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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.05g000200

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm05
Start:11397
stop:19957
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.05g000200
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G23450.2AT ATLCBK1,LCBK1 JGI N/AIEA
2.7.1.91EC sphingosine kinase JGI N/AIEA
GO:0016301GO-mf kinase activity JGI N/AIEA
KOG1116 KOG Sphingosine kinase, involved in sphingolipid metabolism JGI N/AIEA
PTHR12358PantherFam SPHINGOSINE KINASE JGI N/AIEA
PF00781Pfam Diacylglycerol kinase catalytic domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.05g000200 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma05g09400 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.05g000200
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>Glyma.05g000200.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g000200.2.p locus=Glyma.05g000200 id=Glyma.05g000200.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g000200.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g000200.4.p locus=Glyma.05g000200 id=Glyma.05g000200.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g000200.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g000200.5.p locus=Glyma.05g000200 id=Glyma.05g000200.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g000200.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.05g000200.6.p locus=Glyma.05g000200 id=Glyma.05g000200.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.05g000200
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>Glyma.05g000200.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g000200.2 locus=Glyma.05g000200 id=Glyma.05g000200.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.05g000200.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.05g000200.4 locus=Glyma.05g000200 id=Glyma.05g000200.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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