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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT4G19880.1 | AT | Glutathione S-transferase family protein | JGI | N/A | IEA |
AT4G19880.2 | AT | Glutathione S-transferase family protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0005737 | GO-cc | cytoplasm | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0004364 | GO-mf | glutathione transferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005515 | GO-mf | protein binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005515 | GO-mf | protein binding | JGI | N/A | IEA |
KOG2903 | KOG | Predicted glutathione S-transferase | JGI | N/A | IEA |
PTHR11260 | Panther | GLUTATHIONE S-TRANSFERASE, GST, SUPERFAMILY, GST DOMAIN CONTAINING | JGI | N/A | IEA |
PTHR11260:SF67 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00043 | PFAM | Glutathione S-transferase, C-terminal domain | JGI | N/A | IEA |
GN7V-67530 | SoyCyc9-rxn | S-glutathionyl-hydroquinone reductase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.07g222400 not represented in the dataset |
Glyma.07g222400 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.20g020300 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma07g34820 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.07g222400.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.07g222400.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.07g222400.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.07g222400.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.07g222400.26 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.26.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.07g222400.27 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.27.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.07g222400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g222400.1 locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MARFSLDEISDTGAFVRSASTFRNWISRDLNSQFPPESGRYHLYVSYACPWASRCLAYLNIKGLNKAISFSAVKPIFERTNESDDYKGWVFPESETEVPGAEPDMLNGAKTIRELYEIASANYTGKYTVPVLWDKKLKTIVNNESSEIIRMFNTEFNSIAENPTLDLYPTDLKPQIDDTNEWIYTSINNGVYKCGFAKKQEPYNEAARQLYGALDKCEDILSKQRYICGNTLTEADIRLFVTLIRFDEVYAVHFKCNKKLLREYPNLFNYTKDIFQIPGISSTVNMEHIKLHYYGSHPSINPFGIVPVGPNIDYSAPHDRERFSA* >Glyma.07g222400.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g222400.10 locus=Glyma.07g222400 ID=Glyma.07g222400.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MARFSLDEISDTGAFVRSASTFRNWISRDLNSQFPPESGRYHLYVSYACPWASRCLAYLNIKGLNKAISFSAVKPIFERTNESDDYKGWVFPESETEVPGAEPDMLNGAKTIRELYEIASANYTGKYTVPVLWDKKLKTIVNNESSEIIRMFNTEFNSIAENPTLDLYPTDLKPQIDDTNEWIYTSINNGVYKCGFAKKQEPYNEAARQLYGALDKCEDILSKQRYICGNTLTEADIRLFVTLIRFDEFAIQFRTPSPLRFVR* >Glyma.07g222400.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g222400.11 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||