SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.08g004300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm08
Start:322825
stop:331012
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.08g004300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G34320.1AT JGI N/AIEA
PTHR31730PantherFam OS01G0873900 PROTEIN JGI N/AIEA
PTHR31730:SF2PantherFam PROTEIN PSK SIMULATOR 3 JGI N/AIEA
PF05003Pfam Protein of unknown function (DUF668) JGI N/AIEA
PF11961Pfam Domain of unknown function (DUF3475) JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.08g004300 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma08g00670 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.08g004300
>Glyma.08g004300.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g004300.1.p locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGGGGGTCTTTGTTCAAAGTCTGTGAAAGGTGACAAGGTGTTTGCTAAATCAGATGGACATTCTGATAACCATAAATCTGATGGTAAGAACCACAAGTCCACCAACATGCCTAGTGATTTGACAAGTGCAGGGGATCATGGAGTGGACAAGAAAAAACAAGAAGCTGATGCTGCTGCAGGGAATGGTTCTGATGATTTCTATGATGGAATCCCACGGTTTAATGATTCTTTTCCCCACAAGTCTAGGTCAGTAAAATCAAGGCATGCTGTGGCAAAGGTCTCAGAGGTGAGTTTACGCCTGGGCAGAGCTGGTATTGACGTTTTGGACACTCTGGGGAGCAGTATGACAAATTTAAGTGCTGGTGGGTTTGTATCTGGAGCTGTGACAAAGGGGAATGAAATTGGAATTTTAGCATTTGAGGTTGCAAACACTATTGTCAAGGGTTTTAGTCTTATGGAATCTCTTTCAACAAAAAATATTAAGCATTTAAAAGAAGAGGTGCTTCAATTAGAGGCTGTGCAAGATTTAGTATCAAAGGATACGGATGAACTTCTAAAGATTGTTGGTGCAGACAAAAGGGATGAGTTGAAAGTCTTTTCTGATGAGGTAATTCGTTTTGGAAATCGTTCAAAGGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGATACTTTGAGAAAGTTAGTAGAGAACTTAATTCTCAAAGACAATCAAAGGAGGAGGCAGAATTACTAATGCAACAATTGATGACTATGGTTCAGTTTACAGCTGAATTATACCATGAGTTGCATGCTTTGGATAGATTTGCACAAGATTATCAGCATAAGCGTGAAGAGGATGATAATTCAGGTGCAGCTCAAAGTGGTGATGGCCTTTCAATCTTGAGGGCAGAACTTAAAAGTCAAAAGAAGCAAGTTAAACATTTGAAAAAAAAGTCACTCTGGTCCAGAAGTTTGGAGGAGATTATGGAGAAGCTTGTAGAGATAGTCCATTTTTTGCATTTGGAGATAAACAATGCCTTTGGCACTGCAGATGACCATAAACCATTAATTCGAACCATCAGCAATCGCCAAAAATTGGGTCCTGCAGGCCTTGCTTTACATTATGCTAATATAGTGCTCCAAATTGATACTCTTGTTGCCAGATCCAGTTCTATGCCTGCAAATACAAGGGATGCACTGTATCAGAGCTTGCCTCCTAATATAAAATTAGCCTTGCGTTCCAAATTACCAAGCTTTCATGTTGTAAAAGAGCTCACCATATCAGATATTAAACAAGAGATGGAGAAAACATTGCATTGGCTGGTTCCGATTGCTACAAACACGGCCAAAGCACATCATGGTTTTGGTTGGGTAGGGGAGTGGGCAAGCACTGGTTCTGAGCTGAATAAGAAGACCATGAAGGCTGATGTGTTGCGGATTGAAACGCTTCACCATGCCGATAAAGATAAAGTAGAAAATTATATTCTTGAACTTCTCCTATGGCTTCACCGCTTGGCCGTCAAAAGTAAAGCTGGCATCGATACCGGAGAAACAAGGTCTACCTTAAAGTCCCAAGTTGGCACTGCCCTTCAAACTACAAATCAACAATCAACAAAAGCCTTATCGCCATTGTTAACAACTGACGAGCAGAAAATGCTGCAAGATGTTAGTAATAAAATTCGTATAAGAAGGATCAGTAAAAGCTTAGACTTTGACAGTGTGATGGCAGATAATGACAGACTTACTAAGAGTAGCAGTTATTCTTATTCATCAACAAGTAGAAGCAAGGAATTATCTTTTAATAGAATTTTGTCTAAGCTTCCTGTTATTGATTTTGGTATTGACAAAAAGAGAGCATTGGATGTGATTGACAGATTAGACGTGGTCAGATAA

>Glyma.08g004300.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g004300.2.p locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGACAAATTTAAGTGCTGGTGGGTTTGTATCTGGAGCTGTGACAAAGGGGAATGAAATTGGAATTTTAGCATTTGAGGTTGCAAACACTATTGTCAAGGGTTTTAGTCTTATGGAATCTCTTTCAACAAAAAATATTAAGCATTTAAAAGAAGAGGTGCTTCAATTAGAGGCTGTGCAAGATTTAGTATCAAAGGATACGGATGAACTTCTAAAGATTGTTGGTGCAGACAAAAGGGATGAGTTGAAAGTCTTTTCTGATGAGGTAATTCGTTTTGGAAATCGTTCAAAGGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGATACTTTGAGAAAGTTAGTAGAGAACTTAATTCTCAAAGACAATCAAAGGAGGAGGCAGAATTACTAATGCAACAATTGATGACTATGGTTCAGTTTACAGCTGAATTATACCATGAGTTGCATGCTTTGGATAGATTTGCACAAGATTATCAGCATAAGCGTGAAGAGGATGATAATTCAGGTGATGGCCTTTCAATCTTGAGGGCAGAACTTAAAAGTCAAAAGAAGCAAGTTAAACATTTGAAAAAAAAGTCACTCTGGTCCAGAAGTTTGGAGGAGATTATGGAGAAGCTTGTAGAGATAGTCCATTTTTTGCATTTGGAGATAAACAATGCCTTTGGCACTGCAGATGACCATAAACCATTAATTCGAACCATCAGCAATCGCCAAAAATTGGGTCCTGCAGGCCTTGCTTTACATTATGCTAATATAGTGCTCCAAATTGATACTCTTGTTGCCAGATCCAGTTCTATGCCTGCAAATACAAGGGATGCACTGTATCAGAGCTTGCCTCCTAATATAAAATTAGCCTTGCGTTCCAAATTACCAAGCTTTCATGTTGTAAAAGAGCTCACCATATCAGATATTAAACAAGAGATGGAGAAAACATTGCATTGGCTGGTTCCGATTGCTACAAACACGGCCAAAGCACATCATGGTTTTGGTTGGGTAGGGGAGTGGGCAAGCACTGGTTCTGAGCTGAATAAGAAGACCATGAAGGCTGATGTGTTGCGGATTGAAACGCTTCACCATGCCGATAAAGATAAAGTAGAAAATTATATTCTTGAACTTCTCCTATGGCTTCACCGCTTGGCCGTCAAAAGTAAAGCTGGCATCGATACCGGAGAAACAAGGTCTACCTTAAAGTCCCAAGTTGGCACTGCCCTTCAAACTACAAATCAACAATCAACAAAAGCCTTATCGCCATTGTTAACAACTGACGAGCAGAAAATGCTGCAAGATGTTAGTAATAAAATTCGTATAAGAAGGATCAGTAAAAGCTTAGACTTTGACAGTGTGATGGCAGATAATGACAGACTTACTAAGAGTAGCAGTTATTCTTATTCATCAACAAGTAGAAGCAAGGAATTATCTTTTAATAGAATTTTGTCTAAGCTTCCTGTTATTGATTTTGGTATTGACAAAAAGAGAGCATTGGATGTGATTGACAGATTAGACGTGGTCAGATAA

