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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G66250.1 | AT | O-Glycosyl hydrolases family 17 protein | JGI | N/A | IEA |
AT2G01630.1 | AT | O-Glycosyl hydrolases family 17 protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0005975 | GO-bp | carbohydrate metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005975 | GO-bp | carbohydrate metabolic process | JGI | N/A | IEA |
GO:0008152 | GO-bp | metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0046658 | GO-cc | anchored component of plasma membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0004553 | GO-mf | hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0004553 | GO-mf | hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds | JGI | N/A | IEA |
GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016798 | GO-mf | hydrolase activity, acting on glycosyl bonds | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0030247 | GO-mf | polysaccharide binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
PTHR16631 | Panther | FAMILY NOT NAMED | JGI | N/A | IEA |
PTHR16631:SF1 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00332 | PFAM | Glycosyl hydrolases family 17 | JGI | N/A | IEA |
PF07983 | PFAM | X8 domain | JGI | N/A | IEA |
GN7V-44033 | SoyCyc9-rxn | glucan endo-1,3-β-D-glucosidase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.08g043100 not represented in the dataset |
Glyma.08g043100 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.05g235700 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma08g04780 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.08g043100.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g043100.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g043100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g043100.1.p locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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ATGTTCATTACTTTCATGGCTGTGCTGCTGCTTTTCTTCATGCTGCCACTTTCTATTTCTGCATCTGGGGATGCTTTTATTGGTGTCAACATTGGTTCAGATATATCTGACATGCCAGGTTCAACAGAGATAGTTTCTCTTCTGAAGGCTCAAAGTATCCAACATGTCAGACTCTATGATGCTGACCGAGCGTTACTTCTTGCACTTGCCAACACAGGAATCCGTGTAACTGTTTCTGTTCCCAATGACCAGCTACTTGGCATTGGTCAGTCCAATGCCACTGCAGCAAACTGGGTTACTCGGAATGTCATAGCTCATGTCCCTGCTACCAACATCACTGCCATATGTGTTGGATCTGAGGTCCTAACTACCCTCCCAAATGCAGCCCCTATTATAGTCTCTGCCATAAATTTCATTCACTCTGCTCTTGTTGCTGCTAATCTAGACCAGCAAATTAAAATCTCTAGTCCGCACTCTTCTTCTATCATCCTTGACTCTTTCCCACCTTCCCAAGCATTTTTCAACCGTACATGGAATCCAGTCATGGTTCCCATGCTTAAATTTTTGCAATCAACAGGTTCATATCTTATGCTCAATGTGTATCCATATTATGATTACCAGCAGTCCAATGGTGTCATCCCACTGGATTATGCTTTATTCCGCCCCCTACCTCCAAATAAGGAAGCTGTTGATTCCAACACTCTGCTGCATTATACTAATGTTTTTGATGCAGTTGTTGATGCTGCTTATTTTGCAATGTCAGACTTGAACTTTACAAATATTCCTATTATGGTGACTGAGTCAGGATGGCCCTCCAAAGGTGACTCATCTGAATCTGATGCAACTGTTGATAATGCTAACACTTACAACAGTAACTTGATCAGACACGTCCTGAACAATACGGGGACTCCTAAACATCCTGGAATTGCAGTTAGTACATATATTTATGAGCTTTATAATGAAGACTTAAGATCAGGTCCAGTCTCAGAAAAGAACTGGGGGCTATTTTATGCTAATGGAGAACCAGTGTATACCTTACACTTGACTGGTGCTGGCAGCACTTGA >Glyma.08g043100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g043100.4.p locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g043100.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g043100.5.p locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g043100.