SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.06g203800

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm06
Start:18907446
stop:18912173
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.06g203800
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G61030.1AT GR-RBP3 JGI N/AIEA
GO:0003676GO-mf nucleic acid binding JGI N/AIEA
K12741KEGG Spliceosome JGI N/AIEA
PTHR24012PantherFam RNA BINDING PROTEIN JGI N/AIEA
PF00076Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.06g203800 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma06g22150 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.06g203800
>Glyma.06g203800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g203800.1.p locus=Glyma.06g203800 id=Glyma.06g203800.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTGGTGTGCAGAATATAACTTCAGTGTTTATGTCTTTTCTCAGGTTGCAGGAATGGCTTTCTTTGGTAGAGTCGGGAATATACTGAGACAAGCAACGAATCAGAAGATCGGTTTGGAGATACGTTCTTTGTCATCTGTTTTCCAGGCTACACGGTGCATGTCAAATGCTCCAAATTCAAGGCTGTTTATAGGAGGTGTTTCGTATTCTATTGACGCGCAAAGTTTGGGGGAAATTTGTTCACAATATGGCCAAGTTGTTGATGCAAGGATAATTATGGATCGTGAAACTGGTAGGCACAGAGGATTTGGTTTTATCACTTACAGTAATGTTGATGAGGCATCGCGTGCCCTTCAAGCCTTGGATGGACAGGATCTTGACGGTCGTCGGGTTGAGGTAAAATTTGCAATTGAAAGATCCCATGGATTTGGTGGTGGCGGCTTTGGTGGATCTTATGGCAATACTCCCTATGATGCTGGAGCTGGCACTGGGCATCCAGGTAGTTATGGCAACACTCCATATGGTGCTGCAAGTGGTGGGTATGACAATACTGGTGGTGGCAATGCTGCTGGAGTTTATGGCAGGGGTGAAGATGGTGGAGGTGGCAATTGGCCGAGTGGTAATTTTGGGGTAAGCAGCTTTGGTAATAACTATGGCGATGCTGGTGTCTATGCTGGCAATTCTGCTGGAGGTTATGACAACAATGGATATGGTGGAGGATCTGGCGGTGACGCGGGTCCCTATGGTAGCAATGCTGCTAGAGATTATGACAACGGCGTTGGAGGATCAGGTAGCAGTTTTGGGGACAGAAGCTCTGGCAAGAACTATGGTGATGCCGGTGCCTTCAGAGCCAATGCTGCCAGTGAATATGGTGGAGGATCAGGTGGCAGTTTTGGGGACAGCAGCTCTGTCAACAACTATGGTGCTGGTGGTGGTTATAATGGAACCGGAACGAGTTACAGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACCAGTAACCCTTACAACGATGGACCAGGTGCTGCCGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGTGGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGCTGGAGGAAGGCAGAGTTTTGCCGGTAGTCAGCACCCTGGAAGTGCCATGGCGAATGCCAGTGACGGTACAGATACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACCAGTAAAACATACAATGATGGAACAGGTGCTGCTGGATTTGGCAAGAATAATAAGTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGCAGCAGTAGGTATGATAGTGCTGCCTCTGTTGGCAGCCAGAGTTTTGCCGGTAAACAGCACCCTGGAATGGTGAATGGCAGTGATGGTACAGGTACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTATGCAACCAGTAACACTGACAAGGATGGAACAGGTGCTGCCGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGCTGGATTTGGTAGTGGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGGTGGAAGGCAGTGTTTTGCCGGTAGTCAGCACCCTGGAATTGCCATGGCGAATGCCAGTGATGGTACAGATACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACATGTAACAGTTACAACGATGGAACAGGTACTGCTGGATTTGGCAAGAGTAATAAGTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGCAGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGTTGGCAGCCAGAGTTTTGCCAGTAGTCAGCACCCTGGAAGTGCCATGGCGAATGCCAGTAATGGTACAGGTACCGGAAATGACTTTGCTGATAGATATCATGGCAGCGGTGGCCAATTCGGTAGCAATCAAAGCAGCAATGTGGGTCAACATGGTCGAGATTTTGGAGGCTCGTTCGACGAAGATTTCAGGATCGGCAATTATGAAAATGATGCCTTTGCTGGACGGGCATGA

