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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.04g169300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm04
Start:41187178
stop:41191429
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.04g169300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G14260.2AT JGI N/AIEA
6.3.2.19EC JGI N/AIEA
GO:0008270GO-mf zinc ion binding JGI N/AIEA
PTHR23012PantherFam RING/FYVE/PHD ZINC FINGER DOMAIN-CONTAINING JGI N/AIEA
PF12428Pfam Protein of unknown function (DUF3675) JGI N/AIEA
PF12906Pfam RING-variant domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.04g169300 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma04g33580 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.04g169300
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>Glyma.04g169300.13 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g169300.13.p locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.13.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.14 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g169300.14.p locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.14.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.15 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g169300.15.p locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.15.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.17 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g169300.17.p locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.17.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.18 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g169300.18.p locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.18.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.04g169300
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>Glyma.04g169300.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g169300.11 locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.11.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g169300.12 locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.12.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g169300.13 locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.13.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.16.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g169300.16 locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.16.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g169300.18.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g169300.18 locus=Glyma.04g169300 id=Glyma.04g169300.18.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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