Report for Sequence Feature Glyma.07g036200
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm07
Start: 2928590
stop: 2933436
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.07g036200
Database ID Annotation Type Annotation Description Annotation Source Match Score Evidence Code
AT1G72830.1 AT
nuclear factor Y, subunit A3
JGI N/A IEA
GO:0006355 GO-bp
regulation of transcription, DNA-templated
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0006355 GO-bp
regulation of transcription, DNA-templated
JGI N/A IEA
GO:0016602 GO-cc
CCAAT-binding factor complex
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0003677 GO-mf
DNA binding
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0003700 GO-mf
DNA binding transcription factor activity
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0003700 GO-mf
sequence-specific DNA binding transcription factor activity
JGI N/A IEA
KOG1561
KOG
CCAAT-binding factor, subunit B (HAP2)
JGI N/A IEA
PTHR12632 Panther
TRANSCRIPTION FACTOR NF-Y ALPHA-RELATED
JGI N/A IEA
PTHR12632:SF5 Panther
JGI N/A IEA
PF02045 PFAM
CCAAT-binding transcription factor (CBF-B/NF-YA) subunit B
JGI N/A IEA
Proteins Associated with Glyma.07g036200
Locus Gene Symbol Protein Name
NF-YA05 nuclear transcription factor Y subunit A-5
Expression Patterns of Glyma.07g036200
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
Gene information in GlycineMine developed by LIS .
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Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.07g036200
Paralog Evidence Comments
Glyma.16g005500 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.07g036200 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma07g04050 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.07g036200
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.07g036200.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TGGAGGAGTATGAGACAATAGTGGAGTGGGGTACAACTTTCTGTTTCAGATTGAGAATTTCTTCTAAGCTTTTAAGTACATACATGTACATGCACAGCACAGCTTTTGGTTGGTATCAAAAATCCCATTTCTTGTTCCTCTTCACTTTACTGATTTTTCAAGGTAGATGCCCCTTTGGGAAATAGTTGCCGTTGATTGAGAAAAGGCTGTAGACCAATCCTGTTGTTGAAGGTAAGTGCGACTCTAAGCAAGCCTTGATCGATAGTAGAAAACAATGAAGAACTTATGTGAGAATGGCTCTGGTCCTACCCATTTAACATCTTATGCTCTTGGATGCTCATCATGGGGGACTTCCTCTGAATCTGATGTGCAACAATCATCCATGTCCAAAAGTTTGAGCTTGAAAATGAGTGTTCTGCCGCAACAATGCCATAAGACCAAACCATTGAGTTTTCAATATCAAGATCGAGATTCATCTTCAACTCAATCAACCGGTCAGTCTTATCCAGAAGTTGGTTCAGCACAATCAGGTCAAATTTCAGTGCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTAGTTCAACACACAACACAACTGGGGGAAAGAGTGTGGAAGGTGTCATCGGGTCAACTGTGGGGATTCAGGATTGTACCTTCCCTCCTTCACAACTGTGTTACAACCAATCACTTGCTCATACTGCATTCCACTTTGCTGAGCCGTGCTTTAGTGGCCTACTAGCTGCTCCATTTGTGCCACAATCTAATATTCATCATGCTCAGCTACTAGGAATGACTCCTGCTCGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCCATGTATGTGAACGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGACGCAGGCAGTATCGTGCAAAACTGGAAGCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAACCATATCTTCATGAGTCCCGCCATCTACATGCACTGAAGAGAGCTAGAGGTTCCGGTGGACGCTTTTTGAATGCCAAAAAGCTCCAAGAGTTGAAACTCACTTCAGCAAACCGTGGCCTAGATGTTTCTGGCTGTACTCAATTGAATCTGAGTGGAAATATGTCAGAATCAAAGGTTCAAGCAGTAGAAAACTTGAACTACAGAAATGGTGCTTCTACAACCACGTGTTCTGATGTCATTAGTACATCTAATAGTGATGATGTCTTCCAGCAACATGAGTCAGACTTTAGGTTATGTGGTTACCCTTCTCATATTGGAAGGAACATGCAGGGTTATTCCGCAGACATtggtggtggtggtggtggtggAAATCAACACCGTCTATCAGTCCTTATGTGACAAACTTTTATGGCACACTAGCAAGTTATTCTTCAGCGCTCTGTTGGAGATCATAATTGCCTGTGTTCCATAGGGAAGTCATCCTTGGCTCATTTACATTATTATGTTTTTACTAATATGTTTATGTTAGTTGTTTTGGAACAAAGATATAGACCTTTGCTAGATTTCAATTTTCTTATATTGATGACTGAAATATTTGGGCAAAGTAGCACATTTAACTGACTAGTCACAAGCAATATTTCTTTTATGTTGATGTTACATTGGAAAATGTCTTTTTGAGAACTAAGGTTTTGGTTGTGGTGTATGTTTTATCTTTGTACACTGATGCTTTATTAATTTTGAGAGAAGTGCCTTGGCTGCTGTTGGTGTCTTTGCTAAAATCATTTGTGTTAGGTCTTTGTCGTTTTTTGCTTGGGCTTATATGGTTGATAAAGCCTCCACAACATTTTGGTGGTGGATAGGTGTTATGATAGAAGTTGCCACTTGTGTGAAGGTGCCAATATCAAAGCATCTTTTGCTTTGCTAAATATCACTTCTCAATTTTGCCTTGCTTC
>Glyma.07g036200.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CAATAGTGGAGTGGGGTACAACTTTCTGTTTCAGATTGAGAATTTCTTCTAAGCTTTTAAGTACATACATGTACATGCACAGCACAGCTTTTGGTTGGTATCAAAAATCCCATTTCTTGTTCCTCTTCACTTTACTGATTTTTCAAGATGCCCCTTTGGGAAATAGTTGCCGTTGATTGAGAAAAGGCTGTAGACCAATCCTGTTGTTGAAGGTAAGTGCGACTCTAAGCAAGCCTTGATCGATAGTAGAAAACAATGAAGAACTTATGTGAGAATGGCTCTGGTCCTACCCATTTAACATCTTATGCTCTTGGATGCTCATCATGGGGGACTTCCTCTGAATCTGATGTGCAACAATCATCCATGTCCAAAAGTTTGAGCTTGAAAATGAGTGTTCTGCCGCAACAATGCCATAAGACCAAACCATTGAGTTTTCAATATCAAGATCGAGATTCATCTTCAACTCAATCAACCGGTCAGTCTTATCCAGAAGTTGGTTCAGCACAATCAGGTCAAATTTCAGTGCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTAGTTCAACACACAACACAACTGGGGGAAAGAGTGTGGAAGGTGTCATCGGGTCAACTGTGGGGATTCAGGATTGTACCTTCCCTCCTTCACAACTGTGTTACAACCAATCACTTGCTCATACTGCATTCCACTTTGCTGAGCCGTGCTTTAGTGGCCTACTAGCTGCTCCATTTGTGCCACAATCTAATATTCATCATGCTCAGCTACTAGGAATGACTCCTGCTCGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCCATGTATGTGAACGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGACGCAGGCAGTATCGTGCAAAACTGGAAGCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAACCATATCTTCATGAGTCCCGCCATCTACATGCACTGAAGAGAGCTAGAGGTTCCGGTGGACGCTTTTTGAATGCCAAAAAGCTCCAAGAGTTGAAACTCACTTCAGCAAACCGTGGCCTAGATGTTTCTGGCTGTACTCAATTGAATCTGAGTGGAAATATGTCAGAATCAAAGGTTCAAGCAGTAGAAAACTTGAACTACAGAAATGGTGCTTCTACAACCACGTGTTCTGATGTCATTAGTACATCTAATAGTGATGATGTCTTCCAGCAACATGAGTCAGACTTTAGGTTATGTGGTTACCCTTCTCATATTGGAAGGAACATGCAGGGTTATTCCGCAGACATtggtggtggtggtggtggtggAAATCAACACCGTCTATCAGTCCTTATGTGACAAACTTTTATGGCACACTAGCAAGTTATTCTTCAGCGCTCTGTTGGAGATCATAATTGCCTGTGTTCCATAGGGAAGTCATCCTTGGCTCATTTACATTATTATGTTTTTACTAATATGTTTATGTTAGTTGTTTTGGAACAAAGATATAGACCTTTGCTAGATTTCAATTTTCTTATATTGATGACTGAAATATTTGGGCAAAGTAGCACATTTAACTGACTAGTCACAAGCAATATTTCTTTTATGTTGATGTTACATTGGAAAATGTCTTTTTGAGAACTAAGGTTTTGGTTGTGGTGTATGTTTTATCTTTGTACACTGATGCTTTATTAATTTTGAGAGAAGTGCCTTGGCTGCTGTTGGTGTCTTTGCTAAAATCATTTGTGTTAGGTCTTTGTCGTTTTTTGCTTGGGCTTATATGGTTGATAAAGCCTCCACAACATTTTGGTGGTGGATAGGTGTTATGATAGAAGTTGCCACTTGTGTGAAGGTGCCAATATCAAAGCATCTTTTGCTTTGCTAAATATCACTTCTCAATTTTGCCTTGCTTC
