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Report for Sequence Feature Glyma.05g001600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:114016
stop:123418
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g001600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G23590.1AT MED33A,RFR1 JGI N/AIEA
PTHR33739PantherFam OS07G0681500 PROTEIN JGI N/AIEA
PTHR33739:SF5PantherFam MEDIATOR OF RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION SUBUNIT 33A JGI N/AIEA

Proteins Associated with Glyma.05g001600
LocusGene SymbolProtein Name
MED5-2 Mediator Complex 5 gene 2

Gene model name correspondences to Glyma.05g001600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g09220 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g001600
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>Glyma.05g001600.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g001600.2.p locus=Glyma.05g001600 id=Glyma.05g001600.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g001600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g001600.3.p locus=Glyma.05g001600 id=Glyma.05g001600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g001600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g001600.4.p locus=Glyma.05g001600 id=Glyma.05g001600.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g001600
>Glyma.05g001600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g001600.1 locus=Glyma.05g001600 id=Glyma.05g001600.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g001600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g001600.2 locus=Glyma.05g001600 id=Glyma.05g001600.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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