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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.06g013100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm06
Start:962216
stop:969392
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.06g013100
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G34450.1AT JGI N/AIEA
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GO:0016192GO-bp vesicle-mediated transport JGI N/AIEA
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K17267KEGG Exosome JGI N/AIEA
PTHR10261PantherFam COATOMER SUBUNIT GAMMA JGI N/AIEA
PTHR10261:SF5PantherFam COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 JGI N/AIEA
PF01602Pfam Adaptin N terminal region JGI N/AIEA
PF08752Pfam Coatomer gamma subunit appendage platform subdomain JGI N/AIEA
PF16381Pfam Coatomer subunit gamma-1 C-terminal appendage platform JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.06g013100 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma06g01520 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.06g013100
>Glyma.06g013100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g013100.1.p locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g013100.2.p locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g013100.3.p locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTCAGCCGCTTGTGAAGAAAGACGATGACCGCGACGACGAAGCTGAGTATTCCCCCTTTCTGGGACTTGAAAAGGGGTCTGTTCTTCAGGAGGCCAGGGTTTTTAATGACCCTCAACTAGATGCTAGGAGATGTTCACAGGTTATTACAAAACTCCTATACCTACTTAATCAGGGAGAGACGTTTACAAAGGTTGAAGCCACAGAAGTTTTCTTTGCTGTGACTAAGCTTTTCCAGTCTAAAGATATGGGATTAAGGAGAATGGTCTACCTGATGATAAAGGAGATCTCTCCCTCTGCTGACGAGGTTATCATCGTCACAAGCTCTCTCATGAAGGACATGAACAGCAAGATTGATATGTACCGAGCAAATGCCATTCGAGTGCTGTGTCGTATCACTGACGGAACCCTCCTTTCACAAATTGAGAGGTATTTAAAACAAGCCATTGTAGATAAAAATCCAGTTGTTGCAAGTGCTGCTCTAGTTAGTGGCATTCATCTACTCCAGACGAATCCTGAAATTGTAAAAAGATGGAGCAATGAAGTTCAGGAAGCTGTTCAATCAAGAGCAGCCCTTGTACAATTTCATGCACTGGGTTTGCTACATCAGATACGACAGAACGATCGGCTAGCAGTTAGCAAGCTGGTTACCAGCTTGACAAGGGGAACTGTTCGCTCACCTTTAGCACAGTGCCTTTTGATCCGTTACACAAGTCAGGTTATTCATGAATCAGGCAATACACAGTCAGGGGAACGCCCCTTCTATGATTATCTTGAGAGTTGCCTTCGCCACAAGTCAGACATGGTGATTTTTGAAGCTGCCAGGGCAATAACAGAGCTCAATGGCGTAACAAGCCGAGAATTAACTCCAGCAATTACTGTTCTTCAGCTTTTCTTAAGTTCGACTAAGCCAGTCTTGAGATTTGCTGCTGTCCGCACCTTGAACAAGGTGGCAATGACGCATCCAATGGCAGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAAAGTTTAATCTCTGACCAGAACAGAAGCATTGCTACCCTTGCTATTACTACACTTTTGAAAACAGGAAATGAATCTAGTGTGGATCGTCTTATGAAGCAGATCACAAATTTCATGTCTGATATTGCTGATGAGTTCAAAATTGTTGTTGTTGAAGCAATAAGATCATTGTGCCTGAAGTTTCCTTTAAAATATCGATCTCTGATGAACTTCCTGAGTAATATTCTTAGGGAAGAAGGGGGTTTTGATTACAAGAAGGCAATTGTAGATTCAATTGTGATTCTCATTAGAGATATCCCTGATGCAAAGGAAGTGGGGTTGCTTCATCTTTGTGAGTTCATTGAAGATTGTGAGTTCACTTATTTGTCCACGCAGATACTTCACTTCCTGGGAATCGAAGGACCAAAAACATCAGACCCGAGCAAATATATTCGTTACATTTATAATAGAGTACATCTTGAGAATGCAATTGTTAGGGCCAGTGCTGTGAGCACACTGGCAAAATTTGGTGCTGCTGTTGATGTGTTAAAGCCCCGCATATTTGTTCTGCTAAGGCGATGTCTTTTTGACAGTGATGATGAGGTCCGTGATAGGGCTACACTTTACCTGGACACACTTGGAGGTGATGGTTCAGTTGTTGAGACTGATAAAGATGTAAAGGACTTCCTGTTTGGGCCATTTGATATCCCACTTGTCAATCTGGAGACTAGTTTGAAAAACTATGAACCTTCAGAAGAAGGTTTTGACATTAACTCTGTGCCCAAGGAGGTCAAGTCCCAGCCACTTGCAGAAAAGAAAGCCCCTGGTAAAAAGCCAACTGGTTTGGGTGCTCCCCCATCAACTGCAGATGCATATGAGAGGATGCTTTCGACCATTTCAGAGTGTGCAAACTTTGGGAAGCTTTTCAAGTCCTCAGCACCCGTGGAGCTCACTGAAGCTGAGACAGAATATGCTGTTAATGTCATTAAACACATTTTTGATAGGCATGTTGTGTTCCAGTACAACTGCACAAACACGATACCAGAGCAATTGTTGGAACATGTTATTGTGACTGTGGATGCTTCAGATGCTGATGAATTCTCAGAGGTGTTCTCCAAGCCTCTCAGGTCTCTTCCTTATGATTCACCTGGACAGACTTTTGTGGCATTTGAGAAGCCAGAGGGAGTGCCAACAGTTGGAAAATTTTCTAACATTCTGAAATTTATTGTCAAAGAGGTTGACCCAACCACTGGTGAGGCTGAAGATGATGGTGTCGAAGATGAATACCAGCTGGAGGATCTGGAGATTGTTGCAGCAGATTACGTGTTGAAAGTGGGGGTGTCTAATTTTAGGAATGCATGGGAAAGCTTAGGCCCTGATTTTGAGCGAGTGGATGAGTATGGTCTTGGTCCTAGAGAGAGCTTGGCTGAAGCTGTAAACACTGTTATCAACCTACTTGGCTTGGAGCCTTGTGAGGTAAGCTGA

>Glyma.06g013100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g013100.4.p locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.06g013100.5.p locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.06g013100
>Glyma.06g013100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g013100.1 locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g013100.2 locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g013100.3 locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g013100.4 locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.06g013100.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.06g013100.5 locus=Glyma.06g013100 id=Glyma.06g013100.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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