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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.04g193000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm04
Start:45274728
stop:45285287
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.04g193000
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G48470.1AT EMB2423 JGI N/AIEA
K11137KEGG DNA repair and recombination proteins JGI N/AIEA
PTHR15830PantherFam TELOMERE LENGTH REGULATION PROTEIN TEL2 FAMILY MEMBER JGI N/AIEA
PF10193Pfam Telomere length regulation protein JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.04g193000 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma04g36800 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.04g193000
>Glyma.04g193000.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g193000.1.p locus=Glyma.04g193000 id=Glyma.04g193000.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g193000.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g193000.3.p locus=Glyma.04g193000 id=Glyma.04g193000.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGAGGAGGGTTTAGGGAAGAGAGAATTGGAAGGTGAGGTAGTTAGCAGGGTTGCCGAAGTGATTTCGGCTATAAAGAATGCGAAGCACGTCGATCAAGTCATTTGCGCGCTTCATTCCTTAGCCACTATTCTTTTCCCCTTTGACCCTTCTCTCCTCTCAGATAGCATTGATCAGAGTTACGGAGACAAGGTCCAAGTTCCTTCTGCGGAAAAACGACATGCTTGGTGGCGTGTGTTTTATCGAGGAGCTGCTTTTCCTACATTGGCTAGGTTTCTATTACTTGATGTTGCCTCGAACTGGTTGGGTTGTTTTCCCTTCTCGGCACAGAAGTACGTTTATGATGTTTTCTTTGTTCGTGGATTGGTCACTGAGGTGCTGCAGATTTTGGTTCCTTTTCTCCAGCTGAGTTCGAGTGATGGTCTTGATGTTAATGCTGTCCTCTCTAATTCTGAAAGATTGCTTGTACTGTGCTTGCTTGAAAATAATGGGGCGCTCCAGTTGGCGAGAGAGTTTGGTGGTTCTTCTAAATTGAAAAGCGTTACAGATGTACAGATCAAGATGGATGTATCTATGGTGGCACAGATTGTTGCATCTATTCCTGATAAAGCAAGGATGAACTCCATGGCTTCATTGTCATCACATGTGTTCTTCAAGCAGATTGTTGTCCAACTACTCTCCCTGGCAGAAGAAAGAGAGACAATTTTGCTAGACAATGTAGACATGGATGAAATGGACAAAAATGGTGCACTGTTATTTGTAGGGGAAATGTTTTCTCGCATTTGTCGCCGTGGCTCTGCTGATCTCCTAACTAGTGAATTAATTCCAGAAGTTTTTAGGCTTGTCAACAGCCTCTTATCATCACATAATGATTCAGTTACTAATGAATTGTTTGAGTCAAAACCAGACACGGTATTTTGGTCGAGAATAATGGAAACCATCAGTGATCCTTATACCGTGGAAAGAATCTCTGAGCTGATTTTGCATAAGTTAGCTACTCAAGATGCTGATGATGTTCAAGCGTATTGGGTGTTGTGGTTGTTATTCCATCGAATTTTTAAGCTTCAGCCTTCTGTCAGGTCTATGTTTGTTGACAAATTCCTGCTATGGAAAGTATTCCCTATTAGCTGCCTGAAATGGATCCTTCAATTTGCTGTTCATGAATGCCCACCTGATACCTCATTATCAGGACATAATCACCCTGGGATTTTGAATACTGTCCAACGCCTGCTCTCAGTATGGTCTAAGAAAGAATTTGTGCAAACAGCACCTATTGAGCAACAAGTTTGCCTTTCTCTGGAGACAATGTCGAAGGAGGAATTGGATGGGATGAAGAATGCCATGCACTTTATCCTTCAAGGAGTTAGCTGTAGGCTGGAGAGTCCTAATTATTTAGTTAGAAAAATGGCTAGCAGTGTTGCTTTGGCATTGTCTAAAACTATTGATCCAAAGAATCCTCTGTACCTTGAGGATAGCTGCAGCGGGGAGACAATTGATTGGGAATTTGGATTCACTATCCCCAAGAAAGGGAATCTGGCTGCCTCAAATTGTGGAGGAAAAAGTGTTGAGGGGACAAAAATATCTACTGTGTCAGGTCCAGAGAGGGACTTTGATTCCCCTTCCAATAAAGAGAAAAGTATTAATGTAAAGGGCAGAAAGAAGTTATTGGACTTTAATGGGCTTGATCCAGATGAGATTATTGATCTAGCATCACTGAATCTTGAATCAGACGATAATCATGAGGATGTTGATGACAGTGCAAGTGAGAATTCATATTCTTCAAATGATTCATCTTTACAGCCGTATGATTTGTCAGATGATGACTCAGATTTGAAAAGAAAAATTTCACAGTTGGCTGATGTAGTTGCAGCTCTTAGAAAATCCGATGATGCCGATGGGGTGGAAAGGGCTATTGATGTAGCTGAAAAGCTCATAAGAGCATCCCCAGACGAACTAAAACATGCAGCAAGGGATCTGACCAGAACTCTTGTTCAGGTTCGTTGCTCTGATATAGCTTTAGAAGGTGCAGAAGAATCAACTGAAGACAAAAGACAAAGATCATTAGTTGCCTTAGCAGTCACCTGCCCATTTGAATCACTTGAGACACTAAACAAGCTTCTGTATTCACCTAATGTAGATATCAGTCAGCGCATTATGATACTAGATGTCATGACTGAAGCAGCTCAGGAGCTTGCTGAATCAAAAATTATGAAACCCAAACATCAGATTAGTTCCCTTATTTCAGTTGTTTCAGATACCCGACCTTGGTTCCTACCTAGCAGCACAGGGACTCCTGGAGCTGGTTCCTGGAAAGAGATCTCAGGTACTGGCTCTTTTTTGAATTGGTCAAATAGCTATGAGAGGGAACTTCCCACAAAACCCAATCAGATCAAGAAAGGGAAAACACGCCAGTGGAGCCTACAATCTCCCGCACAACAAAACCAGATGGAGTATTCTCATAATAAGTTTCCCATGTATGCTGCTGCATTCATGCTTCCTGCCATGGAGGGATATGATAAAAAAAGGCATGGTGTGGACTTGCTTGGCAGGGATTTTATTGTCTTGGGGAAACTCATTTATATGCTTGGGGTCTGTATGAAATCTGTAGCCATGCATCCAGAAGCTTCTGTACTGGCTCCTTCCCTCCTGAATATGTTAAGATCCAGAGAGGTATGCCATCACCGGGAAGCATATGTGAGAAGAGCCGTCCTTTTTGCAGCTGCATGTGTATTGGTTGCCCTTCATCCTACTTACATTTCATCTGCCTTACTCGAAGGAAATGTTGAAATTTCAACTGGCCTTGAATGGATTCGCACATGGGCACTTGATGTAGCCGAGTCGGACACAGATAAAGAATGCTATACGATGGCTATGACATGTATACAGCTCCATGTTGAGATGGCTCTTCAAACTTCCCGAGCATTGGAGTCAGTAAGAAATTCACTCAAGGCAGGTCCTGTTCTTCCTTCTGATGCATCCAAAGTGACCATTAAAATTCCCCACTTAAATGGGGATTAG
Predicted protein sequences of Glyma.04g193000
>Glyma.04g193000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g193000.1 locus=Glyma.04g193000 id=Glyma.04g193000.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g193000.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g193000.3 locus=Glyma.04g193000 id=Glyma.04g193000.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MEEGLGKRELEGEVVSRVAEVISAIKNAKHVDQVICALHSLATILFPFDPSLLSDSIDQSYGDKVQVPSAEKRHAWWRVFYRGAAFPTLARFLLLDVASNWLGCFPFSAQKYVYDVFFVRGLVTEVLQILVPFLQLSSSDGLDVNAVLSNSERLLVLCLLENNGALQLAREFGGSSKLKSVTDVQIKMDVSMVAQIVASIPDKARMNSMASLSSHVFFKQIVVQLLSLAEERETILLDNVDMDEMDKNGALLFVGEMFSRICRRGSADLLTSELIPEVFRLVNSLLSSHNDSVTNELFESKPDTVFWSRIMETISDPYTVERISELILHKLATQDADDVQAYWVLWLLFHRIFKLQPSVRSMFVDKFLLWKVFPISCLKWILQFAVHECPPDTSLSGHNHPGILNTVQRLLSVWSKKEFVQTAPIEQQVCLSLETMSKEELDGMKNAMHFILQGVSCRLESPNYLVRKMASSVALALSKTIDPKNPLYLEDSCSGETIDWEFGFTIPKKGNLAASNCGGKSVEGTKISTVSGPERDFDSPSNKEKSINVKGRKKLLDFNGLDPDEIIDLASLNLESDDNHEDVDDSASENSYSSNDSSLQPYDLSDDDSDLKRKISQLADVVAALRKSDDADGVERAIDVAEKLIRASPDELKHAARDLTRTLVQVRCSDIALEGAEESTEDKRQRSLVALAVTCPFESLETLNKLLYSPNVDISQRIMILDVMTEAAQELAESKIMKPKHQISSLISVVSDTRPWFLPSSTGTPGAGSWKEISGTGSFLNWSNSYERELPTKPNQIKKGKTRQWSLQSPAQQNQMEYSHNKFPMYAAAFMLPAMEGYDKKRHGVDLLGRDFIVLGKLIYMLGVCMKSVAMHPEASVLAPSLLNMLRSREVCHHREAYVRRAVLFAAACVLVALHPTYISSALLEGNVEISTGLEWIRTWALDVAESDTDKECYTMAMTCIQLHVEMALQTSRALESVRNSLKAGPVLPSDASKVTIKIPHLNGD*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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