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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.07g054500

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm07
Start:4746024
stop:4762560
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.07g054500
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G46560.1AT JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
PTHR13950PantherFam RABCONNECTIN-RELATED JGI N/AIEA
PTHR13950:SF9PantherFam WD_REPEATS_REGION DOMAIN-CONTAINING PROTEIN JGI N/AIEA
PF00400Pfam WD domain, G-beta repeat JGI N/AIEA
PF12234Pfam RAVE protein 1 C terminal JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.07g054500 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma07g06025 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.07g054500
>Glyma.07g054500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g054500.1.p locus=Glyma.07g054500 id=Glyma.07g054500.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGACAGAATCAGAGAAGATGAACCCCATCGATCACCTTCCCCTCCGTCTGCTCAGATCCGACACGGTTCCACCCGCCCCTACCTTCTCTGAATCCACCGTGGATTTCCTCCCTCACTTCTCCGGCTACTCCTGGATCGCCTACGCCGCTTCTTCACTTCTCACCATCTCCCACTTCCCTTCCCCTCTCTCCCCTCACCAAACCCGCATCGGCCCCTTTTTCCGCCAATCCTTCCAGCTCTCCGCCCATCCCGTCGCCGCCGTCGCCTGGTCCCCCAGCTCCCCCTCCTCCGGCGACCTCGCCGCCGCCGCCGATGACTGCATCTGGCTTTTCCGCCACGACTCCGCCGCCGGTAAAGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGAATGCAGTGCTTGTACAACATATGAAAGTGGCAAACATCAAATGGACAGGATCAGGAGATGGAATAATTTCTGTTGGAATGGAGGTGGTTTTCTGGAAAAAGAGTAACACATGTTGGGAAGTTGCTTGGAAGTTTAAAGCAGATCAGCCCCAAACTCTTGTTTGTGCAACTTGGTCTATTGAGGGCCCTTCAGCAACTGCAGCACATCCAAGTAGAGAACACATTGAAGGGACCTTGACCAATGAGGAAAGCAAATGTGTATTGGTATGTCAAAGCAATGGACTATCTGAATATTCAAAAGTCAAACTACATCATCCTCTACCTGTCGTAATGATTCAATGGAGACCATCAAGAGGAAAGCTATCAAACAGATATGGTAAGTGTTCTGTAAGGCATGTACTTTTGACTTGCAGCTTAGATGGGACTGCAAGGTTATGGAGTGAAATTGATAATGCAAAGGCCAGGAGAACTGCGAAGGACATCAATGATCAGAAGAATGCCGGATGCTCTTTTTGTGTTGTTGCTGTTATTGAGATTAATCAGTCCTTAAATGCAACTCTTAGTTCAGATATATTTGTGAGATGGGGAACAGAATTTGAGGGACTATTTCAAACTGACAAAGAGGCCAAACAAGTTTTTTCCAAAGAAGGATTTGAGCATGATGTTAGAAATTGTGATTGGCTTGTTGGGTTTGGTCCTGGAATGCTGCTTAGCTTTTGGGCTGTCCACTGTCTTGATGATGTTTCACCACTGAGATTCCCCCGAGTTACGTTATGGAAGAAACATGAACTCCAGAACCATGACATAGCAAATGTTTACAAGTTTAACTCATCTGATTTTAAAAATGCACTATTTCTTCATAAGGTTATTATATTGAGAAGTTGCCTGTTTGGTCCACCAACTATATGCTCTTCACTTCAGCTATTGCCTTGTAATTCCTTAGTTTGGTCAAATTTCCGTATTCAAACAATACATAATGCTGTGGAGGACTCCAATGATAATGTTAACACAGATAACATCTCCTCCCATTTGACTGGTGGGGTTTTAAACTTAGATGGTCATAGTGGGAAAATATTAAAGGTTTCACTTCATCCTTGTACATGCAAAGTTCAATTTGCTGCTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTTCTTTTTTGGTCACTTTCTAACATTTCAAACTGCATTTTGGGATGCCCAACTTTGGTTCCTACTATGGAACTCTGTGGAAAGCTTGCAACTCAAGACTCGTGTTCCTTGTACACTAGCTTGAAATGGGCACCTTCAATACTTGGTGACAAACTGGTTTTTTTTATGGGGCATACTCGAGGGATTGATTGCTTCATTGTCAACATTTGTCAAAGTGAAGAAGAAAACATAGAATGTCACTACTTATGCACTATTCCTTTCAGTGGTCATGGTCCTTATGAGGATGGCCCTTTTGATATCTTTACAATTCCTTTAAACTCCACCTGTGACAAAACTTTCCGTAATAATAAACTTATGCTATTGGCAATATGGATGGGGAGATTTCAGGCCCTATCATGGGAAGTAAACTTGCACTCATTTGACATGTCAACAAACTGTTGTGAATGCAATTTTGATGTTAAAAGCATTGATAACTGCAGTGTTCGGGCATTTGAAAGTACATTTGCTAATAAAAAATATTGCATTACTGTAAATCCATGTTCATGTGAGTTTCCAAGTTCCAAAGATCTGGTTACTAGTTTTGCGGTGGCTGATTCAGGCACTCTAAGCCATAGGCAACAAGAGTTTAGCCTTGCAAATGATCTGTGTAGTAGTTATCCCGCATATATCATGGCCACAGGCTCATCTGATGGCATCTTGAAACTATGGAAAAGTAAACCTGGCAACTCATTGACCCAACACTTGCCATGGGAGCTTGTGGGTTCGTTTGTTGCACATGATGGTCCCATCAAGGATATATGTTTAGCTAATTGTGGTGAGAAGATTGCTACGTTCTGCTACGAAAGCAATTCAAATGCTATCAATACCATCCATATATGGGATGCTGTACCACTAATCAGCGCTGGGACTTTTATTTTGGAGGATAAAATAAAGACTGAAAGTGATGTTATTGCTCTAAAGTGGTTAACTTTAGGAACTGGGGAGTTATTGCTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGAATTACATGTGTATGCTCCTAAGCGTTGTGTTGGTACAACATTGTCAGACTCTGTAAATTTTCCAAAAATGAATATATGGGTTTGCATTGCATATGCTCACACTTCCATTCCAATTTATGATTTCTTATGGGGACCCAGAGCTGCAGCAGTGGTGATTCATGGAAATTACTTTAGTATATTTAGTCATTGGCTGTTCCATGAGGATAAAAAGCAAGGGAGTAAATTTCGTCCTTGTGATTCAAAGCCTAATACCTATAATTGCAAGGATGAAATATATGAAGACATACTTTCTTCAGTTTTCACTGAATATGACATTGGTGCTTACAGAGAACAGTCACTTGGAGACAGTCATGCAGATTTTGATTCTGTGCAGTCCATCAAAATTAATATGAAGGACAATTCCAGTAGCTTGTTTCTGGCCAAGGAACAATTAAAATCTGAACTTCTTACCAAGGTTGGTTTATGGAGCATCTTAGAAGTAGCTGAGATAATTAGTGGATCATTGCCTACTTATCACCCTGATGTACTACTTACTAATATAAGCTCAGGAAACTGGAAACGTGCTTATGTAGCTGTGAGGCATCTTGTTGAATGCCTGACTAATTATGATCCTAAAAAGAGACACATCTCCAAAAGAATTGGCCTTCCAAATGTTTTATTGTCATATTATCTAGAAGGCTGTATACCAAAAGGTTCCCAACCTAAGGGATTCCAGTGGGGCGGGGACGCTGCATTGATCACATCAATTTCACAGGCTCAGAGTAGCTTGTTCCGGTTTCCATATCATTCAGATTCCAGTGTTGAAAATGAAAGCATTTCCTCATCAACAAAATCCGAGCTTAATGACTTTATTGAATCTCTTGAGAAATTTCCTGATTTACCATTTTTGGTCGACATAGAGAAGACGCAGATTCTTGCAATTATAGATCTGCTTAGTGAAGTTAGTAGTGCTCACTCATCTTCTGCATATCAGAGTCTTGATGAACCTGGACGAAGGTTTTGGGTGGCACTAAGGTTTCAGCAACTGCTTTTTCTCCGAAAGTTTGCCAGAGCTGCATCTTTTGAAGAGTTGCTCGTTGACTCAAGGTTATTTGTATGGGCTTATCATTCTGATTGCCTAGATAATTTATTTGGTTCTGTCATACCCAATGAACCATCGTGGCAAGAAATGCGTGCTTTGGGTATGGGCTTTTGGTATGCTAATATACCTCAATTGCGTGCAAGGATGGAGAAATTGGCAAGAGCTCAGTATTTGAAGAACAAAAATCCCAAGGATTGTGCTTTGCTGTATATTGCACTGAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGCCTTTTCAAAATCAGTAAGGATGAGAAGGATAAGCCTCTTGTGGGCTTTCTTTCTCGCAATTTTCAGGATGAGAAAAATAAAGCTGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTCTTACTTGGAAAGCATCAGCTGGAATTAGCAATTGCTTTCTTTTTGCTTGGAGGTGATCATTCTTCTGCTATAAATATTTGTGCTAAGAATCTTGGGGATGAACAGCTTGCCTTAGTCATTTGTCGTCTTGTTGAGGGCCATGGTGGACCATTGGAGCATCACCTAATTACAAAGTACATACTTCCATTTGCAATTGATAAAGGAGACTACTGGCTTGCAAGCCTTCTGGAGTGGGAAATGGGTAATTACTACCAATCTTTTTATAGAATGCTAGAGTTTTCAGTAAACCCTGTGCCTCGGGAGTCCACTGTCATGTCCAATTGTGGTCCCTTTCTGGACCCTACCGTCGGTTTTTATTGTCAAATGTTAGCAACAAAGAATAGCATGCGGAATGCTGTGGGGGAGCAAAATTCTGCAATTCTTTTAAGATGGGCAACTTTGATGACAGTTGCTGCACTAAAAAGATGTGGTAATCCTCTTGAGGCGTTGGAGTATTTCTCGTCTTCGCTTAGCATGCCTGGGACTGCAGATCAAGAGAGTGAATTAGGTGACAGTCATGATGTGCTGTCCAGTACTCTTAAGCCTTTGCCAAGAAAATGCTCTAACTGGTTGTCTGCTAACATGTCTGTGCATCTGGAGTTCCATATTAAATTGAATTTGGCACTTTGCTACTTATCAAAATTGATAAAAGAGCATCCAAGCTGGCTTGACACTTTTGCAGAATATAATGGAGAAGCTTCTGATTCTGACGAGTACATGATGCAATATGAGAAATCAGTTGAAAGTTTTAAACAAAAGTTATACACAGGGCTTGCTCTATTTGAACGGAGGTTTTTATTGGCTCCTCGCTGTCTAATCAGTATGATTTTACTCTTACTTTGCCATCATGGATCATTGTACATTGGGTATGATATGACAGATGGATACACTCAAGCAGAACTGTCTCAAAAGAAGAGCAATATATTTGATGATTTCAATTTATATTACTCTCGGATTAAACCCCTGTTCAAGACTGCAGAAGAAGTCTCCTTTTTCTATTCAAGATTTTTTTGTGCCTGCAGTATGGAAAATTCTCAACAAAATTCATCTATTGATAGCAAACCTAAGTTTTTGGATGCTTTTCAATGCTGCTTTGAAGGTGTTTTGATTTCATTGTGGTTTTTAAGAGCAAATTTTAGGATTCAGTTGAGTTCTATTTGCAAAGATCTTGTCAAAACACATCTTGATATCCTGGATTTGTATGAATATTATTTACATTTTTCATTAGCTTGGCTTCAAAAAAACTCGGAAGCGCTTTTGTATATGTTGGAACCATTCTTGGTTGCACAATCTAATGACCGTAATCCTTACAACATTGATATTGTGAATCTGAAGAAGCTTATCCCAAAAATTGGGCAGTTGTTGGCTCAAACTTCTTTCATGTCTAATATACAAAACCTTCAACTATCCGAACGTGCAGAAGATAAACTAGTTGCAGATATAAAGCATTCAATTCCTGATGATGAAAGATGGAAGATTATAGGGACCTGCTTGTGGCAGCATATGTCTAGATTCATGATATTTAATTTGAATCTGGTTCTTGCCAAACTTGAAGATGGTAAACTGTCGGGTCCTTTCCACAGAAAATATACTTATGGGGAGTCTTATCTCATAAATATGGATTCTGAAAGCATCAGCTTGCCAGAGAAGATTCGGTTAGTCTTGTTTAGCCTATGTGATCTACTGATGACAACAGTTACTCACATTTCTTCTTATCATGTTAAACAACAAGCAGAATTTCTGTGGCAGAAAGTAGGGAATGATTTGAATGTAATGACTCTTCAATGGTTAAAACAAAAATCAGAATTCAGCCAGAACCAAAACCTGGACATTTTGGAACTGGGGAACATGAAAGATAACTATTCAGTTAATCAGTTATTATGGGATCGCTGTGCGGATCCCAAATTGATATCTGATTGCTTTGCACAGGAAAAACTCAATTGGCCAAATGATTTGGATCAGATGAATACTAAAGGATGGAATGATTTGTCTATAATTATGACAGGACTGCATAAAACTGATGATACATGTGGTGATGGATGTAAACTTAGCACTAGATCTTCTAATCATGAAGTTGGAACTCCTGTTAAAGGAACATCTCTAAGTGGCAATGCTTCTGCAAGATCAAACCAGAAAGATATAACTTATACAAATTTTGCAGTTTTCCAGAGTCCCAGAGAAATGTACAAGAGAAATGGAGAACTTTTGGAGGCATTGTGTATAAACTCTACCAATCAACGGGAAGCTGCAGTTGCTGGCAACAGGAAGGGTATAATGTTCTTTCATTGGGAAGATGAGATTCCTTTTAGTGGTAAATCAGATGATCTTTTGTGGGCCACAGCTGATTGGCCTCAGAATGGATGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCTGCTCCAACATGTGTTTCTCCTGGTGTTGGCCTTGGGAGCAAGAAAGGGGCACACCTTGGGCTGGGTGGAGCAACTATTGGTGTGGACTCTTCAGCTTGGCCCAGCAATGACTTGACAGGTGGTGGAGTATTAGGAATGCTAGGTTATACTGGTATTGGTGCCTCTGGATTAGGTTGGGAAATTCAACAAGATTTTGAAGATTTTGTGGATCCACTTGCCACTTTGGAGAACATAAGTACCAGGGCTTTGTCTAGTCATCCTATGAGACCTTTTTTCTTGGTTGGTTCTAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAACAAAGACAAAGCTACTGCTACATATGGAGTGCTGCCTGCTGCCAATGTCCCTCCACCTTATGCCCTTGCATCAATTTCAGCCTTGCAGTTTGACCACTTTGGACACCGGTTTGCCAGTGCTGCATTAGATGGAACTGTCTGCACGTGGCAGCTGGAGGTTGGAGGAAGGAGCAATGTTCGTCCAACAGAATCATCTCTTTGCTTTAACGGTCATGCATCGGACGTCACATATTTTTCCTCAAGTGGATCGATAATAGCTGTGGCTGGATATAGCTCTAATGGTGTTAATGTGGTCATATGGGATACTTTAGCTCCACCCACTACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCACACACCGTGTCTGTTTTTGATAATCATGTGGGAAGTGGTTCTGTATCCCCCCTTATTGTGACTGGTGGTAAAGGTGGTGATGTTGGACTTCATGACTTCCGCTATATAGCTACTGGAAAGGCTAAAAGGCATAAGCGTGCTGATAACATTGGGCAAAGCTCTGTCTCATCTTTAACTCGTGATAAGGATCAAAATGTAGATGGGATGCTTTGGTACATTCCAAAGGCTCACTCAGGGAGTGTCACAAAAGTAGTTACCATCCCAAATACCAGCTTGTTTTTAACTGGAAGCACAGATGGAGATGTCAAACTCTGGGATGCCCAGAGCACAAAGTTAATACATCACTGGTCAAAGATACATGAAAAACACACCTTTCTGCAGCCAAGTTCTCGTGGATTTGGTGGTGTTGTTCGGGCTGCTGTTACGGATATACAAGTTGTTCCCCATGGTTTTCTTTCTTGCGGTGGGGATGGAATTGTAAAGCTGGTACGGCTGGACAATCACCTGCGTGCCCATGGAATTGAGTTATGA
Predicted protein sequences of Glyma.07g054500
>Glyma.07g054500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g054500.1 locus=Glyma.07g054500 id=Glyma.07g054500.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MTESEKMNPIDHLPLRLLRSDTVPPAPTFSESTVDFLPHFSGYSWIAYAASSLLTISHFPSPLSPHQTRIGPFFRQSFQLSAHPVAAVAWSPSSPSSGDLAAAADDCIWLFRHDSAAGKGSFCWSQNAVLVQHMKVANIKWTGSGDGIISVGMEVVFWKKSNTCWEVAWKFKADQPQTLVCATWSIEGPSATAAHPSREHIEGTLTNEESKCVLVCQSNGLSEYSKVKLHHPLPVVMIQWRPSRGKLSNRYGKCSVRHVLLTCSLDGTARLWSEIDNAKARRTAKDINDQKNAGCSFCVVAVIEINQSLNATLSSDIFVRWGTEFEGLFQTDKEAKQVFSKEGFEHDVRNCDWLVGFGPGMLLSFWAVHCLDDVSPLRFPRVTLWKKHELQNHDIANVYKFNSSDFKNALFLHKVIILRSCLFGPPTICSSLQLLPCNSLVWSNFRIQTIHNAVEDSNDNVNTDNISSHLTGGVLNLDGHSGKILKVSLHPCTCKVQFAASLDSNGLLLFWSLSNISNCILGCPTLVPTMELCGKLATQDSCSLYTSLKWAPSILGDKLVFFMGHTRGIDCFIVNICQSEEENIECHYLCTIPFSGHGPYEDGPFDIFTIPLNSTCDKTFRNNKLMLLAIWMGRFQALSWEVNLHSFDMSTNCCECNFDVKSIDNCSVRAFESTFANKKYCITVNPCSCEFPSSKDLVTSFAVADSGTLSHRQQEFSLANDLCSSYPAYIMATGSSDGILKLWKSKPGNSLTQHLPWELVGSFVAHDGPIKDICLANCGEKIATFCYESNSNAINTIHIWDAVPLISAGTFILEDKIKTESDVIALKWLTLGTGELLLGVCLQNELHVYAPKRCVGTTLSDSVNFPKMNIWVCIAYAHTSIPIYDFLWGPRAAAVVIHGNYFSIFSHWLFHEDKKQGSKFRPCDSKPNTYNCKDEIYEDILSSVFTEYDIGAYREQSLGDSHADFDSVQSIKINMKDNSSSLFLAKEQLKSELLTKVGLWSILEVAEIISGSLPTYHPDVLLTNISSGNWKRAYVAVRHLVECLTNYDPKKRHISKRIGLPNVLLSYYLEGCIPKGSQPKGFQWGGDAALITSISQAQSSLFRFPYHSDSSVENESISSSTKSELNDFIESLEKFPDLPFLVDIEKTQILAIIDLLSEVSSAHSSSAYQSLDEPGRRFWVALRFQQLLFLRKFARAASFEELLVDSRLFVWAYHSDCLDNLFGSVIPNEPSWQEMRALGMGFWYANIPQLRARMEKLARAQYLKNKNPKDCALLYIALNRVQVLAGLFKISKDEKDKPLVGFLSRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAIAFFLLGGDHSSAINICAKNLGDEQLALVICRLVEGHGGPLEHHLITKYILPFAIDKGDYWLASLLEWEMGNYYQSFYRMLEFSVNPVPRESTVMSNCGPFLDPTVGFYCQMLATKNSMRNAVGEQNSAILLRWATLMTVAALKRCGNPLEALEYFSSSLSMPGTADQESELGDSHDVLSSTLKPLPRKCSNWLSANMSVHLEFHIKLNLALCYLSKLIKEHPSWLDTFAEYNGEASDSDEYMMQYEKSVESFKQKLYTGLALFERRFLLAPRCLISMILLLLCHHGSLYIGYDMTDGYTQAELSQKKSNIFDDFNLYYSRIKPLFKTAEEVSFFYSRFFCACSMENSQQNSSIDSKPKFLDAFQCCFEGVLISLWFLRANFRIQLSSICKDLVKTHLDILDLYEYYLHFSLAWLQKNSEALLYMLEPFLVAQSNDRNPYNIDIVNLKKLIPKIGQLLAQTSFMSNIQNLQLSERAEDKLVADIKHSIPDDERWKIIGTCLWQHMSRFMIFNLNLVLAKLEDGKLSGPFHRKYTYGESYLINMDSESISLPEKIRLVLFSLCDLLMTTVTHISSYHVKQQAEFLWQKVGNDLNVMTLQWLKQKSEFSQNQNLDILELGNMKDNYSVNQLLWDRCADPKLISDCFAQEKLNWPNDLDQMNTKGWNDLSIIMTGLHKTDDTCGDGCKLSTRSSNHEVGTPVKGTSLSGNASARSNQKDITYTNFAVFQSPREMYKRNGELLEALCINSTNQREAAVAGNRKGIMFFHWEDEIPFSGKSDDLLWATADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGVGLGSKKGAHLGLGGATIGVDSSAWPSNDLTGGGVLGMLGYTGIGASGLGWEIQQDFEDFVDPLATLENISTRALSSHPMRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASISALQFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNVRPTESSLCFNGHASDVTYFSSSGSIIAVAGYSSNGVNVVIWDTLAPPTTSRASILCHEGGAHTVSVFDNHVGSGSVSPLIVTGGKGGDVGLHDFRYIATGKAKRHKRADNIGQSSVSSLTRDKDQNVDGMLWYIPKAHSGSVTKVVTIPNTSLFLTGSTDGDVKLWDAQSTKLIHHWSKIHEKHTFLQPSSRGFGGVVRAAVTDIQVVPHGFLSCGGDGIVKLVRLDNHLRAHGIEL*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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