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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.05g146600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:34079923
stop:34090335
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g146600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G67420.2AT JGI N/AIEA
KOG2194 KOG Aminopeptidases of the M20 family JGI N/AIEA
PTHR12147PantherFam METALLOPEPTIDASE M28 FAMILY MEMBER JGI N/AIEA
PTHR12147:SF22PantherFam PEPTIDASE_M28 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN JGI N/AIEA
PF04389Pfam Peptidase family M28 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.05g146600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g27910 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g146600
>Glyma.05g146600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g146600.1.p locus=Glyma.05g146600 id=Glyma.05g146600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g146600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g146600.3.p locus=Glyma.05g146600 id=Glyma.05g146600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g146600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g146600.4.p locus=Glyma.05g146600 id=Glyma.05g146600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g146600
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>Glyma.05g146600.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g146600.4 locus=Glyma.05g146600 id=Glyma.05g146600.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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