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Report for Sequence Feature Glyma.05g178900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:36694916
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Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g178900
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G39850.1AT ACN2,AtABCD1,CTS,PED3,PXA1 JGI N/AIEA
3.6.3.47EC JGI N/AIEA
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GO:0016887GO-mf ATP hydrolysis activity JGI N/AIEA
GO:0042626GO-mf ATPase-coupled transmembrane transporter activity JGI N/AIEA
PTHR11384PantherFam ATP-BINDING CASSETTE, SUB-FAMILY D MEMBER JGI N/AIEA
PF00005Pfam ABC transporter JGI N/AIEA
PF06472Pfam ABC transporter transmembrane region 2 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.05g178900 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g31270 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g178900
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>Glyma.05g178900.10 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g178900.10.p locus=Glyma.05g178900 id=Glyma.05g178900.10.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g178900.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g178900.2.p locus=Glyma.05g178900 id=Glyma.05g178900.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g178900.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g178900.3.p locus=Glyma.05g178900 id=Glyma.05g178900.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g178900.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g178900.9.p locus=Glyma.05g178900 id=Glyma.05g178900.9.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g178900
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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