>Glyma.06g203800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g203800.2.p locus=Glyma.06g203800 id=Glyma.06g203800.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTTTCTTTGGTAGAGTCGGGAATATACTGAGACAAGCAACGAATCAGAAGATCGGTTTGGAGATACGTTCTTTGTCATCTGTTTTCCAGGCTACACGGTGCATGTCAAATGCTCCAAATTCAAGGCTGTTTATAGGAGGTGTTTCGTATTCTATTGACGCGCAAAGTTTGGGGGAAATTTGTTCACAATATGGCCAAGTTGTTGATGCAAGGATAATTATGGATCGTGAAACTGGTAGGCACAGAGGATTTGGTTTTATCACTTACAGTAATGTTGATGAGGCATCGCGTGCCCTTCAAGCCTTGGATGGACAGGATCTTGACGGTCGTCGGGTTGAGGTAAAATTTGCAATTGAAAGATCCCATGGATTTGGTGGTGGCGGCTTTGGTGGATCTTATGGCAATACTCCCTATGATGCTGGAGCTGGCACTGGGCATCCAGGTAGTTATGGCAACACTCCATATGGTGCTGCAAGTGGTGGGTATGACAATACTGGTGGTGGCAATGCTGCTGGAGTTTATGGCAGGGGTGAAGATGGTGGAGGTGGCAATTGGCCGAGTGGTAATTTTGGGGTAAGCAGCTTTGGTAATAACTATGGCGATGCTGGTGTCTATGCTGGCAATTCTGCTGGAGGTTATGACAACAATGGATATGGTGGAGGATCTGGCGGTGACGCGGGTCCCTATGGTAGCAATGCTGCTAGAGATTATGACAACGGCGTTGGAGGATCAGGTAGCAGTTTTGGGGACAGAAGCTCTGGCAAGAACTATGGTGATGCCGGTGCCTTCAGAGCCAATGCTGCCAGTGAATATGGTGGAGGATCAGGTGGCAGTTTTGGGGACAGCAGCTCTGTCAACAACTATGGTGCTGGTGGTGGTTATAATGGAACCGGAACGAGTTACAGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACCAGTAACCCTTACAACGATGGACCAGGTGCTGCCGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGTGGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGCTGGAGGAAGGCAGAGTTTTGCCGGTAGTCAGCACCCTGGAAGTGCCATGGCGAATGCCAGTGACGGTACAGATACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACCAGTAAAACATACAATGATGGAACAGGTGCTGCTGGATTTGGCAAGAATAATAAGTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGCAGCAGTAGGTATGATAGTGCTGCCTCTGTTGGCAGCCAGAGTTTTGCCGGTAAACAGCACCCTGGAATGGTGAATGGCAGTGATGGTACAGGTACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTATGCAACCAGTAACACTGACAAGGATGGAACAGGTGCTGCCGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGCTGGATTTGGTAGTGGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGGTGGAAGGCAGTGTTTTGCCGGTAGTCAGCACCCTGGAATTGCCATGGCGAATGCCAGTGATGGTACAGATACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACATGTAACAGTTACAACGATGGAACAGGTACTGCTGGATTTGGCAAGAGTAATAAGTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGCAGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGTTGGCAGCCAGAGTTTTGCCAGTAGTCAGCACCCTGGAAGTGCCATGGCGAATGCCAGTAATGGTACAGGTACCGGAAATGACTTTGCTGATAGATATCATGGCAGCGGTGGCCAATTCGGTAGCAATCAAAGCAGCAATGTGGGTCAACATGGTCGAGATTTTGGAGGCTCGTTCGACGAAGATTTCAGGATCGGCAATTATGAAAATGATGCCTTTGCTGGACGGGCATGA

