Report for Sequence Feature Glyma.05g131800
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm05
Start: 32486716
stop: 32496454
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.05g131800
Expression Patterns of Glyma.05g131800
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Related Legume Genes
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
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Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.05g131800
Paralog Evidence Comments
Glyma.08g086300 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.05g131800 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma05g26210 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.05g131800
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.05g131800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TGAGATTTTTTGTCTGCTAGCTTCCAAGAGAAAATAGTGCTCACATTCTTCTCATCTGTGTTTCAGTTCTGTTACGTTCTTCGTTTCCTGTGAAAACCTTGCATGTGTTCTTCTCATCTCTTAGTTTTCAACACTGAGCCTAGTTATGTGAAAATTCAGATGGGTTCTGGTTTTTAACCCCTGACTTGGAAGGAACCCAAAAAAAAAACGATTTTTTTGAGAACTCACTTTGGAACTTTCAGTGGCAAGTAGCAGATTATGCTACAAGAGGTGAGGCTTGCTTCAGGGGTGGAGGAACTCTTGAAAAGGGAGATTATAAGGCTGCATAGCTGTTACTGCTTGGAACTTGCAAGTTATTGAACTAAGCTCAAAATGGGTTCGAGAGTAGATACTGATGAAGATAGTGATAACAGAGGTAGTATGTGGGATTTGGATCAGAAGCTTGACCAGCCTATGGATGAAGAGGCAGGAAGGCTCAGAAATATGTACAGAGAAAAAAAATCTTCAGCATTGTTGCTTCTGCGGCTAGCATTTCAGAGTCTTGGTGTGGTTTATGGAGACTTGGGCACTTCACCCTTGTATGTTTTCTACAATACATTTCCTAATGGAGTGAAAGATGAGGAGGATGTAATTGGAGCGCTTTCTTTGATTATCTACTCTCTTACCTTGGTGCCACTCCTCAAATATGTTTTTGTTGTATTAAGAGCAAATGACAATGGCCAAGGTGGAACATTTGCGCTTTATTCCTTGCTTTGCCGGCATGCAAAGATAAAAACCATTCCTAACCAGCATCGAACCGATGAAGACCTAACGACATATAGTCGGTCTACCTTCCATGAAAAATCTTTTGCTGCAAAAACCAAAAGATGGTTAGAGGAACAAGAATCTGCGAAAAGAGCCATTCTTATTCTTGTCCTTGTTGGCACCTGTATGGTTATTGGAGATGGGATTCTTACCCCGGCTATATCTGTTTTATCAGCTGTTGGTGGCATCAAGGTAAATCAGCCTCGGATGAGTAGTGGTGTAGTAGTGCTGGTTGCTGTGGTAATATTAGTTGGGTTCTTCAGCATGCAACATTATGGCACAGATAGAGTTAGTTGGCTCTTTGCTCCAATTGTCCTTCTTTGGTTTCTCCTAATTGGAGGTATAGGTATATTTAACATCTGGAAGTATGGAAGCGGTGTTCTAAAAGCTTTTTCTCCGGTGTATATATATCGCTATTTTAGAAGAGGAGGAAAGGAAGGATGGACTTCCCTTGGTGGGATCATGCTCAGCATAACTGGGACAGAAGCTCTTTTTGCTGACCTAGCCCATTTTCCAGTCTCAGCTGTACAGCTTGCATTTACTCTAGTTGTGTTTCCTTGCCTTCTTTTAGCCTATTCTGGTCAAGCTGCTTACCTTATGAATAACTTGACCCATTCACAAGATGCTTTTTATCGTTCAATTCCAGATAGAATATATTGGCCAGTATTTATTGTTGCAACATTGGCAGCCGTAGTTGCAAGCCAGGCTACAATAACTGCAACTTTTTCAATTATTAAGCAAGCCCTTGCTCTTGGATCTTTCCCTAGAGTTAAAGTTGTGTATACATCAAAGAAATTTCTTGGCCAGATATATGTTCCAGATATTAATTGGATCCTTATGATTCTTTGCATTGCTGTTACGGCTGGGTTCGAAAATCAAAACCAGATTGGAAATGCATATGGTACTGCAGTTGTTATAGTCATGCTGGTTACAACGATCCTTATGATTTTAATCATGATACTAGTGTGGCGCTGCCATTGGATTCTCGTCCTCGTCTTCACTGGCTTATCATTGATTGTGGAATGCACATACTTCTCCTCAGTACTCTTCAAAGTTGATCAAGGTGGGTGGGTTCCACTTGCCATTGCTGGAGCATTTCTTATTATTATGTCTGTTTGGCATTACGGCACCGTGAAACGGTATGAGTTTGAAATGCATAGTAAGGTCTCAATGGCATGGATTCTTGGTCTTGGCCCAAGTTTAGGACTTGTTCGTGTCCCCGGAATTGGACTAGTCTACACAGAACTTGCAAGTGGAGTGCCCCACATTTTTTCTCATTTCATCACCAACCTACCAGCCATTCATTCCGTTGTTGTTTTTGTATGTGTGAAGTACCTTCCTGTCTACACAGTCCCAGAAGAAGAACGATTCCTTGTCAAGAGGATTGGACCTAAGAATTTCCACATCTTTCGATGTGTGGCACGGTATGGCTATAAAGATCTGCACAAGAAAGATGATGATTTTGAGAAAAAACTCTTTGAGAACCTTTTCACATTCGTTCGGCTTGAGTCTATGATGGAAGGATGTTCAGATTCAGATGAATACAGCTTATATGGACAGAAAATAGAGCATCCAAGAGATGGCCTTTTGCATAACAATGGAAGCACAGTTTCTTCCAATATGGATTTAACAATGTCCTCAGTAGATTCAATAGTACCAGTTAGATCACCGCATCACATGAATATTACTGTCAGGTCTTCTGGTCAAACAAGCAGCCAGACCGAAGTTGACGAATTTGAATTTTTGAATACCTGCAGGGATGCTGGGGTGGTTCACATACTAGGAAACACAGTTGTGAGGGCAAGGAGAGAATCAAGGTTCTACAAGAAAATAGCTGTTGATTATATTTATGCATTTCTTAGGAAGATATGCAGGGAAAATAGTGTAATCTTCAATGTCCCTCATGAGAGTCTCTTAAATGTTGGCCAGATTTTCTATGTATAGATAGCCCCATATCCTTGTGATTGCCATTTTTTGCAAAATGAGCTGAGTGTAGCACATGAACAACACTTAGCTTATGGTAATCAAGTGTTACAATTCGGAGATGTCTTAGAAGAATGGCTTTTTGGCAATTATCTCTTAAAAATTGAAAGTATTGCTCCCATATGGC
Coding sequences of Glyma.05g131800
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.05g131800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g131800.1.p locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGGGTTCGAGAGTAGATACTGATGAAGATAGTGATAACAGAGGTAGTATGTGGGATTTGGATCAGAAGCTTGACCAGCCTATGGATGAAGAGGCAGGAAGGCTCAGAAATATGTACAGAGAAAAAAAATCTTCAGCATTGTTGCTTCTGCGGCTAGCATTTCAGAGTCTTGGTGTGGTTTATGGAGACTTGGGCACTTCACCCTTGTATGTTTTCTACAATACATTTCCTAATGGAGTGAAAGATGAGGAGGATGTAATTGGAGCGCTTTCTTTGATTATCTACTCTCTTACCTTGGTGCCACTCCTCAAATATGTTTTTGTTGTATTAAGAGCAAATGACAATGGCCAAGGTGGAACATTTGCGCTTTATTCCTTGCTTTGCCGGCATGCAAAGATAAAAACCATTCCTAACCAGCATCGAACCGATGAAGACCTAACGACATATAGTCGGTCTACCTTCCATGAAAAATCTTTTGCTGCAAAAACCAAAAGATGGTTAGAGGAACAAGAATCTGCGAAAAGAGCCATTCTTATTCTTGTCCTTGTTGGCACCTGTATGGTTATTGGAGATGGGATTCTTACCCCGGCTATATCTGTTTTATCAGCTGTTGGTGGCATCAAGGTAAATCAGCCTCGGATGAGTAGTGGTGTAGTAGTGCTGGTTGCTGTGGTAATATTAGTTGGGTTCTTCAGCATGCAACATTATGGCACAGATAGAGTTAGTTGGCTCTTTGCTCCAATTGTCCTTCTTTGGTTTCTCCTAATTGGAGGTATAGGTATATTTAACATCTGGAAGTATGGAAGCGGTGTTCTAAAAGCTTTTTCTCCGGTGTATATATATCGCTATTTTAGAAGAGGAGGAAAGGAAGGATGGACTTCCCTTGGTGGGATCATGCTCAGCATAACTGGGACAGAAGCTCTTTTTGCTGACCTAGCCCATTTTCCAGTCTCAGCTGTACAGCTTGCATTTACTCTAGTTGTGTTTCCTTGCCTTCTTTTAGCCTATTCTGGTCAAGCTGCTTACCTTATGAATAACTTGACCCATTCACAAGATGCTTTTTATCGTTCAATTCCAGATAGAATATATTGGCCAGTATTTATTGTTGCAACATTGGCAGCCGTAGTTGCAAGCCAGGCTACAATAACTGCAACTTTTTCAATTATTAAGCAAGCCCTTGCTCTTGGATCTTTCCCTAGAGTTAAAGTTGTGTATACATCAAAGAAATTTCTTGGCCAGATATATGTTCCAGATATTAATTGGATCCTTATGATTCTTTGCATTGCTGTTACGGCTGGGTTCGAAAATCAAAACCAGATTGGAAATGCATATGGTACTGCAGTTGTTATAGTCATGCTGGTTACAACGATCCTTATGATTTTAATCATGATACTAGTGTGGCGCTGCCATTGGATTCTCGTCCTCGTCTTCACTGGCTTATCATTGATTGTGGAATGCACATACTTCTCCTCAGTACTCTTCAAAGTTGATCAAGGTGGGTGGGTTCCACTTGCCATTGCTGGAGCATTTCTTATTATTATGTCTGTTTGGCATTACGGCACCGTGAAACGGTATGAGTTTGAAATGCATAGTAAGGTCTCAATGGCATGGATTCTTGGTCTTGGCCCAAGTTTAGGACTTGTTCGTGTCCCCGGAATTGGACTAGTCTACACAGAACTTGCAAGTGGAGTGCCCCACATTTTTTCTCATTTCATCACCAACCTACCAGCCATTCATTCCGTTGTTGTTTTTGTATGTGTGAAGTACCTTCCTGTCTACACAGTCCCAGAAGAAGAACGATTCCTTGTCAAGAGGATTGGACCTAAGAATTTCCACATCTTTCGATGTGTGGCACGGTATGGCTATAAAGATCTGCACAAGAAAGATGATGATTTTGAGAAAAAACTCTTTGAGAACCTTTTCACATTCGTTCGGCTTGAGTCTATGATGGAAGGATGTTCAGATTCAGATGAATACAGCTTATATGGACAGAAAATAGAGCATCCAAGAGATGGCCTTTTGCATAACAATGGAAGCACAGTTTCTTCCAATATGGATTTAACAATGTCCTCAGTAGATTCAATAGTACCAGTTAGATCACCGCATCACATGAATATTACTGTCAGGTCTTCTGGTCAAACAAGCAGCCAGACCGAAGTTGACGAATTTGAATTTTTGAATACCTGCAGGGATGCTGGGGTGGTTCACATACTAGGAAACACAGTTGTGAGGGCAAGGAGAGAATCAAGGTTCTACAAGAAAATAGCTGTTGATTATATTTATGCATTTCTTAGGAAGATATGCAGGGAAAATAGTGTAATCTTCAATGTCCCTCATGAGAGTCTCTTAAATGTTGGCCAGATTTTCTATGTATAG
>Glyma.05g131800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g131800.2.p locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGGGTTCGAGAGTAGATACTGATGAAGATAGTGATAACAGAGGTAGTATGTGGGATTTGGATCAGAAGCTTGACCAGCCTATGGATGAAGAGGCAGGAAGGCTCAGAAATATGTACAGAGAAAAAAAATCTTCAGCATTGTTGCTTCTGCGGCTAGCATTTCAGAGTCTTGGTGTGGTTTATGGAGACTTGGGCACTTCACCCTTGTATGTTTTCTACAATACATTTCCTAATGGAGTGAAAGATGAGGAGGATGTAATTGGAGCGCTTTCTTTGATTATCTACTCTCTTACCTTGGTGCCACTCCTCAAATATGTTTTTGTTGTATTAAGAGCAAATGACAATGGCCAAGGTGGAACATTTGCGCTTTATTCCTTGCTTTGCCGGCATGCAAAGATAAAAACCATTCCTAACCAGCATCGAACCGATGAAGACCTAACGACATATAGTCGGTCTACCTTCCATGAAAAATCTTTTGCTGCAAAAACCAAAAGATGGTTAGAGGAACAAGAATCTGCGAAAAGAGCCATTCTTATTCTTGTCCTTGTTGGCACCTGTATGGTTATTGGAGATGGGATTCTTACCCCGGCTATATCTGTTTTATCAGCTGTTGGTGGCATCAAGGTAAATCAGCCTCGGATGAGTAGTGGTGTAGTAGTGCTGGTTGCTGTGGTAATATTAGTTGGGTTCTTCAGCATGCAACATTATGGCACAGATAGAGTTAGTTGGCTCTTTGCTCCAATTGTCCTTCTTTGGTTTCTCCTAATTGGAGGTATAGGTATATTTAACATCTGGAAGTATGGAAGCGGTGTTCTAAAAGCTTTTTCTCCGGTGTATATATATCGCTATTTTAGAAGAGGAGGAAAGGAAGGATGGACTTCCCTTGGTGGGATCATGCTCAGCATAACTGGGACAGAAGCTCTTTTTGCTGACCTAGCCCATTTTCCAGTCTCAGCTGTACAGCTTGCATTTACTCTAGTTGTGTTTCCTTGCCTTCTTTTAGCCTATTCTGGTCAAGCTGCTTACCTTATGAATAACTTGACCCATTCACAAGATGCTTTTTATCGTTCAATTCCAGATAGAATATATTGGCCAGTATTTATTGTTGCAACATTGGCAGCCGTAGTTGCAAGCCAGGCTACAATAACTGCAACTTTTTCAATTATTAAGCAAGCCCTTGCTCTTGGATCTTTCCCTAGAGTTAAAGTTGTGTATACATCAAAGAAATTTCTTGGCCAGATATATGTTCCAGATATTAATTGGATCCTTATGATTCTTTGCATTGCTGTTACGGCTGGGTTCGAAAATCAAAACCAGATTGGAAATGCATATGGTACTGCAGTTGTTATAGTCATGCTGGTTACAACGATCCTTATGATTTTAATCATGATACTAGTGTGGCGCTGCCATTGGATTCTCGTCCTCGTCTTCACTGGCTTATCATTGATTGTGGAATGCACATACTTCTCCTCAGTACTCTTCAAAGTTGATCAAGGTGGGTGGGTTCCACTTGCCATTGCTGGAGCATTTCTTATTATTATGTCTGTTTGGCATTACGGCACCGTGAAACGGTATGAGTTTGAAATGCATAGTAAGGTCTCAATGGCATGGATTCTTGGTCTTGGCCCAAGTTTAGGACTTGTTCGTGTCCCCGGAATTGGACTAGTCTACACAGAACTTGCAAGTGGAGTGCCCCACATTTTTTCTCATTTCATCACCAACCTACCAGCCATTCATTCCGTTGTTGTTTTTGTATGTGTGAAGTACCTTCCTGTCTACACAGTCCCAGAAGAAGAACGATTCCTTGTCAAGAGGATTGGACCTAAGAATTTCCACATCTTTCGATGTGTGGCACGGTATGGCTATAAAGATCTGCACAAGAAAGATGATGATTTTGAGAAAAAACTCTTTGAGAACCTTTTCACATTCGTTCGGCTTGAGTCTATGATGGAAGGATGTTCAGATTCAGATGAATACAGCTTATATGGACAGAAAATAGAGCATCCAAGAGATGGCCTTTTGCATAACAATGGAAGCACAGTTTCTTCCAATATGGATTTAACAATGTCCTCAGTAGATTCAATAGTACCAGTTAGATCACCGCATCACATGAATATTACTGTCAGGTCTTCTGGTCAAACAAGCAGCCAGACCGAAGTTGACGAATTTGAATTTTTGAATACCTGCAGGGATGCTGGGGTGGTTCACATACTAGGAAACACAGTTGTGAGGGCAAGGAGAGAATCAAGGTTCTACAAGAAAATAGCTGTTGATTATATTTATGCATTTCTTAGGAAGATATGCAGGGAAAATAGTGTAATCTTCAATGTCCCTCATGAGAGTCTCTTAAATGTTGGCCAGATTTTCTATGTATAG
>Glyma.05g131800.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g131800.3.p locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g131800
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
>Glyma.05g131800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g131800.1 locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g131800.2 locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g131800.3 locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g131800.4 locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.05g131800.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g131800.5 locus=Glyma.05g131800 ID=Glyma.05g131800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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