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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.06g145800

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm06
Start:11851580
stop:11855191
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.06g145800
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G64930.1AT CPR5,HYS1 JGI N/AIEA
PTHR35322PantherFam PROTEIN CPR-5 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.06g145800 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma06g15080 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.06g145800
>Glyma.06g145800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g145800.1.p locus=Glyma.06g145800 id=Glyma.06g145800.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTGAGATTCAGAATTGTTCCTCGGAACCAGAACCAACCGCAATCAACGAATGGGAGGGTCAAGCTTCGATGAAGAGCACAACGCAAAGTTCAGAAGCCTCCGATACGACGTCGTCACGAAAAGAGAATAAAGGTAAAGGTAAGGCTGCGGCGTTCAAACGACGGAACCCTAGAGTTCTTGTTCGCCGCCATAGGGCTAATAATGTGGACACTATTGGCCTTCCTCTTGGCATGTCATTCGCCGCTGTTATGGCTCAGGTGATGTATAGAAGAGATGTAGCAGCCGAGAGTATGTCTCCCAGTCATCTTTCGATGATGTGTTCATCGGCTATCAAAGAATCTCTTGCCAGTGTTTTTGGAGACAAGCTAGATGGTTTGACGAGGAACTTTGAACAATCTTTTTGTAGCACCTTGAGTACTCTTCAGTTAATTTATGAATCATCCAAGAGCAATGAAGGAAATAAATTAAATAATACAAAGATGGAAATTATGAGTTCTAAATTGACTCTCAATAAAGAGGAATGCTCAGGTGATATTGTTACAGAGGTCGGTCATTCAAGACATGCTGAAATCCAAGATCAATCAATTAGTCATGATTCTCCTGAAGAGGTCAGGGATAACTTTCATATAGATTCAATTGGTCGCGATTCTCCTGAAGAAGGCAGGGATAACATTCATAATAATTCAGTTAGTCTTGATTCTCCTGAAGAGAGCAGGGATAACTTTCATATGGGTTCAGTTAGTCGCGATCTCACTTTGTATGGGCAATCAAACCAAATGGTTTCCTTTTCTCAAATATCTTTTGGATCTGTAAATAATCCTATGGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCATCATGGAGCAGTGTCGTTCTAATGACCTCAAGACACTTGAACTTGGCCTTAAAATGAAGGAATTGAAATTGAAAGAGGATGAATTGGCTCTCAACCTTGATTCGAATAATTTAAACAGATCAAAATTAGTCATGGGAGAATCAAAGCAATCTTTCAAAGAGGAAAAGTTCAAGACCCAGTTAGAAGATACGAGGCATGGTGAACTCAAAAAGAAGTGCATTGACTGTCTTATTACTGGTTTGCTTATCATGTCATCCTCACTTTTGTATGGTGCCTATGTTTATTCCTACGAGCGGATTACTAAAGCTACTGAATCATGTACACCATCAACCCAGGAATCTTCCTCCTGGTGGACTCCCAAGTCAATGGTCTTATTCAATTCAAAGTTGCATATTTTGTGGTGTCAAGTTCAAGTTATGAGCCGAATGGCATTTGGCATCTTGATGATTTTTGCTGTTGCATATTTGCTCTTGCAGCGGTCGACCACAACATCACAGACTATGCCAGTCACTTTCATCCTTTTAATGTTGGGAATTTTTTGTGGCTATTGTGGCAAGCTATGTGTAGAGACATTGGGTGGGAGTGGTATTGTGTGGCTCTTATACTGGGAGATTATGTGCTTGCTGCATTTCTTATCTCTTTGCTGGACATCCGCTTTGTTCCGGATCCTTCATGGACCAGTCACTCCATCACAAACAATGGAGGAGAATACAATTCTTCGGTATTGGATTCGCAGAGTTCTGTTCTATGCTGCTATGCTTGTGTTTCTACCGTTGTTTTGTGGTCTCATGCCATTTGCTAGCCTAGGTCAATGGAAAGAACATTTTACATTGAAGGGGTCAGATTTTAATGGATCCGAATGGTAA

