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Report for Sequence Feature Glyma.05g133100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:32647789
stop:32664201
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G55860.2AT UPL1 JGI N/AIEA
6.3.2.19EC JGI N/AIEA
GO:0004842GO-mf ubiquitin-protein transferase activity JGI N/AIEA
K10592KEGG Ubiquitin system JGI N/AIEA
PTHR11254PantherFam HECT DOMAIN UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE JGI N/AIEA
PF00627Pfam UBA/TS-N domain JGI N/AIEA
PF00632Pfam HECT-domain (ubiquitin-transferase) JGI N/AIEA
PF06012Pfam Domain of Unknown Function (DUF908) JGI N/AIEA
PF06025Pfam Domain of Unknown Function (DUF913) JGI N/AIEA
PF14377Pfam Ubiquitin binding region JGI N/AIEA

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g26360 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.05g133100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g133100.1.p locus=Glyma.05g133100 id=Glyma.05g133100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g133100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g133100.1 locus=Glyma.05g133100 id=Glyma.05g133100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g133100.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g133100.6 locus=Glyma.05g133100 id=Glyma.05g133100.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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