SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research



Report for Sequence Feature Glyma.05g196700

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:38099083
stop:38107078
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G34320.1AT JGI N/AIEA
PTHR31730PantherFam OS01G0873900 PROTEIN JGI N/AIEA
PTHR31730:SF2PantherFam PROTEIN PSK SIMULATOR 3 JGI N/AIEA
PF05003Pfam Protein of unknown function (DUF668) JGI N/AIEA
PF11961Pfam Domain of unknown function (DUF3475) JGI N/AIEA

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g33040 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.05g196700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g196700.1.p locus=Glyma.05g196700 id=Glyma.05g196700.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGGGGGTCTTTGTTCAAAGTCTGCCAAAGGTGACAAGGTGTTTGCCAAATCAGATGGACATTCTGATAAACATAAATCTGATGGTAAGAACCACAAGTCCACCAGCATGCCTAGTAATTTGACTAGTGCAGGGGAACATGGAGTGGACAAGAAAAAACAAGAAGGTTCTGCTGCTGCTGCAGGGAATGGTTCTGATGATTTCTATGATGGAATCCCACGGTTTACTGATTCTTTTTCCCACAAGTCTAGGTCAGTAAAATCAAGGCATGCTGTGGCGAAGGTCTCAGAGGTGAGTTTACGCCTGGGCAGAGCTGGTATTGACGTTTTGGACACTCTTGGAAGCAGTATGACAAATTTAAGTGCTGGTGGGTTTGTATCTGGAGCTGTGACAAAGGGGAATGAAATTGGTATTTTAGCATTTGAGGTTGCAAACACTATTGTCAAGGGTTTTAGTCTTATGGAATCTCTTTCGACAAAAAGTATTAAGCATTTAAAAGAAGAGGTGCTTCCATTAGAGGCTGTGCAAGATTTAGTATCAAAGGATATGGATGAGCTTCTAAGGATTGTTGCTGCAGACAAAAGGGATGAGTTGAAAGTCTTTTCTGATGAGGTAATTCGTTTTGGAAATCGTTCAAAGGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGATACTTTGAGAAAGTTAGCAGAGAACTTAATTCTCAAAGACAACCAAAGGAGGAGGCAGAATTACTAATGCAACAATTGATGACGTTGGTTCAGTTAACAGCTGAATTATACCATGAGTTACATGCTTTGGATAGATTTGCACAAGATTATCAGCATAAGCGTGAAGAGGATGATAATTCAGGTGCAGCTCAAAGTGGTGATGGCCTTTCAATCTTGAGGGCAGAACTTAAAAGTCAAAAAAAGCAAGTTAAACATTTGAAAAAAAAGTCACTCTGGTCCAGAAGTTTGGAGGAGATTATGGAGAAGCTTGTAGAGATAGTCCATTTTTTGCATTTGGAGATAAACAATGCCTTTGGCACTGAAGATGACCATAAACCATTAATTCAAACCATCAGCAGTCGCCAAAAATTGGGTCCTGCAGGCCTTGCTTTGCATTATGCTAATATAGTGCTCCAAATTGATACTCTTGTTGCCAGATCCAGTTCTATGCCTGCAAATACAAGGGATGCATTGTATCAGAGCTTGCCTCCTAATATAAAATCAGCTTTGCGTTCCAAATTACCAAGCTTTCATGTCGTAAAGCAGCTCACCATATCAAATATTAAAGAAGAGATGGAGAAAACATTGCATTGGCTGGTTCTGATTGCTACAAACACGGCCAAAGCACATCATGGTTTTGGTTGGGTAGGGGAGTGGGCAAGCACTGGTTCTGAGCTAAATAAGAAGACCATGAAGGCTGATGTGATGCGGATTGAAACGCTTCACCATGCCGATAAAGCTAAAGTAGAAAATTATATTCTTGAACTTCTCATATGGCTTCACCGCTTGGCCATCAAAAGTAAAGATGGCATTGATACCGGAGAAACGAGGTCTACCTTAAAGTCTCATGTTGGCACTGCCATTCAAACTACAAGTCAACAATCAACAAAAGCCTTACTGCCATTGTTAACAACTGACGAGCAGAAAATGCTGCAAGATGTTAGTAATAAAATTCACATAAGAAGGATCAGTAAAAGCTTGGACTTTGACAGTTTGAAGACAGATAATGACAGACTTACTAAGAGTAGCAGTTATTCTTATTCATCAACAAGTAGAAGCAAGGAATTATCTTTTAATAGAATTTTGTCTAAGCTTCCTGTTATTGATTTTGGTATTGACAAAAAAAGAGCATTGGATGTGATTGACAGATTAGATGTGGCCAGATAA

