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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.05g041600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
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stop:3857688
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g041600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G24690.1AT JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
GO:0008270GO-mf zinc ion binding JGI N/AIEA
K17987KEGG Mitochondrial biogenesis JGI N/AIEA
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PTHR20930:SF0PantherFam PROTEIN ILRUN JGI N/AIEA
PF00564Pfam PB1 domain JGI N/AIEA
PF00569Pfam Zinc finger, ZZ type JGI N/AIEA
PF16158Pfam Ig-like domain from next to BRCA1 gene JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.05g041600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g02631 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g041600
>Glyma.05g041600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g041600.1.p locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g041600.2.p locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g041600.3.p locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g041600.4.p locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g041600.5.p locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g041600.6.p locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g041600
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>Glyma.05g041600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g041600.2 locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g041600.3 locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g041600.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g041600.6 locus=Glyma.05g041600 id=Glyma.05g041600.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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