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Report for Sequence Feature Glyma.07g062900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm07
Start:5566337
stop:5583502
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G26090.1AT NB-ARC domain-containing disease resistance protein JGI N/AIEA
GO:0006952GO-bp defense response EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0007165GO-bp signal transduction EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005886GO-cc plasma membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0043531GO-mf ADP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0043531GO-mf ADP binding JGI N/AIEA
KOG4658 KOG Apoptotic ATPase JGI N/AIEA
PTHR23155Panther LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING PROTEIN JGI N/AIEA
PTHR23155:SF121Panther JGI N/AIEA
PF00931PFAM NB-ARC domain JGI N/AIEA

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.07g062900 not represented in the dataset

Glyma.07g062900 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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View a gene family containing related genes from other legumes at LIS

Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.


View gene and ortholog information at GlycineMine

Gene information in GlycineMine developed by LIS.



View a gene family containing related genes from other plant species at PhyloGenes

Gene families from PhyloGenes.


Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma07g06866 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.07g062900.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g062900 ID=Glyma.07g062900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.07g062900.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g062900 ID=Glyma.07g062900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.07g062900.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g062900.4 locus=Glyma.07g062900 ID=Glyma.07g062900.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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