 locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.08g072100.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g072100.7 locus=Glyma.08g072100 id=Glyma.08g072100.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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