>Glyma.08g004300.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g004300.8.p locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.8.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGGGGGTCTTTGTTCAAAGTCTGTGAAAGGTGACAAGGTGTTTGCTAAATCAGATGGACATTCTGATAACCATAAATCTGATGGTAAGAACCACAAGTCCACCAACATGCCTAGTGATTTGACAAGTGCAGGGGATCATGGAGTGGACAAGAAAAAACAAGAAGCTGATGCTGCTGCAGGGAATGGTTCTGATGATTTCTATGATGGAATCCCACGGTTTAATGATTCTTTTCCCCACAAGTCTAGGTCAGTAAAATCAAGGCATGCTGTGGCAAAGGTCTCAGAGGTGAGTTTACGCCTGGGCAGAGCTGGTATTGACGTTTTGGACACTCTGGGGAGCAGTATGACAAATTTAAGTGCTGGTGGGTTTGTATCTGGAGCTGTGACAAAGGGGAATGAAATTGGAATTTTAGCATTTGAGGTTGCAAACACTATTGTCAAGGGTTTTAGTCTTATGGAATCTCTTTCAACAAAAAATATTAAGCATTTAAAAGAAGAGGTGCTTCAATTAGAGGCTGTGCAAGATTTAGTATCAAAGGATACGGATGAACTTCTAAAGATTGTTGGTGCAGACAAAAGGGATGAGTTGAAAGTCTTTTCTGATGAGGTAATTCGTTTTGGAAATCGTTCAAAGGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGATACTTTGAGAAAGTTAGTAGAGAACTTAATTCTCAAAGACAATCAAAGGAGGAGGCAGAATTACTAATGCAACAATTGATGACTATGGTTCAGTTTACAGCTGAATTATACCATGAGTTGCATGCTTTGGATAGATTTGCACAAGATTATCAGCATAAGCGTGAAGAGGATGATAATTCAGGTGATGGCCTTTCAATCTTGAGGGCAGAACTTAAAAGTCAAAAGAAGCAAGTTAAACATTTGAAAAAAAAGTCACTCTGGTCCAGAAGTTTGGAGGAGATTATGGAGAAGCTTGTAGAGATAGTCCATTTTTTGCATTTGGAGATAAACAATGCCTTTGGCACTGCAGATGACCATAAACCATTAATTCGAACCATCAGCAATCGCCAAAAATTGGGTCCTGCAGGCCTTGCTTTACATTATGCTAATATAGTGCTCCAAATTGATACTCTTGTTGCCAGATCCAGTTCTATGCCTGCAAATACAAGGGATGCACTGTATCAGAGCTTGCCTCCTAATATAAAATTAGCCTTGCGTTCCAAATTACCAAGCTTTCATGTTGTAAAAGAGCTCACCATATCAGATATTAAACAAGAGATGGAGAAAACATTGCATTGGCTGGTTCCGATTGCTACAAACACGGCCAAAGCACATCATGGTTTTGGTTGGGTAGGGGAGTGGGCAAGCACTGGTTCTGAGCTGAATAAGAAGACCATGAAGGCTGATGTGTTGCGGATTGAAACGCTTCACCATGCCGATAAAGATAAAGTAGAAAATTATATTCTTGAACTTCTCCTATGGCTTCACCGCTTGGCCGTCAAAAGTAAAGCTGGCATCGATACCGGAGAAACAAGGTCTACCTTAAAGTCCCAAGTTGGCACTGCCCTTCAAACTACAAATCAACAATCAACAAAAGCCTTATCGCCATTGTTAACAACTGACGAGCAGAAAATGCTGCAAGATGTTAGTAATAAAATTCGTATAAGAAGGATCAGTAAAAGCTTAGACTTTGACAGTGTGATGGCAGATAATGACAGACTTACTAAGAGTAGCAGTTATTCTTATTCATCAACAAGTAGAAGCAAGGAATTATCTTTTAATAGAATTTTGTCTAAGCTTCCTGTTATTGATTTTGGTATTGACAAAAAGAGAGCATTGGATGTGATTGACAGATTAGACGTGGTCAGATAA

