Report for Sequence Feature Glyma.04g093100
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm04
Start: 8230702
stop: 8251626
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.04g093100
Expression Patterns of Glyma.04g093100
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Paralogs of Glyma.04g093100
Paralog Evidence Comments
Glyma.06g094900 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.04g093100 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma04g09890 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.04g093100
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
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Coding sequences of Glyma.04g093100
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.04g093100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g093100.1.p locus=Glyma.04g093100 ID=Glyma.04g093100.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.04g093100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g093100.2.p locus=Glyma.04g093100 ID=Glyma.04g093100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.04g093100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g093100.3.p locus=Glyma.04g093100 ID=Glyma.04g093100.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.04g093100
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
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>Glyma.04g093100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g093100.4 locus=Glyma.04g093100 ID=Glyma.04g093100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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