>Glyma.05g196700.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g196700.5.p locus=Glyma.05g196700 id=Glyma.05g196700.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGGGGGTCTTTGTTCAAAGTCTGCCAAAGGTGACAAGGTGTTTGCCAAATCAGATGGACATTCTGATAAACATAAATCTGATGGTAAGAACCACAAGTCCACCAGCATGCCTAGTAATTTGACTAGTGCAGGGGAACATGGAGTGGACAAGAAAAAACAAGAAGGTTCTGCTGCTGCTGCAGGGAATGGTTCTGATGATTTCTATGATGGAATCCCACGGTTTACTGATTCTTTTTCCCACAAGTCTAGGTCAGTAAAATCAAGGCATGCTGTGGCGAAGGTCTCAGAGGTGAGTTTACGCCTGGGCAGAGCTGGTATTGACGTTTTGGACACTCTTGGAAGCAGTATGACAAATTTAAGTGCTGGTGGGTTTGTATCTGGAGCTGTGACAAAGGGGAATGAAATTGGTATTTTAGCATTTGAGGTTGCAAACACTATTGTCAAGGGTTTTAGTCTTATGGAATCTCTTTCGACAAAAAGTATTAAGCATTTAAAAGAAGAGGTGCTTCCATTAGAGGCTGTGCAAGATTTAGTATCAAAGGATATGGATGAGCTTCTAAGGATTGTTGCTGCAGACAAAAGGGATGAGTTGAAAGTCTTTTCTGATGAGGTAATTCGTTTTGGAAATCGTTCAAAGGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGATACTTTGAGAAAGTTAGCAGAGAACTTAATTCTCAAAGACAACCAAAGGAGGAGGCAGAATTACTAATGCAACAATTGATGACGTTGGTTCAGTTAACAGCTGAATTATACCATGAGTTACATGCTTTGGATAGATTTGCACAAGATTATCAGCATAAGCGTGAAGAGGATGATAATTCAGGTGATGGCCTTTCAATCTTGAGGGCAGAACTTAAAAGTCAAAAAAAGCAAGTTAAACATTTGAAAAAAAAGTCACTCTGGTCCAGAAGTTTGGAGGAGATTATGGAGAAGCTTGTAGAGATAGTCCATTTTTTGCATTTGGAGATAAACAATGCCTTTGGCACTGAAGATGACCATAAACCATTAATTCAAACCATCAGCAGTCGCCAAAAATTGGGTCCTGCAGGCCTTGCTTTGCATTATGCTAATATAGTGCTCCAAATTGATACTCTTGTTGCCAGATCCAGTTCTATGCCTGCAAATACAAGGGATGCATTGTATCAGAGCTTGCCTCCTAATATAAAATCAGCTTTGCGTTCCAAATTACCAAGCTTTCATGTCGTAAAGCAGCTCACCATATCAAATATTAAAGAAGAGATGGAGAAAACATTGCATTGGCTGGTTCTGATTGCTACAAACACGGCCAAAGCACATCATGGTTTTGGTTGGGTAGGGGAGTGGGCAAGCACTGGTTCTGAGCTAAATAAGAAGACCATGAAGGCTGATGTGATGCGGATTGAAACGCTTCACCATGCCGATAAAGCTAAAGTAGAAAATTATATTCTTGAACTTCTCATATGGCTTCACCGCTTGGCCATCAAAAGTAAAGATGGCATTGATACCGGAGAAACGAGGTCTACCTTAAAGTCTCATGTTGGCACTGCCATTCAAACTACAAGTCAACAATCAACAAAAGCCTTACTGCCATTGTTAACAACTGACGAGCAGAAAATGCTGCAAGATGTTAGTAATAAAATTCACATAAGAAGGATCAGTAAAAGCTTGGACTTTGACAGTTTGAAGACAGATAATGACAGACTTACTAAGAGTAGCAGTTATTCTTATTCATCAACAAGTAGAAGCAAGGAATTATCTTTTAATAGAATTTTGTCTAAGCTTCCTGTTATTGATTTTGGTATTGACAAAAAAAGAGCATTGGATGTGATTGACAGATTAGATGTGGCCAGATAA