>Glyma.07g036200.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
GCAGGCAGACTTGTATTTGCTGATGGTTGATACCTTACTGTTGTATTTGCCTATAACTTTGTTTCTTGTTTATGTGAATATTCTGGGAATTAACCATTTATGAATTGGAGCTTTCAAATTTGACATGCTTTTTATGATGTCAAAAGTCTTAAAAAGGGAAGAATTCCTTTTCATTCAACTCCtctcttttctttttctcttatcttttaataccccatattttttattttttattttcaattttttaACGGTTCACATGCATTCTATCTGTCTATTCTGTTTTGTTGATTCAAGTTGTTTTTTGTTGGATTGCTTTGTAAAGGCTGTGAACTTGTAAATGATTCCTATACTCGTACTTTTCAAAGAAATTTATTAACTTTCTTATTATTGGCATGCGTTTATTGTTGAATGAAACCAACATTTGGTGCTCCCATTTCATTTCAAACTCATGCTTCCTGCTTTTGATGACGTACTGCATATTGTTCATTTGTTTGCATAAAAAGAAACACATGGCTTTCTATAGGCCAATCTAGGTGTCGTGTATAACACATGATAAGTTGATCTAAGATTTGAAAAGATTAACCAGTAATTTTTTCGAATCTCTATATCAAGTTCTTACAAGTATCTTATAGGAGCTTCTGCATGGCACTTCAGATTGTCTGATTTCTATGCTTTCTAGTCAGTTTACAGGAACATAATGTTTTTCTCTTTCATATATCTCTTTTCCAATACTGAACCGTGAGTTTATTTTCTGACTATACACATGCCACAAGCTGGCTTGTCTTATTTGTTTGTGCATGTATAAGTTAACATGTTCATTAATAGTTTGATATGTTTATATAATTTCAAAAACCCCAAATTCATGCGGTTGCTTTGCATATTATGGTTGCTATTAATAATTGCAACAGCAATCTGATAGGTAGATGCCCCTTTGGGAAATAGTTGCCGTTGATTGAGAAAAGGCTGTAGACCAATCCTGTTGTTGAAGTTTGAGCTTGAAAATGAGTGTTCTGCCGCAACAATGCCATAAGACCAAACCATTGAGTTTTCAATATCAAGATCGAGATTCATCTTCAACTCAATCAACCGGTCAGTCTTATCCAGAAGTTGGTTCAGCACAATCAGGTCAAATTTCAGTGCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTAGTTCAACACACAACACAACTGGGGGAAAGAGTGTGGAAGGTGTCATCGGGTCAACTGTGGGGATTCAGGATTGTACCTTCCCTCCTTCACAACTGTGTTACAACCAATCACTTGCTCATACTGCATTCCACTTTGCTGAGCCGTGCTTTAGTGGCCTACTAGCTGCTCCATTTGTGCCACAATCTAATATTCATCATGCTCAGCTACTAGGAATGACTCCTGCTCGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCCATGTATGTGAACGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGACGCAGGCAGTATCGTGCAAAACTGGAAGCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAACCATATCTTCATGAGTCCCGCCATCTACATGCACTGAAGAGAGCTAGAGGTTCCGGTGGACGCTTTTTGAATGCCAAAAAGCTCCAAGAGTTGAAACTCACTTCAGCAAACCGTGGCCTAGATGTTTCTGGCTGTACTCAATTGAATCTGAGTGGAAATATGTCAGAATCAAAGGTTCAAGCAGTAGAAAACTTGAACTACAGAAATGGTGCTTCTACAACCACGTGTTCTGATGTCATTAGTACATCTAATAGTGATGATGTCTTCCAGCAACATGAGTCAGACTTTAGGTTATGTGGTTACCCTTCTCATATTGGAAGGAACATGCAGGGTTATTCCGCAGACATtggtggtggtggtggtggtggAAATCAACACCGTCTATCAGTCCTTATGTGACAAACTTTTATGGCACACTAGCAAGTTATTCTTCAGCGCTCTGTTGGAGATCATAATTGCCTGTGTTCCATAGGGAAGTCATCCTTGGCTCATTTACATTATTATGTTTTTACTAATATGTTTATGTTAGTTGTTTTGGAACAAAGATATAGACCTTTGCTAGATTTCAATTTTCTTATATTGATGACTGAAATATTTGGGCAAAGTAGCACATTTAACTGACTAGTCACAAGCAATATTTCTTTTATGTTGATGTTACATTGGAAAATGTCTTTTTGAGAACTAAGGTTTTGGTTGTGGTGTATGTTTTATCTTTGTACACTGATGCTTTATTAATTTTGAGAGAAGTGCCTTGGCTGCTGTTGGTGTCTTTGCTAAAATCATTTGTGTTAGGTCTTTGTCGTTTTTTGCTTGGGCTTATATGGTTGATAAAGCCTCCACAACATTTTGGTGGTGGATAGGTGTTATGATAGAAGTTGCCACTTGTGTGAAGGTGCCAATATCAAAGCATCTTTTGCTTTGCTAAATATCACTTCTCAATTTTGCCTTGCTTC
