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Report for Sequence Feature Glyma.06g098300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm06
Start:7796762
stop:7832753
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.06g098300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G58250.1AT Golgi-body localisation protein domain ;RNA pol II promoter Fmp27 protein domain JGI N/AIEA
KOG1910 KOG Uncharacterized conserved protein JGI N/AIEA
PTHR15678Panther ANTIGEN MLAA-22-RELATED JGI N/AIEA
PTHR15678:SF6Panther UPF0378 PROTEIN KIAA0100 JGI N/AIEA
PF10347PFAM RNA pol II promoter Fmp27 protein domain JGI N/AIEA
PF10351PFAM Golgi-body localisation protein domain JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.06g098300
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.06g098300 not represented in the dataset
Glyma.06g098300 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from PhyloGenes.


Paralogs of Glyma.06g098300
ParalogEvidenceComments
Glyma.04g096600 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.

Gene model name correspondences to Glyma.06g098300 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma06g10320 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.06g098300
>Glyma.06g098300.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.06g098300 ID=Glyma.06g098300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
GCGAGCGAGTAACCGCCATGTATCGTTGAAAAAATCTCCCTTTGGTTTTACTACGGAGCCACGTAATAGGCTCGCTGTTATAAATTGTTGCGCAAACAGTGACTCTGGGCGCACGTTTCCCCACGCAAGCCTCTCCTGCACCCGCGTTGCACCCGATGACATCCCCCACTTTCTCTCACTAACCCAACCCGCCTTGGATCACCGAGCGAGCATCTCACGCGGATCGGATCTGAGCAATCAACTATAAATACACCACTTCCGATCACGACGCTTTCAACCACCAAACCcttcttctttttcttcttcAAGTACATTCATCGCTACCTTTTTTCCTTTTTCTAGGGTTCTTCCTTTTTCTCCGTGATTCTTGTCGCATTCTCTGCGATGGAGTCTCGCGACAGAACCGTGTTCGTGTTCCTGCTCGCGGAATTTCGAGACTTCGATTGAAAATTCTGCCGTTTTCCGCGAACGAGTGGCTTTCCCCTCTCGGATATGGCGGCTTCTCCTGTCAACTTCCTCTTCGGATTCTTGCTGCTCTCGATTACATTGTGGCTCGTGTTCATTTTTGCTTCTGGGTTGCTGGCTTGGATTCTGAGCCGGATTTTGGGAGCATCTGTTGGATTTCGTGTTGGTGGATGGAAATGTTTACGGGATGTGGTGGTGAAGTTTAAAAAGGGTGCCATTGAATCTGTTTCTGTTGGTGAAATTAAACTCAGCTTACGACAGTCCCTGGTTAAACTTGGTGTGGGTTTCATATCTCGGGATCCCAAGCTACAAGTGTTAATATGCGACCTAGAAGTTGTTATGAGGCCTTCAAATAAAAGCCCAGGGAAGAAGAAAACTAGGAAATCTCGTGCTTCAGGCAGGGGAAAGTGGATGATTGTGGGCAATATTGCAAGATATTTGTCAGTTTGTGTGACTGATCTGGTTCTGAAGACACCAAAATTTACTGTTGAGATCAAGGAATTGAATGTGGATATATCTAAAGATGGAGGATCCAAGTCAAATTTATTAGTTGGACTGCAAATATTGCCTATTTTTGTTCACATTGGTGAACCTCGAGTTAGCTGTGACTTTTTATCCAATTTAAGTGGTGGAGGATGCAGTTCTTCTGGCCAGGCATCCATTACTGCTTTAGAAAGGGAAGTGGGTATAGTTATTAAGAATATGGACATTTCCAGTGGAGAGATGACTGTGAATTTGAACGAGGAGTTGCTTTTGAAGAGCAAGAGTCCATCAAAGTCTTCTCCTGGTTCTGACAGTAAAGCAGGGTCACATGCTGATTCTGCAAGCACAAAAATGCCATCAAAGAAGCAGCAAACGCTTGCAGCTTTCTCCAAGTTCAGCTCTATGTTTCCTGAAAAGGTCAGCTTCAATCTACCAAAGCTGGATGTGAGTTTTGTGCATCGTGAGCATGGTCTTTCTGTTGAAAACAACATCATGGGCATCCAATTGAAAAGCACCAAATCACGATCCACTGAGGATCTTGGGGAGAGTACACGCCTTGATTTCCAACTGGAGTTTAGTGAAATTCATCTTCTTAGAGAAGCTGGTTCTTCCATTTTGGAGATATTGAAGTTGGATTTGATCTCTTTTGTATATATCCCGATACAGCCAATATCACCTGTTAGAGCTGAAACCGAAGTCAAGCTAGGAGGTACTCAGTGCAACATCATAATGAGCAGGTTAAAGCCTTGGTTGTTCCTCCACTCGTCTAAGAAGAAAAAAATGGTACTTCAAGAAGAAGCTTCTGTTGTTGCAAGACCTCAATCAACCGATGGCAAGACTGTCATGTGGACATGCAATGTCTCAGCTCCTGAGATGACAATAGTGCTTTTCAATATGGCTGGTTCTCCAGTGTATCATGGTTGCTCACAATCATCACATCTGTTTGCAAACAACATTTCAAATATGGGGACTACAGTACACACTGAACTTGGAGAGTTAAATCTCCACTTGGCTGATGAATATCAAGAATGCTTGAAAGAAAGTGTTTTTGGTGTGGAATCAAATTGTGGCTCCATTATGCACATTGCAAAGGTTAATTTGGATTGGGGAAAAAAGGATGTGGAATTATCTGAAGAAGATGGTCCTAGGTGTAGACTAGGTTTATCAATTGATGTTACTGGCATGGGTGTATATATAACTTTCAAGCTTGTAGAATCACTTGTATCAACAGCCATATCTTTTCAAGCTCTATTGAAAAGCCTATCTGCTTCAAAGAAAAAATCGACTCATAGTCAGGGGCGTTTAACAAAATCTTCTGGGAAAGGGACTCATTTTTTGAAATTCAATCTTGAAAGGTGTTCAGTACATGTATGGGGTGAGACAGGTTTGGAAAATACAATTGTTCCAGACCCCAAGCGAGTTAATTACGGCTCACAGGGGGGTAGAGTTATGCTAAATGTGTCAGCAGATGGTACCCCACGCAATGCAAATATAATGTCCACTATTTCCGATGAATACCAGAAGCTGAAGTACTCTGTCTCTCTTGAAATATTTCAATTTAGTTTGTGTGTGAACAAAGAGAAACAGTCCACACAGATGGAACTTGAAAGAGCCAGATCTGTCTATCAGGAATATATGGAGGAAAATAGGCCAGTAACAAATGTAGCATTGTTTGATATGCAAAATGCTAAATTTGTACAGCGTTCAGGTGGGCTTAAAGACATTGCTGTCTGTTCTCTTTTCAGTGCTACTGACATTACTGTAAGGTGGGAGCCTGATGTACATCTATCACTAGTTGAACTTGTTCTCCAGCTGAAGTTACTTGTACACAACAGCAAGCTTCAGGAGCATGGTAATGAACACATGGTAGATGTGTCTCATGTGCAAGATGCTAATTGGAAAAAAGAAGTTACCATTGAATCAGGGCACCTTGAAAAGCCGAAGAAGAAAGAATCTATTTTTGCCGTTGATGTAGAAATGTTAAGTATTTCGGCTGGGCTAGGTGATGGAGTTGATGCTATGGTTCAGGTTCAGTCAATTTTCTCTGAGAATGCTCGGATAGGAGTGCTCCTTGAAGGACTTATGCTTAGTTTTAATGGAGCTAGAATCTTCAAGAGTAGTCGGATGCAAATTTCACGAATTCCTAGTGTTTCTGCAAGTACATCTGATACAAAAGGACATGCAGTTACAACATGGGATTGGGTTGTCCAAGGTCTTGATTTTCACATTTGCATGCCATACAGATTGCAATTGCGCGCCATTGATGATGTCATTGAGGATATGTTGCGAGGTTTGAAGCTCATAATTGCTGCCAAGACAAGTTTGATTTTTCCTGTGAAGAAAGAGAGCTCTAAAGTTAAGAAACCTAGTACAGTACAATTTGGATGCATAAAATTTTGCATACGCAAGCTAACTGCTGATATTGAAGAGGAACCAATCCAGGGATGGCTTGATGAACATTATCAGCTGCTGAAGAAGGAGGCTGCTGAGTTAGCTGCACGGTTGAACTTTCTAGATGAATTTATATCGAAGGCGAAGCAAGGTTCCAAATCAACTGACACTGTTAGTTCTTCTCAAGAAAGAAAATTTTCTTTTAATAATGTTGAGGTTGATGTAAAAGATTCTTCTACTATTGAATCCATGAGAGAAGATATTTATAAACGATCATTTCGATCATATTACCAGGCATGCCAGAATCTAGTGTTGTCTGAAGGGTCTGGTGCTTGTGTAGAAGATTTTCAAGCTGGTTTCAGACCTAGTACTTCAAGGACATCTCTTCTTTCAATATCTGCATTAGATTTAGATGTAAGCTTGAAAAAAATTGATGGCGGAGATTTTGGGATGATTGAGGTTCTGAAGAAGCTTGATCCTGTCTGTCTTGAAAATGATATACCATTTTCCCGACTGTATGGGTCAAATATTCTCTTAAATACAGGTTCTCTTGTAGTCCAGCTTCGGGATTACTCATTTCCTCTTTTCTCTGGAAGTTCTGGTAAATGTGAAGGCTGTCTTGTATTGGCTCAGCAGGCAACCTGCTTTCAGCCTCAAATGTATCAAGATGTCTATGTTGGGAGATGGAGAAAGGTTCGCATGCTTCGATCAGCTAGTGGTACTACTCCACCATTGAAGACATACTCGGATTTGCCGATACATTTTCAGAAAGGCGAGGTGTCATATGGAGTGGGTTATGAACCCGCTTTTGCTGATATTAGTTATGCTTTCACTGTAGCACTTCGGAGGGCTAATCTAAGTGTTAGGAATCCTGGTCCACTTATTCTGCCTCCAAAAAAGGAGCGGAGTTTGCCATGGTGGGATGACATGAGAAATTACATCCATGGAAAAATTTCCTTACTCTTTTCTGAATCAAAATGGAATGTTTTAGCAAGTACAGATCCTTATGAAAAGGTTGACAAACTTCAAATTGTGACCAACTCTATGGATCTTCACCAGTCTGATGGTCGTGTTTTAGTTTCCGCCAAAGATTTTAAGATTTTGTTGAGTAGTTTGGAGAGTTTGGCAAACAGACACGGTTTTAAAATTCCAACAGGTGTATCAGGTGCATTCCTGGAAGCTCCTGTCTTCACTCTTGAAGTTACAATGGACTGGGATTGTGAATCTGGAGATCCTATGAATCATTATTTATTTGCACTTCCAGTTGAGGGCAAACCACGTGATAAAGTATTTGATCCCTTCAGATCCACATCACTTTCCCTTTGGTGGAATTTCTCTCTTAGACCCTTTCCTCCTCCATCACAAAAGCAGTCCTCGTCTTCCATTACTAGAAGAGATATTGAAGGAGATGCTACTGCATTTGATCCTTCTCACATATCCCATAATGTTTCACCCGTGTCCCCAACATTTAACTTTGGAGCTCATGATCTAGCATGGATTCTGAAATTCTGGAGCTTGAACTACATTCCTCCGCATAAGCTGCGCAGCTTCTCTCGTTGGCCACGTTTTGGTATTCCAAGAGTTGCCAGGTCAGGCAATCTTTCACTGGATAAAGTGATGACTGAATTTATGCTCCGCCTTGATGCCACACCGGCTTGTATAAAGAATATGCCTCTAGATGACGATGATCCAGCCAGAGGACTGACCTTCGCAATGACAAAACTTAAATATGAACTGTGTTACAGTAGGGGCAAGCAAAAGTATACTTTTGAAAGTAAGCGTGACATTCTTGATCTTGTTTACCAAGGTCTTGATCTTCATATGATCAAGGCTTTCCTAAATAAAAAAGAATGTGCTAGTGTTGCCAAAGTAGTTAACATGATACTGAAAAGTTCACAATCTCTATCCATGGACAAAGTCTCCTGCAAAAAGGGTTACATGACCGAGAAAAATTGTGATGATGGATTTCTGTTATCCTCTGATTATTTCACCATCAGAAGACAATCTCCAAAGGCTGATCCTGCTAGGTTACTAGCATGGCAAGAAGCAGGAAGAAGAACTATTGAGATGGCATATGTACGGTCTGAGTATGATAATGGGAGTGAAACTGATGACCATATGCGGTCTGACCCAAGTGATGACGAAGGTTACAATGTGGTAGTAGCAGATGATTGTCAGAGTGTGTTTGTCTATGGTCTCAAGCTTTTGTGGACTATTGGAAACAGAGATGCTGTTTGGGCTTGGGTTGGTGGCCTGTCCAAAGCCTTTGAACCTCCCAAGCCTTCTCCTTCTCAACAGTATGCACAGAGAAAATTACTTGAGGAAAAAAAACTCCGTGATGGAGCTGATTTCCATCAAGACGATGTTTCTAAGTGCCCTCCCACTGGTAAAATTTCCAAGTCTCCTTCTCTTCAACAGTTAAGTACTCCTGGATCAGTCTCATCTTCACCAAATTCAGTTAAAGTGGACAACTTGCCATCTGTCAAAAAAGAAAACATGGATGGTTCTGGTGGGACTCGACGTTTGATGGTGAATGTTATTGAGCCACAGTTTAATCTTCACTCTGAGGATGCAAATGGTAGATTTTTGCTTGCTGCTGTAAGTGGCCGAGTTTTAGCCCGGTCATTTCATTCAATCCTTCATGTTGGTTATGAGATGATTGAGCAAGTACTTGCTACTAAAGATGTACAAATTAACGAATACCAACCTGAAATGACATGGAAAAGAATGGAATTCTCTGTTATGTTGGAGGATGTGCAGGCTCATGTTGCACCAACAGATGTTGATCCAGGAGCTGGATTGCAGTGGCTTCCAAAAATTCTCAAAAGCTCTCCAAAAATATTGCGTACAGGTGCTCTTCTTGAAAGAGTTTTTATGCCTTGTGATATGTACTTTCGGTATACAAGGCACAAAGGGGGCACTCCAGAACTGAAGGTGAAGCCCTTGAAGGAGCTCAAATTCAATTGTGATGATATAACGGCAACAATGACATCACGCCAGTTTCAGGTCATGCTGGATGTATTGACCAATCTTTTATTTGCACGCCTGCCAAAGCCTCGAAAAAGTAGCTTATCCTTTCCTGTTgaagatgatgaagatgttgaagaggaagcagatgaagTGGTACCTGATGGTGTCGAAGAGGTGGAACTTGCAAAAATCAACCTTGAAAAAAGAGAGAGGGAACAAAGGTTGCTTCTTGATGATATTCGAAAATTGTCTCTTTGGTGTGACCCTTCTATGGATCCACATCAAGAAAAGGAAAGTGACTTATGGATGATATCTGGTGGGAGATCTTTGTTGGTCCAGGGACTGAAGAGAGAGCTTGTAATTGCTCAAATATCTAGAAAGGCAGCATCTGCGTCATTAAGGACGGCTCTTCAAAAAGCTGCGCAACTACGGCTAACAGAAAAGGAGAAGAACAAAAGTCCTTCCTATGCTATGCGCATATCTTTGCAAATTAACAGAGTTGCTTGGAGTATGCTTGTTGATGGTAAATCCTTTGCTGAAGCTGAGATTAATGACATGATATATGACTTTGACCGGGATTACAAGGATGTCGGCATTGCTCGGTTTACAACAAAATATTTTGTTGTCAGAAACTGCCTGCCTAATGTCAAGTCAGATATGCTTTTGTCAGCATGGAATCCTCCATCCGAATGGGGAAAAAAAGTGATGCTTCGAGTGGATGCACGACAAGGAGCTCCAAAGGATGGGAATTCTCCCCTTGAACTTTTTGAGATAGAGATTTATCCCCTTAAGATCCATTTAACAGAGACGATGTACAGAATGATGTGGGAATATTTCTTCCCAGAAGAAGAACAAGATTCCCAACGTCGTCAGGAGGTTTGGAAGGTTTCAACCACTGCTGGTGCAAGGCGTGTAAAGAAAGGTTCATCAGTTCTTGAAGCTTCTGCTTCAAACAGTCACACAACAAAAGAGTCTGAGGCTTCATCCAAATCTGGCATATCTGCAATGCTATTTCCCACATCAAGTCAGCCTCCAGCCCATGTTGACTCAGCTCAAGCATCCAAAACACAAAATGTCAAAGCAAACCCTGGCAATGGTGCAACCCCCGAGTTGAGAAGGACATCATCTTTTGACAGAACTTGGGAAGAGACTGTGGCAGAATCTGTAGCTAATGAACTTGTGCTACAAAGCTTTTCTTCCTCAAAAAATGGCCAATTTGGTTCTACTGAGCAACAAGATGAAGCTGCTAAGAATAAATCAAAAGATTCAAAAGGTGTGAAAGGTGGTCGCTCATCTCATGAAGAAAAAAAGGTGGCTAAATCACATGAAGAGAAGAGATCTAGGCCACGGAAGATGATGGAGTTTCACAACATCAAAATTAGTCAGGTTGAGTTATTGGTTACATATGAAGGGCAGAGATTTGTTGTAAATGATCTCAAATTACTGATGGATCAATTTCATCGAACCGAGTTTACTGGAACTTGGCGAAGACTCTTCTCGCGAGTTAAGAAGCACATCATCTGGGGAGTCCTAAAGTCTGTAACTGGAATGCAGGGTCGGAAATTTAATAGACCCACTGGTGCTGGTGTTCCTGAAATTGATCTTATTTTAAGTGACAATGAAGGCCAGGCAGGAAAATCTGATCAATATCCACCATCTTGGCCTAAGCGTCCAAGTGATGGTGCAGGTGATGGATTTGTAACATCCATTAGAGGACTGTTCAGTACTCAACGCCGCAAGGCAAAGGCATTTGTGCTCCGAACTATGAGGGGAGAAGCAGAGAATGATTTTCAAGGTGATTGGAGTGAAAGTGATATGGATTTCTCTCCTTTTGCTCGGCAGCTCACGATTACAAGAGCTAAAAAGCTTATTAGGAGGCACACTAAGAAGTTCCGTTCCAGAGGACAGAAAGGTTCTACTTCACAACAGAGAGAATCGCTACCATCATCACCACGAGAGACAACTCCATTTGACAGTGATTATTCAAGTGGATCCTCACCATATGAAGATTTTCATGAATAGAAATATTAATCATCTAAAGGATTTCTTACTTTTCAGCTGAGCATGATGCATATCTCATCTAGTTCTTAAATACTCTAAAGGAAGGGGCTCGGTTGAAAGCTATATACATCTTGAACAGAGGGGCACTTGGAATGGAAAGAGAACTTGGGACTATGCATGCATGCTTGCATGGTTGATGTTGATTGCTATTCATTGTGTATTTTCTGTTGCAACCTAAGTCATCGGTGAAAAAGAGCCTTGCTTGCTTTCATCTCACATCTAACATCTTCTACGCAACATCGATCGGACATCTAACATTTGTATTCCTTGACAACTTCAGTCATCGATGAAGAGCCTTGCGTTCATCTCATACGTGTGTTTTCGGGTTGTATATTCCTGTAGCTTCTGGTCAATGTTCAATTTTTGGCTTCTTAATTTAATTAGAAAATAGTAGAAAATAGGAGCCTAGAGGTTGACATGATTATGTATATACATTTGATTATATTTTGGAAAATAGAATAAAAGCAATATCTTCTTTCGCACAGAGAGATTATTCTAAACCATTTTCAAAGGAATAATGCCCGTGTAGAAAGTACTGAGCAGCAGGATATTTATTTTAGTACATTTTTTGTGTGTG

>Glyma.06g098300.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.06g098300 ID=Glyma.06g098300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.06g098300
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>Glyma.06g098300.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g098300.2 locus=Glyma.06g098300 ID=Glyma.06g098300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.06g098300.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g098300.3 locus=Glyma.06g098300 ID=Glyma.06g098300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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