>Glyma.06g203800.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g203800.4.p locus=Glyma.06g203800 id=Glyma.06g203800.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTTTCTTTGGTAGAGTCGGGAATATACTGAGACAAGCAACGAATCAGAAGATCGGTTTGGAGATACGTTCTTTGTCATCTGTTTTCCAGGCTACACGGTGCATGTCAAATGCTCCAAATTCAAGGCTGTTTATAGGAGGTGTTTCGTATTCTATTGACGCGCAAAGTTTGGGGGAAATTTGTTCACAATATGGCCAAGTTGTTGATGCAAGGATAATTATGGATCGTGAAACTGGTAGGCACAGAGGATTTGGTTTTATCACTTACAGTAATGTTGATGAGGCATCGCGTGCCCTTCAAGCCTTGGATGGACAGGATCTTGACGGTCGTCGGGTTGAGGTAAAATTTGCAATTGAAAGATCCCATGGATTTGGTGGTGGCGGCTTTGGTGGATCTTATGGCAATACTCCCTATGATGCTGGAGCTGGCACTGGGCATCCAGGTAGTTATGGCAACACTCCATATGGTGCTGCAAGTGGTGGGTATGACAATACTGGTGGTGGCAATGCTGCTGGAGTTTATGGCAGGGGTGAAGATGGTGGAGGTGGCAATTGGCCGAGTGGTAATTTTGGGGTAAGCAGCTTTGGTAATAACTATGGCGATGCTGGTGTCTATGCTGGCAATTCTGCTGGAGGTTATGACAACAATGGATATGGTGGAGGATCTGGCGGTGACGCGGGTCCCTATGGTAGCAATGCTGCTAGAGATTATGACAACGGCGTTGGAGGATCAGGTAGCAGTTTTGGGGACAGAAGCTCTGGCAAGAACTATGGTGATGCCGGTGCCTTCAGAGCCAATGCTGCCAGTGAATATGGTGGAGGATCAGGTGGCAGTTTTGGGGACAGCAGCTCTGTCAACAACTATGGTGCTGGTGGTGGTTATAATGGAACCGGAACGAGTTACAGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACCAGTAACCCTTACAACGATGGACCAGGTGCTGCCGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGTGGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGCTGGAGGAAGGCAGAGTTTTGCCGGTAGTCAGCACCCTGGAAGTGCCATGGCGAATGCCAGTGACGGTACAGATACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACCAGTAAAACATACAATGATGGAACAGGTGCTGCTGGATTTGGCAAGAATAATAAGTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGCAGCAGTAGGTATGATAGTGCTGCCTCTGTTGGCAGCCAGAGTTTTGCCGGTAAACAGCACCCTGGAATGGTGAATGGCAGTGATGGTACAGGTACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTATGCAACCAGTAACACTGACAAGGATGGAACAGGTGCTGCCGGATTTGGCAAGAATAATAATTATGACAGTTCTGCTGGATTTGGTAGTGGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGGTGGAAGGCAGTGTTTTGCCGGTAGTCAGCACCCTGGAATTGCCATGGCGAATGCCAGTGATGGTACAGATACTGGAAATGGCTTTGCTGGTGGAAGTTATGGGAATGCTGGTAGCTTTGCAACATGTAACAGTTACAACGATGGAACAGGTACTGCTGGATTTGGCAAGAGTAATAAGTATGACAGTTCTGCAGGATTTGGTAGCAGCAGTAGGTATGGTAGTGCTGCTGCTGTTGGCAGCCAGAGTTTTGCCAGTAGTCAGCACCCTGGAAGTGCCATGGCGAATGCCAGTAATGGTACAGGTACCGGAAATGACTTTGCTGATAGATATCATGGCAGCGGTGGCCAATTCGGTAGCAATCAAAGCAGCAATGTGGGTCAACATGGTCGAGATTTTGGAGGCTCGTTCGACGAAGATTTCAGGATCGGCAATTATGAAAATGATGCCTTTGCTGGACGGGCATGA
Predicted protein sequences of Glyma.06g203800
