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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.06g034800

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm06
Start:2696466
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Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.06g034800
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G18230.1AT JGI N/AIEA
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GO:0016021GO-cc integral component of membrane EnsemblGenomesN/AIEA
KOG3339 KOG Predicted glycosyltransferase JGI N/AIEA
PTHR12154Panther GLYCOSYL TRANSFERASE-RELATED JGI N/AIEA
PF08660PFAM Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.06g034800
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.06g034800 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma06g03790 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.06g034800
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>Glyma.06g034800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.06g034800 ID=Glyma.06g034800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.06g034800
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>Glyma.06g034800.17 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g034800.17.p locus=Glyma.06g034800 ID=Glyma.06g034800.17.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.06g034800
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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