SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.07g053100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm07
Start:4625848
stop:4632399
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.07g053100
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G00900.1AT ATECA2,ECA2 JGI N/AIEA
3.6.3.8EC JGI N/AIEA
GO:0000166GO-mf nucleotide binding JGI N/AIEA
GO:0046872GO-mf metal ion binding JGI N/AIEA
K01537KEGG Enzymes with EC numbers JGI N/AIEA
PTHR24093PantherFam CATION TRANSPORTING ATPASE JGI N/AIEA
PF00122Pfam E1-E2 ATPase JGI N/AIEA
PF00689Pfam Cation transporting ATPase, C-terminus JGI N/AIEA
PF00690Pfam Cation transporter/ATPase, N-terminus JGI N/AIEA
PF13246Pfam Cation transport ATPase (P-type) JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.07g053100 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma07g05890 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.07g053100
>Glyma.07g053100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g053100.1.p locus=Glyma.07g053100 id=Glyma.07g053100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g053100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g053100.2.p locus=Glyma.07g053100 id=Glyma.07g053100.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g053100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.07g053100.4.p locus=Glyma.07g053100 id=Glyma.07g053100.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.07g053100
>Glyma.07g053100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g053100.1 locus=Glyma.07g053100 id=Glyma.07g053100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g053100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g053100.2 locus=Glyma.07g053100 id=Glyma.07g053100.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.07g053100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.07g053100.4 locus=Glyma.07g053100 id=Glyma.07g053100.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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