>Glyma.05g196700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g196700.1 locus=Glyma.05g196700 id=Glyma.05g196700.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MGGLCSKSAKGDKVFAKSDGHSDKHKSDGKNHKSTSMPSNLTSAGEHGVDKKKQEGSAAAAGNGSDDFYDGIPRFTDSFSHKSRSVKSRHAVAKVSEVSLRLGRAGIDVLDTLGSSMTNLSAGGFVSGAVTKGNEIGILAFEVANTIVKGFSLMESLSTKSIKHLKEEVLPLEAVQDLVSKDMDELLRIVAADKRDELKVFSDEVIRFGNRSKDPQWHNLDRYFEKVSRELNSQRQPKEEAELLMQQLMTLVQLTAELYHELHALDRFAQDYQHKREEDDNSGAAQSGDGLSILRAELKSQKKQVKHLKKKSLWSRSLEEIMEKLVEIVHFLHLEINNAFGTEDDHKPLIQTISSRQKLGPAGLALHYANIVLQIDTLVARSSSMPANTRDALYQSLPPNIKSALRSKLPSFHVVKQLTISNIKEEMEKTLHWLVLIATNTAKAHHGFGWVGEWASTGSELNKKTMKADVMRIETLHHADKAKVENYILELLIWLHRLAIKSKDGIDTGETRSTLKSHVGTAIQTTSQQSTKALLPLLTTDEQKMLQDVSNKIHIRRISKSLDFDSLKTDNDRLTKSSSYSYSSTSRSKELSFNRILSKLPVIDFGIDKKRALDVIDRLDVAR*

>Glyma.05g196700.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g196700.5 locus=Glyma.05g196700 id=Glyma.05g196700.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MGGLCSKSAKGDKVFAKSDGHSDKHKSDGKNHKSTSMPSNLTSAGEHGVDKKKQEGSAAAAGNGSDDFYDGIPRFTDSFSHKSRSVKSRHAVAKVSEVSLRLGRAGIDVLDTLGSSMTNLSAGGFVSGAVTKGNEIGILAFEVANTIVKGFSLMESLSTKSIKHLKEEVLPLEAVQDLVSKDMDELLRIVAADKRDELKVFSDEVIRFGNRSKDPQWHNLDRYFEKVSRELNSQRQPKEEAELLMQQLMTLVQLTAELYHELHALDRFAQDYQHKREEDDNSGDGLSILRAELKSQKKQVKHLKKKSLWSRSLEEIMEKLVEIVHFLHLEINNAFGTEDDHKPLIQTISSRQKLGPAGLALHYANIVLQIDTLVARSSSMPANTRDALYQSLPPNIKSALRSKLPSFHVVKQLTISNIKEEMEKTLHWLVLIATNTAKAHHGFGWVGEWASTGSELNKKTMKADVMRIETLHHADKAKVENYILELLIWLHRLAIKSKDGIDTGETRSTLKSHVGTAIQTTSQQSTKALLPLLTTDEQKMLQDVSNKIHIRRISKSLDFDSLKTDNDRLTKSSSYSYSSTSRSKELSFNRILSKLPVIDFGIDKKRALDVIDRLDVAR*







Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
USDA Logo
Iowa State University Logo