>Glyma.08g004300.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.08g004300.9.p locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.9.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGGGGGTCTTTGTTCAAAGTCTGTGAAAGGTGACAAGGTGTTTGCTAAATCAGATGGACATTCTGATAACCATAAATCTGATGGTAAGAACCACAAGTCCACCAACATGCCTAGTGATTTGACAAGTGCAGGGGATCATGGAGTGGACAAGAAAAAACAAGAAGCTGATGCTGCTGCAGGGAATGGTTCTGATGATTTCTATGATGGAATCCCACGGTTTAATGATTCTTTTCCCCACAAGTCTAGGTCAGTAAAATCAAGGCATGCTGTGGCAAAGGTCTCAGAGGTGAGTTTACGCCTGGGCAGAGCTGGTATTGACGTTTTGGACACTCTGGGGAGCAGTATGACAAATTTAAGTGCTGGTGGGTTTGTATCTGGAGCTGTGACAAAGGGGAATGAAATTGGAATTTTAGCATTTGAGGTTGCAAACACTATTGTCAAGGGTTTTAGTCTTATGGAATCTCTTTCAACAAAAAATATTAAGCATTTAAAAGAAGAGGTGCTTCAATTAGAGGCTGTGCAAGATTTAGTATCAAAGGATACGGATGAACTTCTAAAGATTGTTGGTGCAGACAAAAGGGATGAGTTGAAAGTCTTTTCTGATGAGGTAATTCGTTTTGGAAATCGTTCAAAGGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGATACTTTGAGAAAGTTAGTAGAGAACTTAATTCTCAAAGACAATCAAAGGAGGAGGCAGAATTACTAATGCAACAATTGATGACTATGGTTCAGTTTACAGCTGAATTATACCATGAGTTGCATGCTTTGGATAGATTTGCACAAGATTATCAGCATAAGCGTGAAGAGGATGATAATTCAGGTGATGGCCTTTCAATCTTGAGGGCAGAACTTAAAAGTCAAAAGAAGCAAGTTAAACATTTGAAAAAAAAGTCACTCTGGTCCAGAAGTTTGGAGGAGATTATGGAGAAGCTTGTAGAGATAGTCCATTTTTTGCATTTGGAGATAAACAATGCCTTTGGCACTGCAGATGACCATAAACCATTAATTCGAACCATCAGCAATCGCCAAAAATTGGGTCCTGCAGGCCTTGCTTTACATTATGCTAATATAGTGCTCCAAATTGATACTCTTGTTGCCAGATCCAGTTCTATGCCTGCAAATACAAGGGATGCACTGTATCAGAGCTTGCCTCCTAATATAAAATTAGCCTTGCGTTCCAAATTACCAAGCTTTCATGTTGTAAAAGAGGTACAGTCTTATCTGCTGGTATTTTCTCCTATTACCACTGTTAAAAAATTAAGAGACAAGATACTGTTCTGA
Predicted protein sequences of Glyma.08g004300
>Glyma.08g004300.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g004300.1 locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MGGLCSKSVKGDKVFAKSDGHSDNHKSDGKNHKSTNMPSDLTSAGDHGVDKKKQEADAAAGNGSDDFYDGIPRFNDSFPHKSRSVKSRHAVAKVSEVSLRLGRAGIDVLDTLGSSMTNLSAGGFVSGAVTKGNEIGILAFEVANTIVKGFSLMESLSTKNIKHLKEEVLQLEAVQDLVSKDTDELLKIVGADKRDELKVFSDEVIRFGNRSKDPQWHNLDRYFEKVSRELNSQRQSKEEAELLMQQLMTMVQFTAELYHELHALDRFAQDYQHKREEDDNSGAAQSGDGLSILRAELKSQKKQVKHLKKKSLWSRSLEEIMEKLVEIVHFLHLEINNAFGTADDHKPLIRTISNRQKLGPAGLALHYANIVLQIDTLVARSSSMPANTRDALYQSLPPNIKLALRSKLPSFHVVKELTISDIKQEMEKTLHWLVPIATNTAKAHHGFGWVGEWASTGSELNKKTMKADVLRIETLHHADKDKVENYILELLLWLHRLAVKSKAGIDTGETRSTLKSQVGTALQTTNQQSTKALSPLLTTDEQKMLQDVSNKIRIRRISKSLDFDSVMADNDRLTKSSSYSYSSTSRSKELSFNRILSKLPVIDFGIDKKRALDVIDRLDVVR*