>Glyma.06g145800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g145800.2.p locus=Glyma.06g145800 id=Glyma.06g145800.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCTTAGAAAAATGTGTTCATCGGCTATCAAAGAATCTCTTGCCAGTGTTTTTGGAGACAAGCTAGATGGTTTGACGAGGAACTTTGAACAATCTTTTTGTAGCACCTTGAGTACTCTTCAGTTAATTTATGAATCATCCAAGAGCAATGAAGGAAATAAATTAAATAATACAAAGATGGAAATTATGAGTTCTAAATTGACTCTCAATAAAGAGGAATGCTCAGGTGATATTGTTACAGAGGTCGGTCATTCAAGACATGCTGAAATCCAAGATCAATCAATTAGTCATGATTCTCCTGAAGAGGTCAGGGATAACTTTCATATAGATTCAATTGGTCGCGATTCTCCTGAAGAAGGCAGGGATAACATTCATAATAATTCAGTTAGTCTTGATTCTCCTGAAGAGAGCAGGGATAACTTTCATATGGGTTCAGTTAGTCGCGATCTCACTTTGTATGGGCAATCAAACCAAATGGTTTCCTTTTCTCAAATATCTTTTGGATCTGTAAATAATCCTATGGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCATCATGGAGCAGTGTCGTTCTAATGACCTCAAGACACTTGAACTTGGCCTTAAAATGAAGGAATTGAAATTGAAAGAGGATGAATTGGCTCTCAACCTTGATTCGAATAATTTAAACAGATCAAAATTAGTCATGGGAGAATCAAAGCAATCTTTCAAAGAGGAAAAGTTCAAGACCCAGTTAGAAGATACGAGGCATGGTGAACTCAAAAAGAAGTGCATTGACTGTCTTATTACTGGTTTGCTTATCATGTCATCCTCACTTTTGTATGGTGCCTATGTTTATTCCTACGAGCGGATTACTAAAGCTACTGAATCATGTACACCATCAACCCAGGAATCTTCCTCCTGGTGGACTCCCAAGTCAATGGTCTTATTCAATTCAAAGTTGCATATTTTGTGGTGTCAAGTTCAAGTTATGAGCCGAATGGCATTTGGCATCTTGATGATTTTTGCTGTTGCATATTTGCTCTTGCAGCGGTCGACCACAACATCACAGACTATGCCAGTCACTTTCATCCTTTTAATGTTGGGAATTTTTTGTGGCTATTGTGGCAAGCTATGTGTAGAGACATTGGGTGGGAGTGGTATTGTGTGGCTCTTATACTGGGAGATTATGTGCTTGCTGCATTTCTTATCTCTTTGCTGGACATCCGCTTTGTTCCGGATCCTTCATGGACCAGTCACTCCATCACAAACAATGGAGGAGAATACAATTCTTCGGTATTGGATTCGCAGAGTTCTGTTCTATGCTGCTATGCTTGTGTTTCTACCGTTGTTTTGTGGTCTCATGCCATTTGCTAGCCTAGGTCAATGGAAAGAACATTTTACATTGAAGGGGTCAGATTTTAATGGATCCGAATGGTAA

