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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.05g185500

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:37251534
stop:37257388
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g185500
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G22510.1AT At-A/N-InvE,INV-E JGI N/AIEA
GO:0033926GO-mf glycopeptide alpha-N-acetylgalactosaminidase activity JGI N/AIEA
PTHR31916PantherFam FAMILY NOT NAMED JGI N/AIEA
PF12899Pfam Alkaline and neutral invertase JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.05g185500 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g31920 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g185500
>Glyma.05g185500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g185500.1.p locus=Glyma.05g185500 id=Glyma.05g185500.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g185500.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g185500.2.p locus=Glyma.05g185500 id=Glyma.05g185500.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g185500.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g185500.3.p locus=Glyma.05g185500 id=Glyma.05g185500.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g185500
>Glyma.05g185500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g185500.1 locus=Glyma.05g185500 id=Glyma.05g185500.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g185500.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g185500.2 locus=Glyma.05g185500 id=Glyma.05g185500.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g185500.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g185500.3 locus=Glyma.05g185500 id=Glyma.05g185500.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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