>Glyma.08g004300.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g004300.2 locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MTNLSAGGFVSGAVTKGNEIGILAFEVANTIVKGFSLMESLSTKNIKHLKEEVLQLEAVQDLVSKDTDELLKIVGADKRDELKVFSDEVIRFGNRSKDPQWHNLDRYFEKVSRELNSQRQSKEEAELLMQQLMTMVQFTAELYHELHALDRFAQDYQHKREEDDNSGDGLSILRAELKSQKKQVKHLKKKSLWSRSLEEIMEKLVEIVHFLHLEINNAFGTADDHKPLIRTISNRQKLGPAGLALHYANIVLQIDTLVARSSSMPANTRDALYQSLPPNIKLALRSKLPSFHVVKELTISDIKQEMEKTLHWLVPIATNTAKAHHGFGWVGEWASTGSELNKKTMKADVLRIETLHHADKDKVENYILELLLWLHRLAVKSKAGIDTGETRSTLKSQVGTALQTTNQQSTKALSPLLTTDEQKMLQDVSNKIRIRRISKSLDFDSVMADNDRLTKSSSYSYSSTSRSKELSFNRILSKLPVIDFGIDKKRALDVIDRLDVVR*

>Glyma.08g004300.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g004300.8 locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.8.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MGGLCSKSVKGDKVFAKSDGHSDNHKSDGKNHKSTNMPSDLTSAGDHGVDKKKQEADAAAGNGSDDFYDGIPRFNDSFPHKSRSVKSRHAVAKVSEVSLRLGRAGIDVLDTLGSSMTNLSAGGFVSGAVTKGNEIGILAFEVANTIVKGFSLMESLSTKNIKHLKEEVLQLEAVQDLVSKDTDELLKIVGADKRDELKVFSDEVIRFGNRSKDPQWHNLDRYFEKVSRELNSQRQSKEEAELLMQQLMTMVQFTAELYHELHALDRFAQDYQHKREEDDNSGDGLSILRAELKSQKKQVKHLKKKSLWSRSLEEIMEKLVEIVHFLHLEINNAFGTADDHKPLIRTISNRQKLGPAGLALHYANIVLQIDTLVARSSSMPANTRDALYQSLPPNIKLALRSKLPSFHVVKELTISDIKQEMEKTLHWLVPIATNTAKAHHGFGWVGEWASTGSELNKKTMKADVLRIETLHHADKDKVENYILELLLWLHRLAVKSKAGIDTGETRSTLKSQVGTALQTTNQQSTKALSPLLTTDEQKMLQDVSNKIRIRRISKSLDFDSVMADNDRLTKSSSYSYSSTSRSKELSFNRILSKLPVIDFGIDKKRALDVIDRLDVVR*

>Glyma.08g004300.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.08g004300.9 locus=Glyma.08g004300 id=Glyma.08g004300.9.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MGGLCSKSVKGDKVFAKSDGHSDNHKSDGKNHKSTNMPSDLTSAGDHGVDKKKQEADAAAGNGSDDFYDGIPRFNDSFPHKSRSVKSRHAVAKVSEVSLRLGRAGIDVLDTLGSSMTNLSAGGFVSGAVTKGNEIGILAFEVANTIVKGFSLMESLSTKNIKHLKEEVLQLEAVQDLVSKDTDELLKIVGADKRDELKVFSDEVIRFGNRSKDPQWHNLDRYFEKVSRELNSQRQSKEEAELLMQQLMTMVQFTAELYHELHALDRFAQDYQHKREEDDNSGDGLSILRAELKSQKKQVKHLKKKSLWSRSLEEIMEKLVEIVHFLHLEINNAFGTADDHKPLIRTISNRQKLGPAGLALHYANIVLQIDTLVARSSSMPANTRDALYQSLPPNIKLALRSKLPSFHVVKEVQSYLLVFSPITTVKKLRDKILF*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
USDA Logo
Iowa State University Logo