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g043100.6.p locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGCCAGGTTCAACAGAGATAGTTTCTCTTCTGAAGGCTCAAAGTATCCAACATGTCAGACTCTATGATGCTGACCGAGCGTTACTTCTTGCACTTGCCAACACAGGAATCCGTGTAACTGTTTCTGTTCCCAATGACCAGCTACTTGGCATTGGTCAGTCCAATGCCACTGCAGCAAACTGGGTTACTCGGAATGTCATAGCTCATGTCCCTGCTACCAACATCACTGCCATATGTGTTGGATCTGAGGTCCTAACTACCCTCCCAAATGCAGCCCCTATTATAGTCTCTGCCATAAATTTCATTCACTCTGCTCTTGTTGCTGCTAATCTAGACCAGCAAATTAAAATCTCTAGTCCGCACTCTTCTTCTATCATCCTTGACTCTTTCCCACCTTCCCAAGCATTTTTCAACCGTACATGGAATCCAGTCATGGTTCCCATGCTTAAATTTTTGCAATCAACAGACTTGAACTTTACAAATATTCCTATTATGGTGACTGAGTCAGGATGGCCCTCCAAAGGTGACTCATCTGAATCTGATGCAACTGTTGATAATGCTAACACTTACAACAGTAACTTGATCAGACACGTCCTGAACAATACGGGGACTCCTAAACATCCTGGAATTGCAGTTAGTACATATATTTATGAGCTTTATAATGAAGACTTAAGATCAGGTCCAGTCTCAGAAAAGAACTGGGGGCTATTTTATGCTAATGGAGAACCAGTGTATACCTTACACTTGACTGGCAGCACTTGA >Glyma.08g043100.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g043100.7.p locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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polypeptide=Glyma.08g043100.8.p locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.08g043100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.1 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MFITFMAVLLLFFMLPLSISASGDAFIGVNIGSDISDMPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTGSYLMLNVYPYYDYQQSNGVIPLDYALFRPLPPNKEAVDSNTLLHYTNVFDAVVDAAYFAMSDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGAGIIFANDTTNQTFCVTKSNADPKMLQAALDWACGPGKVDCSPLLQGQPCYEPDNVVAHSTYAFNAYYQKMDKSPGSCDFKGVATVTTTDPSHGSCIFPGSHGRKGTRTNGTSLAPSNSTSSGCLSQYHDNGGFFTSSLILVLLLCAVV* >Glyma.08g043100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.2 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MFITFMAVLLLFFMLPLSISASGDAFIGVNIGSDISDMPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGST* >Glyma.08g043100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.3 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MFITFMAVLLLFFMLPLSISASGDAFIGVNIGSDISDMPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTGSYLMLNVYPYYDYQQSNGVIPLDYALFRPLPPNKEAVDSNTLLHYTNVFDAVVDAAYFAMSDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGAGST* >Glyma.08g043100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.4 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MFITFMAVLLLFFMLPLSISASGDAFIGVNIGSDISDMPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTGSYLMLNVYPYYDYQQSNGVIPLDYALFRPLPPNKEAVDSNTLLHYTNVFDAVVDAAYFAMSDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGST* >Glyma.08g043100.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.5 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MFITFMAVLLLFFMLPLSISASGDAFIGVNIGSDISDMPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGAGIIFANDTTNQTFCVTKSNADPKMLQAALDWACGPGKVDCSPLLQGQPCYEPDNVVAHSTYAFNAYYQKMDKSPGSCDFKGVATVTTTDPSHGSCIFPGSHGRKGTRTNGTSLAPSNSTSSGCLSQYHDNGGFFTSSLILVLLLCAVV* >Glyma.08g043100.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.6 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGST* >Glyma.08g043100.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.7 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTGSYLMLNVYPYYDYQQSNGVIPLDYALFRPLPPNKEAVDSNTLLHYTNVFDAVVDAAYFAMSDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGST* >Glyma.08g043100.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g043100.8 locus=Glyma.08g043100 ID=Glyma.08g043100.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MPGSTEIVSLLKAQSIQHVRLYDADRALLLALANTGIRVTVSVPNDQLLGIGQSNATAANWVTRNVIAHVPATNITAICVGSEVLTTLPNAAPIIVSAINFIHSALVAANLDQQIKISSPHSSSIILDSFPPSQAFFNRTWNPVMVPMLKFLQSTDLNFTNIPIMVTESGWPSKGDSSESDATVDNANTYNSNLIRHVLNNTGTPKHPGIAVSTYIYELYNEDLRSGPVSEKNWGLFYANGEPVYTLHLTGAGIIFANDTTNQTFCVTKSNADPKMLQAALDWACGPGKVDCSPLLQGQPCYEPDNVVAHSTYAFNAYYQKMDKSPGSCDFKGVATVTTTDPSHGSCIFPGSHGRKGTRTNGTSLAPSNSTSSGCLSQYHDNGGFFTSSLILVLLLCAVV*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||