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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research



Report for Sequence Feature Glyma.05g003600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:282992
stop:289418
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G19130.1AT JGI N/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane JGI N/AIEA
GO:0042765GO-cc GPI-anchor transamidase complex JGI N/AIEA
K05289KEGG Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis JGI N/AIEA
KOG3566 KOG Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment protein GAA1 JGI N/AIEA
PTHR13304PantherFam GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL ANCHOR ATTACHMENT 1 PROTEIN JGI N/AIEA
PTHR13304:SF0PantherFam GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL ANCHOR ATTACHMENT 1 PROTEIN JGI N/AIEA
PF04114Pfam Gaa1-like, GPI transamidase component JGI N/AIEA

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g08990 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.05g003600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g003600.1.p locus=Glyma.05g003600 id=Glyma.05g003600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g003600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g003600.3.p locus=Glyma.05g003600 id=Glyma.05g003600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g003600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g003600.4.p locus=Glyma.05g003600 id=Glyma.05g003600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g003600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g003600.1 locus=Glyma.05g003600 id=Glyma.05g003600.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g003600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g003600.3 locus=Glyma.05g003600 id=Glyma.05g003600.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g003600.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g003600.4 locus=Glyma.05g003600 id=Glyma.05g003600.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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