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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT3G01910.1 | AT | sulfite oxidase | JGI | N/A | IEA |
GO:0042128 | GO-bp | nitrate assimilation | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0055114 | GO-bp | oxidation-reduction process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0055114 | GO-bp | oxidation-reduction process | JGI | N/A | IEA |
GO:0009055 | GO-mf | electron carrier activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0016491 | GO-mf | oxidoreductase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
KOG0535 | KOG | Sulfite oxidase, molybdopterin-binding component | JGI | N/A | IEA |
PTHR19372 | Panther | SULFITE REDUCTASE | JGI | N/A | IEA |
PF00174 | PFAM | Oxidoreductase molybdopterin binding domain | JGI | N/A | IEA |
PWY-5326 | SoyCyc9 | sulfite oxidation IV | Plant Metabolic Network | ISS | |
GN7V-41273 | SoyCyc9-rxn | sulfite oxidase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.05g078300 not represented in the dataset |
Glyma.05g078300 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.19g071800 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma05g14420 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.05g078300.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g078300 ID=Glyma.05g078300.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.05g078300.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g078300 ID=Glyma.05g078300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.05g078300.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.05g078300 ID=Glyma.05g078300.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||