>Glyma.06g145800.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g145800.4.p locus=Glyma.06g145800 id=Glyma.06g145800.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTGTTCATCGGCTATCAAAGAATCTCTTGCCAGTGTTTTTGGAGACAAGCTAGATGGTTTGACGAGGAACTTTGAACAATCTTTTTGTAGCACCTTGAGTACTCTTCAGTTAATTTATGAATCATCCAAGAGCAATGAAGGAAATAAATTAAATAATACAAAGATGGAAATTATGAGTTCTAAATTGACTCTCAATAAAGAGGAATGCTCAGGTGATATTGTTACAGAGGTCGGTCATTCAAGACATGCTGAAATCCAAGATCAATCAATTAGTCATGATTCTCCTGAAGAGGTCAGGGATAACTTTCATATAGATTCAATTGGTCGCGATTCTCCTGAAGAAGGCAGGGATAACATTCATAATAATTCAGTTAGTCTTGATTCTCCTGAAGAGAGCAGGGATAACTTTCATATGGGTTCAGTTAGTCGCGATCTCACTTTGTATGGGCAATCAAACCAAATGGTTTCCTTTTCTCAAATATCTTTTGGATCTGTAAATAATCCTATGGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCATCATGGAGCAGTGTCGTTCTAATGACCTCAAGACACTTGAACTTGGCCTTAAAATGAAGGAATTGAAATTGAAAGAGGATGAATTGGCTCTCAACCTTGATTCGAATAATTTAAACAGATCAAAATTAGTCATGGGAGAATCAAAGCAATCTTTCAAAGAGGAAAAGTTCAAGACCCAGTTAGAAGATACGAGGCATGGTGAACTCAAAAAGAAGTGCATTGACTGTCTTATTACTGGTTTGCTTATCATGTCATCCTCACTTTTGTATGGTGCCTATGTTTATTCCTACGAGCGGATTACTAAAGCTACTGAATCATGTACACCATCAACCCAGGAATCTTCCTCCTGGTGGACTCCCAAGTCAATGGTCTTATTCAATTCAAAGTTGCATATTTTGTGGTGTCAAGTTCAAGTTATGAGCCGAATGGCATTTGGCATCTTGATGATTTTTGCTGTTGCATATTTGCTCTTGCAGCGGTCGACCACAACATCACAGACTATGCCAGTCACTTTCATCCTTTTAATGTTGGGAATTTTTTGTGGCTATTGTGGCAAGCTATGTGTAGAGACATTGGGTGGGAGTGGTATTGTGTGGCTCTTATACTGGGAGATTATGTGCTTGCTGCATTTCTTATCTCTTTGCTGGACATCCGCTTTGTTCCGGATCCTTCATGGACCAGTCACTCCATCACAAACAATGGAGGAGAATACAATTCTTCGGTATTGGATTCGCAGAGTTCTGTTCTATGCTGCTATGCTTGTGTTTCTACCGTTGTTTTGTGGTCTCATGCCATTTGCTAGCCTAGGTCAATGGAAAGAACATTTTACATTGAAGGGGTCAGATTTTAATGGATCCGAATGGTAA
Predicted protein sequences of Glyma.06g145800
>Glyma.06g145800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g145800.1 locus=Glyma.06g145800 id=Glyma.06g145800.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MAEIQNCSSEPEPTAINEWEGQASMKSTTQSSEASDTTSSRKENKGKGKAAAFKRRNPRVLVRRHRANNVDTIGLPLGMSFAAVMAQVMYRRDVAAESMSPSHLSMMCSSAIKESLASVFGDKLDGLTRNFEQSFCSTLSTLQLIYESSKSNEGNKLNNTKMEIMSSKLTLNKEECSGDIVTEVGHSRHAEIQDQSISHDSPEEVRDNFHIDSIGRDSPEEGRDNIHNNSVSLDSPEESRDNFHMGSVSRDLTLYGQSNQMVSFSQISFGSVNNPMVSIFEKSIMEQCRSNDLKTLELGLKMKELKLKEDELALNLDSNNLNRSKLVMGESKQSFKEEKFKTQLEDTRHGELKKKCIDCLITGLLIMSSSLLYGAYVYSYERITKATESCTPSTQESSSWWTPKSMVLFNSKLHILWCQVQVMSRMAFGILMIFAVAYLLLQRSTTTSQTMPVTFILLMLGIFCGYCGKLCVETLGGSGIVWLLYWEIMCLLHFLSLCWTSALFRILHGPVTPSQTMEENTILRYWIRRVLFYAAMLVFLPLFCGLMPFASLGQWKEHFTLKGSDFNGSEW*

>Glyma.06g145800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g145800.2 locus=Glyma.06g145800 id=Glyma.06g145800.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MLRKMCSSAIKESLASVFGDKLDGLTRNFEQSFCSTLSTLQLIYESSKSNEGNKLNNTKMEIMSSKLTLNKEECSGDIVTEVGHSRHAEIQDQSISHDSPEEVRDNFHIDSIGRDSPEEGRDNIHNNSVSLDSPEESRDNFHMGSVSRDLTLYGQSNQMVSFSQISFGSVNNPMVSIFEKSIMEQCRSNDLKTLELGLKMKELKLKEDELALNLDSNNLNRSKLVMGESKQSFKEEKFKTQLEDTRHGELKKKCIDCLITGLLIMSSSLLYGAYVYSYERITKATESCTPSTQESSSWWTPKSMVLFNSKLHILWCQVQVMSRMAFGILMIFAVAYLLLQRSTTTSQTMPVTFILLMLGIFCGYCGKLCVETLGGSGIVWLLYWEIMCLLHFLSLCWTSALFRILHGPVTPSQTMEENTILRYWIRRVLFYAAMLVFLPLFCGLMPFASLGQWKEHFTLKGSDFNGSEW*

>Glyma.06g145800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g145800.4 locus=Glyma.06g145800 id=Glyma.06g145800.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MCSSAIKESLASVFGDKLDGLTRNFEQSFCSTLSTLQLIYESSKSNEGNKLNNTKMEIMSSKLTLNKEECSGDIVTEVGHSRHAEIQDQSISHDSPEEVRDNFHIDSIGRDSPEEGRDNIHNNSVSLDSPEESRDNFHMGSVSRDLTLYGQSNQMVSFSQISFGSVNNPMVSIFEKSIMEQCRSNDLKTLELGLKMKELKLKEDELALNLDSNNLNRSKLVMGESKQSFKEEKFKTQLEDTRHGELKKKCIDCLITGLLIMSSSLLYGAYVYSYERITKATESCTPSTQESSSWWTPKSMVLFNSKLHILWCQVQVMSRMAFGILMIFAVAYLLLQRSTTTSQTMPVTFILLMLGIFCGYCGKLCVETLGGSGIVWLLYWEIMCLLHFLSLCWTSALFRILHGPVTPSQTMEENTILRYWIRRVLFYAAMLVFLPLFCGLMPFASLGQWKEHFTLKGSDFNGSEW*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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