>Glyma.06g203800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g203800.1 locus=Glyma.06g203800 id=Glyma.06g203800.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MWCAEYNFSVYVFSQVAGMAFFGRVGNILRQATNQKIGLEIRSLSSVFQATRCMSNAPNSRLFIGGVSYSIDAQSLGEICSQYGQVVDARIIMDRETGRHRGFGFITYSNVDEASRALQALDGQDLDGRRVEVKFAIERSHGFGGGGFGGSYGNTPYDAGAGTGHPGSYGNTPYGAASGGYDNTGGGNAAGVYGRGEDGGGGNWPSGNFGVSSFGNNYGDAGVYAGNSAGGYDNNGYGGGSGGDAGPYGSNAARDYDNGVGGSGSSFGDRSSGKNYGDAGAFRANAASEYGGGSGGSFGDSSSVNNYGAGGGYNGTGTSYRNAGSFATSNPYNDGPGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAAGGRQSFAGSQHPGSAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATSKTYNDGTGAAGFGKNNKYDSSAGFGSSSRYDSAASVGSQSFAGKQHPGMVNGSDGTGTGNGFAGGSYGNAGSYATSNTDKDGTGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAGGRQCFAGSQHPGIAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATCNSYNDGTGTAGFGKSNKYDSSAGFGSSSRYGSAAAVGSQSFASSQHPGSAMANASNGTGTGNDFADRYHGSGGQFGSNQSSNVGQHGRDFGGSFDEDFRIGNYENDAFAGRA*

>Glyma.06g203800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g203800.2 locus=Glyma.06g203800 id=Glyma.06g203800.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MAFFGRVGNILRQATNQKIGLEIRSLSSVFQATRCMSNAPNSRLFIGGVSYSIDAQSLGEICSQYGQVVDARIIMDRETGRHRGFGFITYSNVDEASRALQALDGQDLDGRRVEVKFAIERSHGFGGGGFGGSYGNTPYDAGAGTGHPGSYGNTPYGAASGGYDNTGGGNAAGVYGRGEDGGGGNWPSGNFGVSSFGNNYGDAGVYAGNSAGGYDNNGYGGGSGGDAGPYGSNAARDYDNGVGGSGSSFGDRSSGKNYGDAGAFRANAASEYGGGSGGSFGDSSSVNNYGAGGGYNGTGTSYRNAGSFATSNPYNDGPGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAAGGRQSFAGSQHPGSAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATSKTYNDGTGAAGFGKNNKYDSSAGFGSSSRYDSAASVGSQSFAGKQHPGMVNGSDGTGTGNGFAGGSYGNAGSYATSNTDKDGTGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAGGRQCFAGSQHPGIAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATCNSYNDGTGTAGFGKSNKYDSSAGFGSSSRYGSAAAVGSQSFASSQHPGSAMANASNGTGTGNDFADRYHGSGGQFGSNQSSNVGQHGRDFGGSFDEDFRIGNYENDAFAGRA*

>Glyma.06g203800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g203800.4 locus=Glyma.06g203800 id=Glyma.06g203800.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MAFFGRVGNILRQATNQKIGLEIRSLSSVFQATRCMSNAPNSRLFIGGVSYSIDAQSLGEICSQYGQVVDARIIMDRETGRHRGFGFITYSNVDEASRALQALDGQDLDGRRVEVKFAIERSHGFGGGGFGGSYGNTPYDAGAGTGHPGSYGNTPYGAASGGYDNTGGGNAAGVYGRGEDGGGGNWPSGNFGVSSFGNNYGDAGVYAGNSAGGYDNNGYGGGSGGDAGPYGSNAARDYDNGVGGSGSSFGDRSSGKNYGDAGAFRANAASEYGGGSGGSFGDSSSVNNYGAGGGYNGTGTSYRNAGSFATSNPYNDGPGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAAGGRQSFAGSQHPGSAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATSKTYNDGTGAAGFGKNNKYDSSAGFGSSSRYDSAASVGSQSFAGKQHPGMVNGSDGTGTGNGFAGGSYGNAGSYATSNTDKDGTGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAGGRQCFAGSQHPGIAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATCNSYNDGTGTAGFGKSNKYDSSAGFGSSSRYGSAAAVGSQSFASSQHPGSAMANASNGTGTGNDFADRYHGSGGQFGSNQSSNVGQHGRDFGGSFDEDFRIGNYENDAFAGRA*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
USDA Logo
Iowa State University Logo