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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.07g259400

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm07
Start:43816755
stop:43827763
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.07g259400
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G21820.1AT JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
K16743KEGG Chromosome and associated proteins JGI N/AIEA
KOG0165 KOG Microtubule-associated protein Asp JGI N/AIEA
PTHR11915PantherFam SPECTRIN/FILAMIN RELATED CYTOSKELETAL PROTEIN JGI N/AIEA
PF00307Pfam Calponin homology (CH) domain JGI N/AIEA
PF00514Pfam Armadillo/beta-catenin-like repeat JGI N/AIEA
PF00612Pfam IQ calmodulin-binding motif JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.07g259400 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma07g38930 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.07g259400
>Glyma.07g259400.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g259400.1.p locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g259400.15 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g259400.15.p locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.15.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g259400.16 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g259400.16.p locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.16.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g259400.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g259400.2.p locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.07g259400
>Glyma.07g259400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g259400.1 locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g259400.15.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g259400.15 locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.15.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g259400.16.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g259400.16 locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.16.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g259400.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g259400.2 locus=Glyma.07g259400 id=Glyma.07g259400.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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