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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.05g117500

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:31093199
stop:31099531
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g117500
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G09400.1AT KUP7 JGI N/AIEA
GO:0071805GO-bp potassium ion transmembrane transport JGI N/AIEA
GO:0016020GO-cc membrane JGI N/AIEA
GO:0015079GO-mf potassium ion transmembrane transporter activity JGI N/AIEA
PTHR30540PantherFam OSMOTIC STRESS POTASSIUM TRANSPORTER JGI N/AIEA
PTHR30540:SF8PantherFam POTASSIUM TRANSPORTER 7 JGI N/AIEA
PF02705Pfam K+ potassium transporter JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.05g117500 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g24530 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g117500
>Glyma.05g117500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g117500.1.p locus=Glyma.05g117500 id=Glyma.05g117500.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g117500.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g117500.2.p locus=Glyma.05g117500 id=Glyma.05g117500.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g117500.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g117500.4.p locus=Glyma.05g117500 id=Glyma.05g117500.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCAAACCCTAAAACCAAAAGTCACCATTCCCTGGGCGGCGAGGACGATCCCGACTCGACCGAATCGCGGTGGGTCTTCCAGGAGGACGAGGATCCCTCCGAGATCGAGGACTTCGATGCCGCAGATTTGCGCCACCAGTCCATGTTCGATTCTGACGACGAGGACAATGCCGAGCAGAGACTCGTTCGCACCGGTCCCCGAATCGATTCCTTCGACGTCGAAGCCCTTGAGGTTCCCGGCGCTCACAGAAACGACTACGAGGATGTTAGTGTGGGAAAAGGAATTTTGTTGGCTTTTCAAACTCTCGGTGTTGTCTTTGGCGATGTTGGAACGAGTCCTTTGTATACCTTCAGTGTTATGTTTAGGAAGGCTCCTATTAAGGGAAATGAAGATATTCTTGGAGCCTTGTCGCTTGTTTTGTACACTTTAATCTTGATTCCGTTAGTGAAGTACGTCCTTGTTGTTCTGTGGGCCAACGACGATGGGGAAGGTGGTACTTTTGCGTTGTACTCGTTGATTTGTCGAAATGCTAAGGTGAGTCTTCTTCCCAATCAGTTGCGATCGGATGCCCGAATATCAAGCTTTAGGCTAAAGGTGCCGTCTCCTGAGCTTGAAAGGTCTTTAAAAATCAAGGAGAGGCTAGAGACTTCAGTGACTCTGAAGAAGATTCTACTATTATTTGTTCTTGCTGGTATTTCCATGGTGATGGCTAACGGGGTTGTTACACCAGCAATGTCAGTACTATCATCTCTTAATGGTTTGAAAGTTGGGGTAGATGCAATTAAGCAAGATGAAGTGGTGATGATTTCTGTTGCCTGCCTTGTCATTTTGTTTAGTGTACAGAAGTATGGAACAAGTAAAGTGGGGCTTGCTGTAGGACCTGCTTTGTTTATATGGTTTTGTTCTCTTGCGGGCATTGGTATATTCAACCTTGTCAAATATGACAGCAGTGTTTTGAGGGCATTTAATCCTATTCATATATATTATTTCTTTGCAAGGAATTCAACTAAAGCATGGTATTCTCTTGGGGGCTGTCTTCTTTGTGCAACTGGCTCTGAGGCTATGTTTGCAGATCTTTGCTATTTCTCTGTACAATCAGTTCAGCTTACATTTGTATTTCTTGTTTTACCATGCCTACTGTTGGGTTATTTGGGTCAAGCTGCATACCTTATGGAAAACCATGCTGATGCTGCCACATTTTCTTGTATAAAACAGTCAGCTGCTCTTGGTTGTTTCCCTCGTCTTAAAATAATTCATACCTCTCGGAAATTCATGGGCCAGATCTATATCCCTGTCATAAACTGGTTTCTCTTGGCTGTTTCTTTGGTGCTTGTCTGTTCTATATCCAGCATTGATGAGATTGGAAATGCATATGGCATTGCTGAGCTGGGGGTGATGATGATGACCACTATTTTAGTAACTCTTGTTATGCTTCTTATATGGCAGATACACATCATTGTAGTGCTGAGTTTTGCTGTAGTCTTCCTGGGATTGGAGTTGACTTTCTTTTCATCAGTTCTGTGGAGTGTAACGGATGGAAGTTGGATTATATTGGTCTTTGCTGTAATAATGTTTTTTATAATGTTTGTATGGAATTATGGGAGCAAGCTCAAGTATGAAACTGAAGTAAAGCAAAAGCTGTCAATGGATTTGATGCGAGAATTAGGCTGCAATCTTGGGACAATACGAGCTCCTGGGATTGGTTTGCTCTATAATGAGTTGGTCAAAGGAATTCCAGGCATTTTTGGGCATTTTCTAACCACACTTCCAGCAGTACACTCTATGATCATATTTGTGAGTATTAAGTATGTTCCAGTCCCTATGGTGCCTCAAAGTGAAAGGTTCCTTTTTAGGCGAGTTTGCCAGAGAAGCTATCATATATTTCGCTGTATTGCCAGGTATGGTTACAAAGATGTTCGCAAAGAAAATCACCAAACTTTTGAGCAACTGCTGATGGAGAGCTTAGAGAAGTTTATACGTCGTGAGGCTCAGGAAAGGTCGCTCGAGAGTGAAGGGGATGATGATACTGATTCTGAGGATGAGTACTCTGGTTCTAGGGTTCTCATAGCTCCCAATGGGAGTGTTTATTCACTTGGTGTTCCTCTTCTGGCTGATTTTAATGATACAACCATACCCATACCCAATTTTGAAGCAAGCACATCTGAGGAAGCAAACCCTGAATCTCCTAAGCCCCCAGTGCTTGATGCTGAGCAGAGTCTCGAAAGAGAGCTATCTTTTATACGCAAGGCTAAAGAATCTGGAGTTGTTTATCTTCTTGGTCACGGGGATATAAGAGCAAGAAAAGACTCATGGTTTATCAAGAAGCTAATTATAAACTATTTTTATGCCTTTCTGAGAAAGAACTGCCGAAGTGGGATCACAAATTTAAGTGTACCCCATTCACATATGATGCAGGTTGGCATGACCTACATGGTTTGA
Predicted protein sequences of Glyma.05g117500
>Glyma.05g117500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g117500.1 locus=Glyma.05g117500 id=Glyma.05g117500.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g117500.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g117500.2 locus=Glyma.05g117500 id=Glyma.05g117500.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g117500.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g117500.4 locus=Glyma.05g117500 id=Glyma.05g117500.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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