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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT4G34840.1 | AT | Phosphorylase superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
AT4G38800.1 | AT | methylthioadenosine nucleosidase 1 | JGI | N/A | IEA |
GO:0009116 | GO-bp | nucleoside metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0009116 | GO-bp | nucleoside metabolic process | JGI | N/A | IEA |
GO:0003824 | GO-mf | catalytic activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0003824 | GO-mf | catalytic activity | JGI | N/A | IEA |
PTHR21234 | Panther | PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE | JGI | N/A | IEA |
PTHR21234:SF5 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF01048 | PFAM | Phosphorylase superfamily | JGI | N/A | IEA |
PWY-6754 | SoyCyc9 | S-methyl-5'-thioadenosine degradation I | Plant Metabolic Network | ISS | |
PWY-7270 | SoyCyc9 | L-methionine salvage cycle II (plants) | Plant Metabolic Network | ISS | |
PWY-7528 | SoyCyc9 | L-methionine salvage cycle I (bacteria and plants) | Plant Metabolic Network | ISS | |
GN7V-60220 | SoyCyc9-rxn | methylthioadenosine nucleosidase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.06g005700 not represented in the dataset |
Glyma.06g005700 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.04g006000 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma06g00800 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.06g005700.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.06g005700 ID=Glyma.06g005700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||