>Glyma.07g036200.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CTTTATTtattaatgttagtgataagaacaataataatattaaattttaataatGGAGAATTGAGAAAGGTGGTTTTCTATGTGGAAGGTGTGTGGTGAGAGACTATACTTGAAGTTGAACTTGATTGACGTGTGTTAATGCAGAGAGAGATATTTCATTGTTGTTCAAAGTCTTTGGTGCACTTAAAAGAGACCAGATACAAGTGAAAGTGGATGATGAAGTGGAGGAGTATGAGACAATAGTGGAGTGGGGTACAACTTTCTGTTTCAGATTGAGAATTTCTTCTAAGCTTTTAAGTACATACATGTACATGCACAGCACAGCTTTTGGTAGATGCCCCTTTGGGAAATAGTTGCCGTTGATTGAGAAAAGGCTGTAGACCAATCCTGTTGTTGAAGGTAAGTGCGACTCTAAGCAAGCCTTGATCGATAGTAGAAAACAATGAAGAACTTATGTGAGAATGGCTCTGGTCCTACCCATTTAACATCTTATGCTCTTGGATGCTCATCATGGGGGACTTCCTCTGAATCTGATGTGCAACAATCATCCATGTCCAAAAGTTTGAGCTTGAAAATGAGTGTTCTGCCGCAACAATGCCATAAGACCAAACCATTGAGTTTTCAATATCAAGATCGAGATTCATCTTCAACTCAATCAACCGGTCAGTCTTATCCAGAAGTTGGTTCAGCACAATCAGGTCAAATTTCAGTGCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTAGTTCAACACACAACACAACTGGGGGAAAGAGTGTGGAAGGTGTCATCGGGTCAACTGTGGGGATTCAGGATTGTACCTTCCCTCCTTCACAACTGTGTTACAACCAATCACTTGCTCATACTGCATTCCACTTTGCTGAGCCGTGCTTTAGTGGCCTACTAGCTGCTCCATTTGTGCCACAATCTAATATTCATCATGCTCAGCTACTAGGAATGACTCCTGCTCGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCCATGTATGTGAACGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGACGCAGGCAGTATCGTGCAAAACTGGAAGCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAACCATATCTTCATGAGTCCCGCCATCTACATGCACTGAAGAGAGCTAGAGGTTCCGGTGGACGCTTTTTGAATGCCAAAAAGCTCCAAGAGTTGAAACTCACTTCAGCAAACCGTGGCCTAGATGTTTCTGGCTGTACTCAATTGAATCTGAGTGGAAATATGTCAGAATCAAAGGTTCAAGCAGTAGAAAACTTGAACTACAGAAATGGTGCTTCTACAACCACGTGTTCTGATGTCATTAGTACATCTAATAGTGATGATGTCTTCCAGCAACATGAGTCAGACTTTAGGTTATGTGGTTACCCTTCTCATATTGGAAGGAACATGCAGGGTTATTCCGCAGACATtggtggtggtggtggtggtggAAATCAACACCGTCTATCAGTCCTTATGTGACAAACTTTTATGGCACACTAGCAAGTTATTCTTCAGCGCTCTGTTGGAGATCATAATTGCCTGTGTTCCATAGGGAAGTCATCCTTGGCTCATTTACATTATTATGTTTTTACTAATATGTTTATGTTAGTTGTTTTGGAACAAAGATATAGACCTTTGCTAGATTTCAATTTTCTTATATTGATGACTGAAATATTTGGGCAAAGTAGCACATTTAACTGACTAGTCACAAGCAATATTTCTTTTATGTTGATGTTACATTGGAAAATGTCTTTTTGAGAACTAAGGTTTTGGTTGTGGTGTATGTTTTATCTTTGTACACTGATGCTTTATTAATTTTGAGAGAAGTGCCTTGGCTGCTGTTGGTGTCTTTGCTAAAATCATTTGTGTTAGGTCTTTGTCGTTTTTTGCTTGGGCTTATATGGTTGATAAAGCCTCCACAACATTTTGGTGGTGGATAGGTGTTATGATAGAAGTTGCCACTTGTGTGAAGGTGCCAATATCAAAGCATCTTTTGCTTTGCTAAATATCACTTCTCAATTTTGCCTTGCTTC
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>Glyma.07g036200.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.07g036200.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.07g036200.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.07g036200.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.07g036200 ID=Glyma.07g036200.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.07g036200
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
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Predicted protein sequences of Glyma.07g036200
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
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