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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.07g214000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm07
Start:38927792
stop:38933583
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.07g214000
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G52950.1AT JGI N/AIEA
PTHR23273PantherFam REPLICATION FACTOR A 1, RFA1 JGI N/AIEA
PF02721Pfam Domain of unknown function DUF223 JGI N/AIEA
PF08646Pfam Replication factor-A C terminal domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.07g214000 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma07g33701 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.07g214000
>Glyma.07g214000.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g214000.1.p locus=Glyma.07g214000 id=Glyma.07g214000.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTGTCGTTTAAGTCTGTGTTGGTATTCTATTTTTTGTAAACAAAACTTTGTTGGTTTTATTTTCGGCGGCTTCCATCTGTTTGTTGATGGTTACATTGCATTTGCATGGTTTTGGATTTATCACATTTTTCATTTAGAATTGGCAGTTCTATCCAATTTTATGGCAAGGATTCCTGACAAGATTAAGTCTATTGATGGGTCAAGAGAGACGCTTAAGCTTGCTGTGAGAATCACCGACCTTTGGTTCGTTGGGACTCCCAACAAGTTTGAGCAAGCGGAAATGGTTATTGTTGATTCTGAGGGTGATCAAATTCATGCTGTTTGTAAAGCGGACCACCTAAAGTCTTGGAAAGCTGATTTGAAGGAGAATTCCACTTATGTTATGCATAATTTCAAAGTGGTCAAGAATGATGGTCAATTTAGAGTGTGTGAACATGAGTACAAGTTAGCTTTTATTGGAGTGACTATTGTTAGAGAAGTTGATTTGCATGAACTACCTTTTAAGGAATTTAGATTTGTTGAATTTGGAAATGTCGTTGCTGGGAATTTTGTGGTTGGCCTGTTGGTTGATATTATTGGGGTCGTTGATCAGGTGCTTTTTCAGCATGTTTCATCAAAAAATACCAGGGTTGTTTTTAGAATGAAGGATTTGAGTGGTGAAGTTTTATCTTGCACACTTTGGGAAAATTATTGTATGCAGTTCTTAGCCTATTTGAATGAACGTGGAAATGATGGGCCGATCGTTATTATTTTGACACATGCCAGAATAAAAGATGCGCAGGGAAGTTATCTAGCTTCAGTGAGCAATTCGTTCAAGGCCTCAAAATTATTAATTAATGAACCTATATTGGAAATCCAGGAATTTAGAGAGAGGCTTTTAGATTTAGGTGTTAAGGTCAGCCCAGTTTTGCCACCTGGCGATCAAGGAAGTTCACAACTTTCAAGGGGAAGCCAACTATCATCAAAGGATGCATTTCTTTCGAAAGTTGAAGCCAAAACTATTTACGAGATCAATGGCATTTCTGAGGATGTTGTTTGTGTTACAGTGGGCACTATTAGCAAAATAGTCATGAATAATCATTCATGGTGTTATCCAGCTTGCGTTCAATGTCATAGAAAAACTGACATCCAAACAGGACCATTCACATGCGGATGTGGCAAAAATAATGACCAGCCTGTTCTAAGGTATAGAGTTGAAGTAATGGTTAGCCAAAACAATGACAGTAGCAAGTTTTTGCTCTGGGACCGTGAATGTGCTGAATTGATTGGTCAAACAGCTGATGAAGTGAATAGGGTCAAGATTGAAGATGGTGATGTTGATTTAAATGCTTCTCCTCAAGCACTTGATAGGTTGTTGGGTTATGTGCTTGCTTTTAAGGTTAGAATTCAATCAAAATTCAGGAATGTCGTTGTTCTTAGATGCTCAAATGAATTAGATTTGATCAATGTTGTGCTCGACATGCTGGCTGATACTGAGGCATGTTCGAAAATAGATGCTTCGAACGTTGATTGCAATAATGCTACGCATCCTGAATGTCGGACCATGATCCAGTTGCAGGATTCCCTTTAA

>Glyma.07g214000.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g214000.3.p locus=Glyma.07g214000 id=Glyma.07g214000.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g214000.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g214000.7.p locus=Glyma.07g214000 id=Glyma.07g214000.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.07g214000
>Glyma.07g214000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g214000.1 locus=Glyma.07g214000 id=Glyma.07g214000.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g214000.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g214000.3 locus=Glyma.07g214000 id=Glyma.07g214000.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MARIPDKIKSIDGSRETLKLAVRITDLWFVGTPNKFEQAEMVIVDSEGDQIHAVCKADHLKSWKADLKENSTYVMHNFKVVKNDGQFRVCEHEYKLAFIGVTIVREVDLHELPFKEFRFVEFGNVVAGNFVVGLLVDIIGVVDQVLFQHVSSKNTRVVFRMKDLSGEVLSCTLWENYCMQFLAYLNERGNDGPIVIILTHARIKDAQGSYLASVSNSFKASKLLINEPILEIQEFRERLLDLGVKVSPVLPPGDQGSSQLSRGSQLSSKDAFLSKVEAKTIYEINGISEDVVCVTVGTISKIVMNNHSWCYPACVQCHRKTDIQTGPFTCGCGKNNDQPVLRVEVMVSQNNDSSKFLLWDRECAELIGQTADEVNRVKIEDGDVDLNASPQALDRLLGYVLAFKVRIQSKFRNVVVLRCSNELDLINVVLDMLADTEACSKIDASNVDCNNATHPECRTMIQLQDSL*

>Glyma.07g214000.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g214000.7 locus=Glyma.07g214000 id=Glyma.07g214000.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MCRLSLCWYSIFCKQNFVGFIFGGFHLFVDGYIAFAWFWIYHIFHLELAVLSNFMARIPDKIKSIDGSRETLKLAVRITDLWFVGTPNKFEQAEMVIVDSEGDQIHAVCKADHLKSWKADLKENSTYVMHNFKVVKNDGQFRVCEHEYKLAFIGVTIVREVDLHELPFKEFRFVEFGNVVAGNFVVGLLVDIIGVVDQVLFQHVSSKNTRVVFRMKDLSGEVLSCTLWENYCMQFLAYLNERGNDGPIVIILTHARIKDAQGSYLASVSNSFKASKLLINEPILEIQEFRERLLDLGVKVSPVLPPGDQGSSQLSRGSQLSSKDAFLSKVEAKTIYEINGISEDVVCVTVGTISKIVMNNHSWCYPACVQCHRKTDIQTGPFTCGCGKNNDQPVLRYRVEVMVSQNNDSSKFLLWDRECAELIGQTADEVNRVKIEDGDVDLNASPQALDRLLGYVLAFKVRIQSKFRNVVVLRCSNELDLINVVLDMLADTEACSKIDASNVDCNNATHPECDSL*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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