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Report for Sequence Feature Glyma.05g049100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:4500019
stop:4506345
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G63110.1AT JGI N/AIEA
GO:0006506GO-bp GPI anchor biosynthetic process JGI N/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane JGI N/AIEA
K05293KEGG Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis JGI N/AIEA
KOG2552 KOG Major facilitator superfamily permease - Cdc91p JGI N/AIEA
PTHR13121PantherFam GPI TRANSAMIDASE COMPONENT PIG-U JGI N/AIEA
PTHR13121:SF0PantherFam PHOSPHATIDYLINOSITOL GLYCAN ANCHOR BIOSYNTHESIS CLASS U PROTEIN JGI N/AIEA
PF06728Pfam GPI transamidase subunit PIG-U JGI N/AIEA

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g03470 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.05g049100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g049100.1.p locus=Glyma.05g049100 id=Glyma.05g049100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g049100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g049100.3.p locus=Glyma.05g049100 id=Glyma.05g049100.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGTTCTGGACTTGCGTTCTTGGTTCCATTGTTTTGAGGCTCATTCTACTCTACTTTCCCAAAAACCTCAACCTCTCTTCTCGCCCCGAAGTCTCCACCCCCCTCACCAGCCTCCGTCACCCTATGCCGGATCAATGTACCATGGTTCCCCTTTGTTATTGACACTTCTCGGTCCGCTCACAGTTAAAAGAATTGAAGGACAACCTGATCATCTTTTATGCAGTTTGGTTTTTGTGATTGCAGATGTGGTCAGTGCAATGCTTATTTGTGCTGCTGGTGAAAAACTCAAGGTGGCATGCAGTTCAAGCTTGCAATCCCTTGGCCTTCATAATTTGTCAGAGAATTCAGAGCGTCTCCCTTCAGGAGATTTTGCTGCTCTTGTATACTTATGGAATCCTTTCACAATAGTGGCATGCGTTGGTCTATCCACATCTGCAATTGAGAACTTGATGGTTGTGTTATCACTCTATGGAGCATGTTCACGACTAGCTCCGCTGGCAGCTTTTGGGTGGGTCATGGCTACACACTTGTCTCTGTACCCTGCAATCCTTATTATCCCAGTGATATTGCTATTGGGATATGGTCCTGATGCTCCTCCTAGGAAATTATTCTGTCAAAGGAAAAATCTTGAAGTTGGCAACTCTACCCCAAGTGATAGTTGTTCAGAAGAGGAAGCAAAGAATCAGCTAAAGGTGGCAAATGTATTCTCATGGAGGCCAGTGGTGTTTTTTTTGTTCTGGACTTTGCTGTGGTCATCCTACGTCTTGGTCCTTTGTGGCATATGTGTCCAACAGTATGGTGGTCTACATGAGTTGTTCAAAAGAACCTATGGCTTTATTCTTACCACACAAGATCTGTCTCCAAACATTGGTGTTTTGTGGTACTTCTTTGCAGAAGTTTTTGATTTTTTCAGAAATTTCTTCCTGATAGTATTTCATGGGAATATTCTATTGATGATAGCACCATTAGCCTTACGGCTTAATCACCGGCCGTGCTTTCTAGCTTTTGTATATATTGTGATATCTTCTATGTTGAAGTCTTATCCTTCAATATGCAGTTTTCATTCTTCCTGTTTTCTGGCTATGTTGGGGTTTCACTTCTTAGCCCTGTGA

>Glyma.05g049100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g049100.4.p locus=Glyma.05g049100 id=Glyma.05g049100.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCTTATTTGTGCTGCTGGTGAAAAACTCAAGGTGGCATGCAGTTCAAGCTTGCAATCCCTTGGCCTTCATAATTTGTCAGAGAATTCAGAGCGTCTCCCTTCAGGAGATTTTGCTGCTCTTGTATACTTATGGAATCCTTTCACAATAGTGGCATGCGTTGGTCTATCCACATCTGCAATTGAGAACTTGATGGTTGTGTTATCACTCTATGGAGCATGTTCACGACTAGCTCCGCTGGCAGCTTTTGGGTGGGTCATGGCTACACACTTGTCTCTGTACCCTGCAATCCTTATTATCCCAGTGATATTGCTATTGGGATATGGTCCTGATGCTCCTCCTAGGAAATTATTCTGTCAAAGGAAAAATCTTGAAGTTGGCAACTCTACCCCAAGTGATAGTTGTTCAGAAGAGGAAGCAAAGAATCAGCTAAAGGTGGCAAATGTATTCTCATGGAGGCCAGTGGTGTTTTTTTTGTTCTGGACTTTGCTGTGGTCATCCTACGTCTTGGTCCTTTGTGGCATATGTGTCCAACAGTATGGTGGTCTACATGAGTTGTTCAAAAGAACCTATGGCTTTATTCTTACCACACAAGATCTGTCTCCAAACATTGGTGTTTTGTGGTACTTCTTTGCAGAAGTTTTTGATTTTTTCAGAAATTTCTTCCTGATAGTATTTCATGGGAATATTCTATTGATGATAGCACCATTAGCCTTACGGCTTAATCACCGGCCGTGCTTTCTAGCTTTTGTATATATTGTGATATCTTCTATGTTGAAGTCTTATCCTTCAGTTGGTGATTCAGCTCTGTATTTGGGTTTACTTGGGTTATTTGCATATGAACTCAAAGATATGCAGTTTTCATTCTTCCTGTTTTCTGGCTATGTTGGGGTTTCACTTCTTAGCCCTGTGATGCACAATCTATGGATATGGAGGGGTACTGGAAATGCAAATTTTTACTTTGCGACTGCAATTGCTTATGCGTGCTTGCAGATCATTCTGGTGGTTGAGAGTGTTAGTGCCATGCTCAATCATGACAGAAAGCTTACAAAGCTATATACTGCAAAGCTTCAACACATCAAATCTTGA

>Glyma.05g049100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g049100.1 locus=Glyma.05g049100 id=Glyma.05g049100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g049100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g049100.3 locus=Glyma.05g049100 id=Glyma.05g049100.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g049100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g049100.4 locus=Glyma.05g049100 id=Glyma.05g049100.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MLICAAGEKLKVACSSSLQSLGLHNLSENSERLPSGDFAALVYLWNPFTIVACVGLSTSAIENLMVVLSLYGACSRLAPLAAFGWVMATHLSLYPAILIIPVILLLGYGPDAPPRKLFCQRKNLEVGNSTPSDSCSEEEAKNQLKVANVFSWRPVVFFLFWTLLWSSYVLVLCGICVQQYGGLHELFKRTYGFILTTQDLSPNIGVLWYFFAEVFDFFRNFFLIVFHGNILLMIAPLALRLNHRPCFLAFVYIVISSMLKSYPSVGDSALYLGLLGLFAYELKDMQFSFFLFSGYVGVSLLSPVMHNLWIWRGTGNANFYFATAIAYACLQIILVVESVSAMLNHDRKLTKLYTAKLQHIKS*







Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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